• ANASAYFA
• ÜNİVERSİTE HAKKINDA
  • İsim - Adres
  • Genel Bilgi
  • Üniversite Yönetimi
  • Akademik Takvim
  • Derece Programları
  • Yabancı Dilde Eğitim Veren Birimler
  • Genel Kabul ve Kayıt Koşulları
  • Kredi Hareketliliği ve Önceki Öğrenmenin Tanınması
  • AKTS Kredilerinin Belirlenmesi
  • Akademik Danışmanlık
  • İletişim
• DERECE PROGRAMLARI
  • Doktora Programları
  • Yüksek Lisans Programları
  • Lisans Programları
  • Önlisans Programları
• ÖĞRENCİ İÇİN GENEL BİLGİLER
  • Yaşam Standardı
  • Barınma
  • Beslenme
  • Sağlık
  • Engelli İçin Olanaklar
  • Sigorta
  • Finansal Destekler
  • Öğrenci İşleri Daire Başkanlığı
  • Uluslararası Öğrenciler için Pratik Bilgiler
  • Dil Kursları
  • Staj Olanakları
  • Sportif, Sosyal ve Kültürel Faaliyetler
  • Öğrenci Toplulukları ve Kulüpler
  • İzmir-Türkiye Hakkında
• ULUSLARARASI İLİŞKİLER
  • Dış İlişkiler Koordinatörlüğü
  • Kayıt İşlemleri
  • Anlaşmalar
  • Koordinatörler
  • Belgeler
  • Yabancı Dilde Eğitim Veren Birimler
  • AKTS/DE Etiketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS MBG 5025 Biyoinformatiğe Giriş SEÇMELİ 2 2 0 9

Dersi Veren Birim

Moleküler Biyoloji ve Genetik Yüksek Lisans

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

DR.ÖĞR.ÜYESİ ATHANASIA PAVLOPOULOU

Dersi Alan Birimler

İngilizce Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Yüksek Lisans Moleküler Biyoloji ve Genetik Bütünleşik Doktora Moleküler Biyoloji ve Genetik Yüksek Lisans

Dersin Amacı

Bu ders, biyoenformatiğin ilkeleri ve işlemsel biyolojiyle beraber bunların uygulamalarına yönelik kavramları öğrencilere aktarmayı hedeflemektedir.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Biyoenformatiğin ve işlemsel biyolojinin ilkelerini açıklama 2   Belli başlı ana moleküler biyoloji veri bankalarını bilmek 3   Halka açık veri tabanlarından biyolojik bilgiye ulaşmak ve kullanmayı bilmek 4   Biyolojik sekans ve yüksek çıktılı veri analizinin ilkelerini bilmek 5   Moleküler biyolojideki sistem seviyesi biyoenformatik yaklaşımlarını temel düzeyde anlamak

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama 1 Biyoenformatik ve işlemsel biyolojinin temelleri 2 Biyolojik bilginin çeşitleri 3 Programlama dilleri ve veri tabanlarına giriş 4 Bibliyografik ve biyolojik sekans veri tabanları 5 Genom veri tabanları ve genom tarayıcıları 6 Protein ve protein yapısı veri tabanları 7 Sekans hizalama ve filogenetik ağaçlar - I 8 Ara sınav 9 Gen ekspresyonu ve regülasyonu 10 Yüksek çıktılı teknikler ve gen ekspresyonu veri tabanları 11 Biyolojik ontolojiler ve çevirim içi veri analiz araçları 12 Sistem biyolojisine giriş 13 Metabolik yolaklar ve etkileşim veri tabanları 14 Biyolojik veri entegrasyonun ilkeleri 15 Ödev sunumlar 16 Final sınavı

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Lesk, Arthur. Introduction to Bioinformatics. Fourth edition. Oxford University Press, 2013. ISBN: 9780199651566

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Power Point sunumla teorik ders anlatma ve öğrenci sunum ödevleri

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL 1 AS Arasinav 2 FN Final 3 BNS FinalSonuBaşarıNotu AS * 0.50 + FN * 0.50 4 BUT Bütünleme 5 BBN BütSonuBasarıNotu AS * 0.50 + BUT * 0.50 *** Bütünleme Sınavı Yapılmayan Birimlerde Bütünleme Kriteri Dikkate Alınmaz.

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Daha sonra ilan edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

Daha sonra ilan edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

athanasia.pavlopoulou@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Daha sonra ilan edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat) Ders Anlatımı 14 3 42 Uygulama 16 1 16 Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 15 3 45 Vize Sınavına Hazırlık 1 20 20 Final Sınavına Hazırlık 1 35 35 Ödev Hazırlama 10 5 50 Sunum Hazırlama 4 5 20 Final Sınavı 1 2 2 Vize Sınavı 1 2 2 TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 232

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK PK.1 PK.2 PK.3 PK.4 PK.5 PK.6 PK.7 PK.8 ÖK.1 5 ÖK.2 5 5 ÖK.3 5 ÖK.4 5 ÖK.5 5