DERS ADI

Dersi Veren Birim

Translasyonel Onkoloji Doktora

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

DOÇ.DR. GİZEM ÇALIBAŞI KOÇAL

Dersi Alan Birimler

Translasyonel Onkoloji Doktora
Translasyonel Onkoloji Bütünleşik Doktora

Dersin Amacı

Dinamik hücresel değişimleri eş zamanlı izlemeyi gerekli kılan yaklaşım, ancak insan genom analizinin tamamlanması sürecinde gelişen teknoloji ile klinik çalışmalara yansımıştır. Genom çalışmaları; hastalıkların moleküler temellerini anlamamızı sağlamıştır. Teknolojinin gelişmesi ile ortaya çıkan çoklu yüntemler ise hızla değişen hücresel fonksiyonları eş zamanlı olarak incelememize olanak sağlamıştır. Omik teknolojileri ile kanser gibi çok nedenli hastalık araştırmalarında, işlevsel ve düzenleyici yolakları ayrımlayan ve tanımlayan, doku ve biyolojik sıvılarda hastalığın nedeni olan moleküler yapıları belirleyen, hastalık evrelerini ya da hastalığa, kişiye ve ilaca özgü farklılıkları ortaya koyan çok değerli verileri üretmektedir. Ders Kapsamında;
Omik teknolojilerine giriş, kanseromik kavramı, organo spesifik kanseromikleri, kanserde genomik, kanserde proteomik, kanserde metabolamik, kanserde epigenomik, kanserde lipidomik ve glikobiyoloji, kanserde farmakogenomik, kanserde sistem biyolojisi , bilişimsel onkoloji, koregulomikler, Fonksiyonel genomikler, Fonksiyonel proteomikler, Translasyonel onkogenomiklerve kanseromiklerin klinikteki yeri , anlatılacaktır.

Dersin Öğrenme Kazanımları

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

An Omics Perspective on Cancer Research. Springer. 2010 Editors: Cho, William Chi-Sing (Ed.)
Molecular Biology of the Cell, 6th Edition. Ed. Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter. Garland Publishers.
Essential Cell Biology - 4th Edition Bruce Alberts, Dennis Bray, Karen Hopkin, Alexander D Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter Garland Publishers.
The Biology of Cancer, 2nd Edition, Robert A. Weinberg, Garland Publishers.
Molecular Biology of the Gene, 7th edition, James Watson, Alexander Gann, Tania Baker, Michael Levine, Stephan Bell, Richard Losick, Stephan Harrison Pearson Cold Spring harbor Laboratory Press.
Principles of Molecular Diagnostics and Personalized Cancer Medicine, Dongfeng Tan, henry Lynch, Wolters Kluwer, Lippincott Williams&Wilkins.
The Handbook of Biomarkers, Kewal Jain, Humana Press.
Translational and Experimental Clinical Research, Daniel Schuster, William Powers, Lippincott Williams&Wilkins.
Klinik Araştırmalar Kitabı 2014, Hamdi Akan, Hilal İlbars, Nurşah Çetinkaya, Bilimsel Tıp Yayınevi.
Designing Clinical Research 4th Edition, Steven R Cummings , Warren S Browner , Deborah G Grady , Thomas B Newman , Dr Stephen B Hulley, Lippincott Williams&Wilkins.
Cammarota, G., Ianiro, G., Ahern, A. et al. Gut microbiome, big data and machine learning to promote precision medicine for cancer. Nat Rev Gastroenterol Hepatol 17, 635 648 (2020). https://doi.org/10.1038/s41575-020-0327-3.
Epstein RJ, Lin FP. Cancer and the omics revolution. Aust Fam Physician. 2017;46(4):189-193. PMID: 28376570.
Gemma L D Adamo1, James T Widdop, Edward M Giles. The future is now Clinical and translational aspects of Omics technologies. Immunology and Cell Biology. 2020.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Teorik ders anlatımı, konuların ders içi etkinliklerle (sunum ve ödevlerle) pekiştirilmesi ve tartışılması

Değerlendirme Yöntemleri

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Sınav ile; 1.Omik teknolojilerini genel hatları ile kavrar, Kanserde omik biyomarker kullanımını bilir; 2. Genomik, proteomik, farnakogenomik epigenomik, lipidomik, glikobiyoloji yöntemlerini bilir; 5. Kanseromiklerin klinik kullanımı hakkında fikir sahibidir.
Ödev ve sunum ile; 3. Bilişimsel onkoloji, koregulomik yöntemler hakkında fikir sahibidir; 4.Sistem biyolojisi kavramını ifade eder; 6. Fonksiyonel genomik, fonksiyonel proteomik araştırmaları literatürde izler.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

gizem.calibasi@deu.edu.tr ; 0 232 412 58 35

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Randevu ile, Perşembe 14:00-15:00

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi