DERS ADI

: Tanıdan Tedaviye Organoidlere Giriş

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
TRO 5019 Tanıdan Tedaviye Organoidlere Giriş SEÇMELİ 2 0 0 6

Dersi Veren Birim

Translasyonel Onkoloji Yüksek Lisans

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

DOÇ. DR. GİZEM ÇALIBAŞI KOÇAL

Dersi Alan Birimler

Translasyonel Onkoloji Yüksek Lisans

Dersin Amacı

Organoidler ile in vitro 3D kültür teknolojilerinde gerçekleşen ilerlemeler, ileri düzeyde araştırmaların yapılabileceği kanser modellerinin geliştirilmesi için yeni yollar açmıştır. Bu tür klinik öncesi modeller, kanserli hastalar için temel kanser araştırmalarının yeni tedavi rejimlerine daha verimli bir şekilde çevrilmesi için gereklidir. Normal doku organoidleri, embriyonik ve yetişkin kök hücrelerden büyütülebilir ve türetildikleri organların temel özelliklerini barındırarak kendi kendini organize etme kapasiteleri gösterebilir. Organoidlerin gen düzenleme teknolojileri ile genetik modifikasyonu, fizyolojik ortama yaklaşan bir ortamda hastalık modellemesine izin verir. Tüm bunlara ek olarak, hastadan türetilen tümör dokularından da yüksek verimlilikle organoidler büyütülebilir. Böylece organoid teknolojisi ile gerçekleşen ilerlemeler, potansiyel olarak hastaya özel ilaç testi ve bireyselleştirilmiş tedavi rejimlerinin geliştirilmesine olanak tanır.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Organoidlerle hastalık modellemeleri hakkında bilgi sahibi olunur.
2   Organoidlerle kanser modellemesi hakkında bilgi sahibi olunur.
3   Organoidlerle yapılabilen araştırma yöntemleri hakkında bilgi sahibi olunur.
4   Organoidler ile kişiye özel tıp uygulamaları hakkında bilgi sahibi olunur.
5   Mikroakışkan organoid-on-a-chip teknolojileri hakkında bilgi sahibi olunur
6   Bilimde teknolojik gelişmeleri takip edebilmeyi öğrenir.

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Organoidler: temel araştırmalarda ve tıpta değişim
2 Organoid kültür teknikleri
3 Bağırsak organoidlerinin kültürü
4 Organoidlerle hastalık modellemesi
5 Organoidlerle kanser modellemesi
6 Anti-kanser ilaç taramasında organoidler ve gen-ilaç ilişkilendirmeleri
7 Hastadan türetilen organoid ve gen düzenlemenin kombinasyonu
8 Organoid kültürler tümör mikroçevresinin önemini ortaya koymaktadır.
9 Anjiyogenezi araştırmaları için organoid Sistemler
10 Organoidler ile kişiye özel ilaç uygulamaları
11 Mikroakışkan organoid-on-chip (Mikroakışkan mühendisliği organoid kültür sistemi)
12 Organoid biyobankacılığı
13 Organoid sistemlerinde sınırlılıklar
14 Makaleler eşliğinde tartışma
15 Makaleler eşliğinde tartışma

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Francies H.E., Barthorpe A., McLaren-Douglas A., Barendt W.J., Garnett M.J. (2016) Drug Sensitivity Assays of Human Cancer Organoid Cultures. In: Turksen K. (eds) Organoids. Methods in Molecular Biology, vol 1576. Humana, New York, NY.
Tumor Organoids. edited by Shay Soker, Aleksander Skarda. Humana Press, 2017.
LeSavage, B.L., Suhar, R.A., Broguiere, N. et al. Next-generation cancer organoids. Nat. Mater. (2021).
Drost, J., Clevers, H. Organoids in cancer research. Nat Rev Cancer 18, 407 418 (2018).
Fan, H., Demirci, U. & Chen, P. Emerging organoid models: leaping forward in cancer research. J Hematol Oncol 12, 142 (2019).
Lo YH, Karlsson K, Kuo CJ. Applications of Organoids for Cancer Biology and Precision Medicine. Nat Cancer. 2020;1(8):761-773.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Teorik ders anlatımı, konuların ders içi etkinliklerle (sunum ve ödevlerle) pekiştirilmesi ve tartışılması

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL
1 ODV Ödev/Sunum
2 FN Final
3 BNS Başarı ODV * 0.50+ FN* 0.50
4 BUT Bütünleme Notu
5 BBN Bütünleme Sonu Başarı Notu ODV * 0.50+ BUT* 0.50


Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Ödev ve Sunum ile değerlendirme (Öğrenim Çıktısı 2,3,6)
Sınavla değerlendirme (Öğrenim Çıktısı 1,2,3,4,5,6)

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

gizem.calibasi@deu.edu.tr ; 0 232 412 58 35

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Salı 14:00-15:00

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 15 2 30
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 15 2 30
Final Sınavına Hazırlık 1 25 25
Ödev Hazırlama 5 5 25
Sunum Hazırlama 5 8 40
Final Sınavı 1 1 1
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 151

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6PK.7PK.8PK.9PK.10PK.11PK.12
ÖK.155555
ÖK.255555
ÖK.355555
ÖK.455555
ÖK.555555
ÖK.65555