Dokuz Eylül Üniversitesi Ders Katoloğu / Bilgi Paketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Ders Türü	D	U	L	AKTS
KIM 6113	Enzimoloji: Rekombinant DNA Teknolojisi	SEÇMELİ	3	0	0	8

Dersi Veren Birim

Fen Bilimleri Enstitüsü

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

PROF.DR. MUSTAFA YAVUZ ERGÜN

Dersi Alan Birimler

Biyokimya Yüksek Lisans
Kimya Doktora
Kimya Bütünleşik Doktora
Biyokimya Doktora

Dersin Amacı

Bu ders kapsamında, tıpta ve endüstride öne çıkan rekombinant üretimde rol alan enzimlerin ayrıntılı olarak incelenmesi hedeflenmektedir.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1	Enzim ve nükleik asitlerin yapısı ve fonksiyonları hakkında fikir üretebilir,
2	Rekombinant DNA teknolojisinde enzimlerin kullanımlarını bilir,
3	Rekombinant DNA teknolojisinde kullanılan enzimlerin çeşitleri ve mekanizmalarını kavrar,
4	DNA ve RNA polimeraz enzimlerinin çeşitleri ve fonksiyonları hakkında bilgi sahibi olur,
5	ß-galaktosidaz, ß-laktamaz, kloramfenikol asetiltransferazlar ve lusiferazlar gibi belirteç ve haberci enzimler hakkında bilgi sahibi olur.

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta	Konular	Açıklama
1	Enzimler ve Nükleik Asitler-1 1.1. Enzimlerin yapı ve fonksiyonları
2	Enzimler ve Nükleik Asitler-2 2.1. Nükleik asitlerin yapı ve fonksiyonları
3	DNA ve RNA Ligazlar 3.1. Genel özellikleri 3.2. Escherichia coli DNA ligaz 3.3. T4 DNA ligaz 3.4. T4 RNA ligaz
4	Nükleazlar 4.1. DNA endonükleaz 4.2. DNA/RNA endonükleaz: Staphylcoccal nükleaz 4.3. RNA endonükleaz-Ribonükleaz A/H/T1 4.4. Tek zincir spesifik endonükleazlar
5	Ekzonükleazlar 5.1. 3'-5'- ekzonükleaz: E.coli ekzonükleaz I 5.2. Genel ekzonükleaz: Nükleaz Bal31
6	Restriksiyon Endonükleazlar 6.1. Genel özellikleri 6.2. Tip II restriksiyon endonükleaz 6.3. Tip II restriksiyon endonükleaz: EcoR1 6.4. Tip II restriksiyon endonükleaz: Fok1 6.5. Tip I restriksiyon endonükleaz 6.6. Tip III restriksiyon endonükleaz
7	Metil Transferazlar 7.1. Genel özellikleri 7.2. Tip II Metilazlar: EcoR1 metiltransferaz 7.3. Tip II olmayan metilazlar: Dam ve Dcm metiltransferazlar
8	Ara Sınav
9	Fosfatazlar ve Polinükleotid Kinaz 9.1. Bakteriyel alkali fosfatazlar 9.2. İntestinal alkali fosfotazlar 9.3. Polinükleotid kinaz:T4 polinükleotid kinaz
10	DNA Polimerazlar-1 10.1. Genel özellikleri 10.2. DNA-yönlendirilmiş DNA polimerazlar
11	DNA Polimerazlar-2 11.1. RNA-yönlendirilmiş DNA polimerazların (ters transkriptaz) genel özellikleri 11.2. AMV ters transkriptaz 11.3. MoLV ters transkriptaz 11.4. Temel deoksinükleotidiltransferaz
12	RNA Polimerazlar 12.1. DNA-yönlendirilmiş RNA polimerazların genel özellikleri 12.2. T7 RNA polimeraz 12.3. SP6 RNA polimeraz 12.4. T3 RNA polimeraz 12.5. DNA dan bağımsız RNA polimeraz
13	Marker/reporter enzimler 13.1. ß-galaktosidaz 13.2. ß-laktamaz 13.3. Kloramfenikol asetiltransferazlar 13.4. Lusiferazlar
14	Öğrenci sunumları

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Ana kaynak: Eun, H-M., 1996, Enzymology Primer for Recombinant DNA Technology, Academic Press: 683 p.
Yardımcı kaynaklar: Wong, D.W.S., 2006, The ABCs of Gene Cloning, Springer: 229 p.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

1. Sunum
2. İnteraktif anlatım
3. Soru cevap tekniği
4. Ödev verme

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO	KISA KOD	UZUN ADI	FORMUL
1	ODV	ÖDEV
2	ARS	ARASINAV
3	YSS	YIL SONU SINAVI
4	YSBN	YIL SONU BAŞARI NOTU	ODV * 0.30 + ARS * 0.30 + YSS * 0.40
5	BUT	BÜTÜNLEME
6	BUTBN	BÜTÜNLEME SONU BAŞARI NOTU	ODV * 0.30 + ARS * 0.30 + BUT * 0.40

*** Bütünleme Sınavı Yapılmayan Birimlerde Bütünleme Kriteri Dikkate Alınmaz.

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Sunumlarda verilen temel kavramları anlamlı öğrenmesi, kavramların birbirleri ile ilişkilendirmesi, sebep-sonuç ilişkilerini kurulabilmesi ve soru veya problemlere yönelik mevcut bilgilerini kullanarak yorum yapabilmesi ve fikir üretiminin değerlendirilmesi ara sınav, final sınavı, ödevlerle gerçekleştirilecektir.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

hulya.kayali@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Çarşamba 13.30 15.30

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler	Sayısı	Süresi (saat)	Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı	13	3	39
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar	13	3	39
Vize Sınavına Hazırlık	1	20	20
Final Sınavına Hazırlık	1	30	30
Ödev Hazırlama	2	20	40
Sunum Hazırlama	2	15	30
Final Sınavı	1	2	2
Vize Sınavı	1	2	2
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat)			202

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK	PK.1	PK.2	PK.3	PK.4	PK.6	PK.8	PK.9	PK.10	PK.11
ÖK.1	5	5	5	5	5	5	5
ÖK.2	5	5	5	5	5	5	5		5
ÖK.3	5	5	5	5	5	5	5
ÖK.4	5	5	5	5	5	5	5
ÖK.5		5	5	5	5	5	5	5	5

DERS ADI

DERECE PROGRAMLARI