Dokuz Eylül Üniversitesi Ders Katoloğu / Bilgi Paketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Ders Türü	D	U	L	AKTS
MPT 6009	Moleküler Patolojide Kullanılan Laboratuvar Yöntemleri	SEÇMELİ	3	2	0	12

Dersi Veren Birim

Moleküler Patoloji Doktora

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

DOÇ. DR. ANIL AYSAL AĞALAR

Dersi Alan Birimler

Moleküler Patoloji Doktora

Dersin Amacı

Doku saklanması, makroskopi, doku takibi, kesit, histokimyasal, immünhistokimyasa, DNA RNA izolasyonu, hibridizasyon, polimeraz zincir reaksiyonu sekanslama yöntemlerinin öğrenilmesi moleküler patolojide uygulama yöntem ve alanlarının tanımlanabilmesi.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1	Moleküler patolojik inceleme için hücre ve dokuların saklanma, fiksasyon özelliklerini tartışabilme ve uygulayabilme
2	Makroskopik değerlendirme ve örnekleme yöntemlerinin moleküler patolojik yöntemler ile ilişkisini tartışabilme ve uygulayabilme
3	Doku takibi, bloklama, kesit ve histokimyasal boyama yöntemleri ile moleküler patolojik yöntemler ile ilişkisini tartışabilme ve uygulayabilme
4	İmmünhistokimya uygulama prensiplerini tartışabilme ve uygulayabilme
5	DNA, RNA izolasyonu, polimeraz zincir reaksiyonu, jel elektroforezi, sekanslama yöntemlerini tartışabilme ve uygulayabilme
6	İn situ hibridizasyon çeşitlerini, uygulama yöntemlerini tartışabilme ve uygulayabilme
7	Mikroarray yöntemlerini ve uygulama alanlarını tartışabilme
8	Moleküler patoloji laboratuvarı çalışan ve tanı güvenliği konularını tartışabilme ve uygulayabilme

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta	Konular	Açıklama
1	Moleküler patoloji laboratuvarı kişisel ve hasta tanısı açısından güvenlik ölçütleri
2	Makroskopik değerlendirme ve örnekleme yöntemlerinin moleküler patolojik yöntemler ile ilişkisi
3	Doku takibi, bloklama ve kesit ile moleküler patolojik yöntemlerin ilişkisi
4	Histokimyasal yöntemler
5	İmmünhistokimyasal/İmmünflöresan yöntemlerin mekanizması
6	İmmünhistokimyasal/İmmünflöresan biyobelirteçlerin patolojik tanıda kullanım yöntemleri
7	RNA ve DNA izolasyonu
8	Polimeraz zincir reaksiyonu ve moleküler patolojide uygulamaları
9	Sekanslama yöntemleri I
10	Sekanslama yöntemleri II
11	Flöresan in situ hibridizasyon yöntemleri
12	Flöresan olmayan in situ hibridizasyon yöntemleri
13	Mikroarray (mikrodizin) yöntemleri
14	Arşivleme yöntemleri ve moleküler patolojik değerlendirme
15	Arşivleme yöntemleri ve moleküler patolojik değerlendirme
16	Doku takibi, bloklama ve kesit ile moleküler patolojik yöntemlerin ilişkisi
17	Dizileme ve biyoinformatiğe giriş

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Ana kaynak: Molecular Pathology (Türkçe) 2017 BartlettJMS, Shaaban A, Schmitt F.
Yardımcı kaynaklar: Robbins Pathological Basis of Diseases 2015 9th ed.
Diagnostic Pathology, Molecular Oncology Vasef MA, Auerbach A. 2016
PUBMED'den güncel yayınlar

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

1- Teorik sunum
2- Ödev hazırlama ve sunum
3- Laboratuvar uygulamaları

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO	KISA KOD	UZUN ADI	FORMUL
1	VZ	Arasınav
2	ODV	Ödev
3	LAB	Lab/Uygulama
4	FN	Final
5	BNS	Başarı	VZ * 0.20 + ODV * 0.10 + LAB* 0.20 + FN*0.50
6	BUT	Bütünleme
7	BBN	BütSonuBaşarıNotu	VZ* 0.20 + ODV * 0.10 + LAB* 0.20 + BUT*0.50

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Dersin öğrenme konuları klasik sınav, ödev/sunum ile değerlendirilecektir.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

Doç. Dr. Anıl Ağalar 00902324123401, 00902324123416
anil.aysal@deu.edu.tr
anilaysalagalar@gmail.com

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Cuma 11:00-12:00

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler	Sayısı	Süresi (saat)	Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı	15	3	45
Uygulama	15	2	30
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar	15	4	60
Vize Sınavına Hazırlık	1	24	24
Final Sınavına Hazırlık	1	60	60
Ödev Hazırlama	1	45	45
Sunum Hazırlama	1	30	30
Final Sınavı	1	3	3
Vize Sınavı	1	3	3
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat)			300

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK	PK.1	PK.2	PK.3	PK.4	PK.5	PK.10
ÖK.1	5	5	5	5		4
ÖK.2	5	5	5	5		4
ÖK.3	5	5	5	5		4
ÖK.4	5	5	5	5	4	4
ÖK.5	5	5	5	5	4	4
ÖK.6	5	5	5	5	4	4
ÖK.7	5	5	5	5		4
ÖK.8	5	5	5	5		4

DERS ADI

DERECE PROGRAMLARI