Dokuz Eylül Üniversitesi Ders Katoloğu / Bilgi Paketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Ders Türü	D	U	L	AKTS
BYT 5027	Mikrobiyal Biyofilmler	SEÇMELİ	2	0	0	7

Dersi Veren Birim

Fen Bilimleri Enstitüsü

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

PROF.DR. ASLI KAÇAR

Dersi Alan Birimler

Biyoteknoloji Doktora
Biyoteknoloji Bütünleşik Doktora
Biyoteknoloji Yüksek Lisans

Dersin Amacı

Bu ders kapsamında öğrencilerin;
prokaryotların biyofilm yapılarının ve bu yapıların incelenmesinde kullanılan moleküler metotların öğrenilmesi,
biyofilm ile ilgili mekanizmaların kavranması ve biyofilmlerin kullanım alanları ile yol açtıkları sorunlar hakkında bilgi sahibi olunmasını sağlamaktır.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1	Biyofilmlerin gelişim stratejilerini kavramak
2	Biyofilm gelişimine neden olan mikroorganizma gruplarını öğrenmek
3	Kompleks biyofilm topluluklarının araştırılmasında kullanılan moleküler metotları ve kullanımlarını öğrenmek.
4	Biyofilmlerin ekosistemdeki fonksiyonları konusunda bilgi sahibi olmak
5	Biyofilm gelişimini önlemede uygulanan metotları kavramak
6	Biyosit ve metallerin sucul ortamlar üzerindeki olumsuz etkileri hakkında bilgi sahibi olmak
7	Çevre dostu yeni ürünler hakkında fikir sahibi olmak
8	Mikrobiyal biyofilmlerin biyoteknolojideki önemini anlamak

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta	Konular	Açıklama
1	Prokaryotik Çeşitlilik Kültüre Edilebilen ve Edilemeyen Bakteriler Arkeler
2	Mikrobiyal Biyofilm Oluşumu Büyüme, Yapısı ve Gelişim Stratejisi Adhezyonun Fiziko-Kimyasal Yapısı
3	Bakteriyal Biyofilmin Genetiği Quorum Sensing Mekanizması
4	Biyofilmlerin Ekosistemdeki Fonksiyonu Mikrobiyal Aktivitenin Yüzeyler Üzerine Etkisi Biyofilmlerdeki Bakteriyal Metabolizma
5	Biyofilmler Topluluklarının Araştırılmasındaki Moleküler Yöntemler PCR, Agaroz Jel Elektroforezi, DGGE, FISH
6	Biyofilm Modellemesi ve Proses Analizi Yapısal Bakış Açısı
7	Biyofouling Oluşumunda Biyofilm Gelişimi Örnekleme, Ekstraksiyon ve Moleküler Analiz
8	Ara sınav
9	Biyofilm İnhibitörlerinin Taranması İnhibitör Analizleri
10	Biyosit ve Metaller ile Biyofilm Matriksinin Yıkımı Metaller Biyositler
11	Enzimler ile Biyofilm Matriksinin Yıkımı Proteazlar, Glukozidazlar, Lipazlar
12	Sucul Sistemlerde Biyofilmlere Tutunan Mikroorganizmalar İndikatör ve Patojenik Bakteriler
13	Öğrenci Rapor Hazırlama ve Sunumu
14	Öğrenci Rapor Hazırlama ve Sunumu

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Donelli, G. 2014. Microbial Biofilms; methods and protocols. Springer New York Heidelberg Dordrecht London, 380p.
Madigan, T, M., Martinko, J. M., Parker, J. 2013. Brock Mikroorganizmaların Biyolojisi. Çeviri Editörü Cumhur Çökmüş. Palme Yayıncılık, Ankara, Turkey, 992p.
Melo, L. F., Bott, T. R., Fletcher, M. and Capdeville, B. 1992. Biofilms - Science and Technology. Springer-Science+Business Media, B.V, Alvor, Portugal, 708p.
Flemming, H. C., Wingender, J., Szewzyk, U. 2011. Biofilm Highlights, Springer Heidelberg Dordrecht London New York, 243 p.
Dürr, S., Thomason, J. C. 2009. Biofouling. A John Wiley & Sons, Ltd., Publication, United Kingdom, 429p.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

1. Bu ders sunum ve tartışma biçiminde öğretilir. Tüm ders öğrencileri hem derse devam etmek hem de tartışma oturumlarına katılmalıdır.
2. Dersin öğretilmesi yanında grup sunumları belirlenir ve öğrenciler grup içinde tartışmalara katılırlar

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO	KISA KOD	UZUN ADI	FORMUL
1	ARS	ARASINAV
2	SUN	SUNUM
3	YSS	YIL SONU SINAVI
4	YSBN	YIL SONU BAŞARI NOTU	ARS * 0.40 +SUN * 0.20 +YSS * 0.40
5	BUT	BÜTÜNLEME
6	BUTBN	BÜTÜNLEME SONU BAŞARI NOTU	ARS * 0.40 +SUN * 0.20 +BUT * 0.40

*** Bütünleme Sınavı Yapılmayan Birimlerde Bütünleme Kriteri Dikkate Alınmaz.

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Ara sınav (%40), Sunum (%20), Final sınavı (%40)

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

Deniz Bilimleri ve Teknolojisi Enstitüsü
Tel: 0090 232 2785565/127
Email: asli.kacar@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Cuma: 13.00-15.00

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler	Sayısı	Süresi (saat)	Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı	13	2	26
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar	13	4	52
Vize Sınavına Hazırlık	1	10	10
Final Sınavına Hazırlık	1	20	20
Ödev Hazırlama	1	25	25
Sunum Hazırlama	1	30	30
Final Sınavı	1	2	2
Vize Sınavı	1	2	2
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat)			167

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK	PK.1	PK.2	PK.3	PK.4	PK.5	PK.6
ÖK.1	4	3	5	3	3	3
ÖK.2	5	3	5	4	4	3
ÖK.3	5	5	3	5	3	4
ÖK.4	4	4	5	5	4	3
ÖK.5	5	4	5	4	4	3
ÖK.6	4	3	4	4	3	3
ÖK.7	4	3	5	4	4	3
ÖK.8	5	4	5	4	4	4

DERS ADI

DERECE PROGRAMLARI