• ANASAYFA
• ÜNİVERSİTE HAKKINDA
  • İsim - Adres
  • Genel Bilgi
  • Üniversite Yönetimi
  • Akademik Takvim
  • Derece Programları
  • Yabancı Dilde Eğitim Veren Birimler
  • Genel Kabul ve Kayıt Koşulları
  • Kredi Hareketliliği ve Önceki Öğrenmenin Tanınması
  • AKTS Kredilerinin Belirlenmesi
  • Akademik Danışmanlık
  • İletişim
• DERECE PROGRAMLARI
  • Doktora Programları
  • Yüksek Lisans Programları
  • Lisans Programları
  • Önlisans Programları
• ÖĞRENCİ İÇİN GENEL BİLGİLER
  • Yaşam Standardı
  • Barınma
  • Beslenme
  • Sağlık
  • Engelli İçin Olanaklar
  • Sigorta
  • Finansal Destekler
  • Öğrenci İşleri Daire Başkanlığı
  • Uluslararası Öğrenciler için Pratik Bilgiler
  • Dil Kursları
  • Staj Olanakları
  • Sportif, Sosyal ve Kültürel Faaliyetler
  • Öğrenci Toplulukları ve Kulüpler
  • İzmir-Türkiye Hakkında
• ULUSLARARASI İLİŞKİLER
  • Dış İlişkiler Koordinatörlüğü
  • Kayıt İşlemleri
  • Anlaşmalar
  • Koordinatörler
  • Belgeler
  • Yabancı Dilde Eğitim Veren Birimler
  • AKTS/DE Etiketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS MBG 6112 Biyoinformatik Veritabanları SEÇMELİ 3 0 0 12

Dersi Veren Birim

Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

DR.ÖĞR.ÜYESİ ATHANASIA PAVLOPOULOU

Dersi Alan Birimler

Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora Moleküler Biyoloji ve Genetik Bütünleşik Doktora İngilizce Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Doktora

Dersin Amacı

Kursun amacı; biyoinformatik veritabanlarındaki verilerin araştırılması, elde edilmesi ve yorumlanmasında kullanılan yöntemlerin öğrenciye sunulmasıdır.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Majör biyolojik veri depolarını tanımak. 2   Veritabanlarındaki biyolojik verilere erişim ve bu verileri elde etme yöntemlerinin öğrenilmesi. 3   İleri düzeyde veritabanı araması yapabilmek. 4   Farklı veritabanlarından elde edilen bilgiyi entegre edebilmek. 5   Veri-güdümlü hipotez oluşturulmasını desteklemek.

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama 1 Biyolojik Veritabanlarına Giriş-I 2 Biyolojik Veritabanlarına Giriş-II 3 Birincil Dizi Veritabanları 4 Genom Anotasyon Veritabanları 5 Gen İfadesi Veritabanları 6 Protein İmza Veritabanları 7 Protein-Protein Etkileşim Veritabanları 8 Ara Sınav 9 Yapısal Veritabanları 10 Post-translasyonal Modifikasyon Veritabanları 11 Filogenomiks Veritabanları 12 Ontoloji Veritabanları 13 Metabolik Yolak Veritabanları 14 Biyomedikal Veritabanları 15 Öğrenci Ödevleri 16 Final sınavı

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Ana kaynak: Nucleic Acids Research (Database issue), Online ISSN 1362-4962 - Print ISSN 0305-1048

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Powerpoint ile teorik anlatım ve literatür taraması / tartışması.

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL 1 AS Arasinav 2 FN Final 3 BNS FinalSonuBaşarıNotu AS * 0.50 + FN * 0.50 4 BUT Bütünleme 5 BBN BütSonuBasarıNotu AS * 0.50 + BUT * 0.50 *** Bütünleme Sınavı Yapılmayan Birimlerde Bütünleme Kriteri Dikkate Alınmaz.

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

athanasia.pavlopoulou@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat) Lectures 14 3 42 Preparation before/after weekly lectures 14 6 84 Preparation for Mid-term Exam 1 30 30 Preparation for Final Exam 1 37 37 Preparing Individual Assignments 12 5 60 Preparing Presentations 2 20 40 Final 1 3 3 Mid-term 1 4 4 TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 300

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK PK.1 PK.2 PK.3 PK.4 PK.5 PK.6 PK.7 PK.8 ÖK.1 3 ÖK.2 3 ÖK.3 3 ÖK.4 3 ÖK.5 3