Dokuz Eylül Üniversitesi Ders Katoloğu / Bilgi Paketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Ders Türü	D	U	L	AKTS
BİO 6063	Enzimoloji	SEÇMELİ	2	0	0	6

Dersi Veren Birim

Biyokimya Doktora

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

PROF. DR. SEZER UYSAL

Dersi Alan Birimler

Biyokimya Doktora

Dersin Amacı

Bu ders kapsamında aşağıdaki konu ve kavramların ileri düzeyde irdelenmesi amaçlanmaktadır:
Enzimlerle ilgili tarihsel gelişim, enzimlerin adlandırılmaları ve sınıflandırılmaları, sübstrat spesifisitesi kavramı ve mekanizmaları, koenzimler, türleri, ilgili tepkimeler ve metabolizmadaki rolleri, enzimatik aktivitenin kontrolü, enzimatik raksiyonların hızları, kimyasal kinetik, enzim kinetiği, inhibisyon ve türleri, pH nın etkileri, bisübstratlı reaksiyonlar, Michaelis-Menten denkleminin türevlendirilmesi; enzim katalizi mekanizmaları,lizozim örneğinde enzimatik reaksiyon mekanizması, serin proteazlar, ilaç modelleme, farmakolojiye giriş; klinik enzimolojiye giriş

Dersin Öğrenme Kazanımları

1	Enzim tanımlanması, sınıflandırılması, enzimlerin özellikleri enzim katalizi enzim kataliz mekanizmları ile ilgili ileri düzeyde bilgi edinmek
2	Temel enzimoloji bilgilerini değişik durumlara uyarlayabilmek
3	Enzimatik kataliz türlerini kavramak ve değişik örneklerle irdelemek
4	İlaç modelleme ile ilgili olarak enzimlerin kullanımındaki temel kavramlar edinmek- örneklerle modelleme yapabilmek
5	Enzim inhibisyon türlerinden yola çıkarak organizmadaki olayları irdeleyebilmek ve dışarıdan enzim ile tedavinin temel ilkelerini değişik örnekleri kıyaslayarak irdeleyebilmek
6	Klinik enzimolojide kullanılan enzimlerim kullanım amaçlarını kavramak
7	Edindiği bilgileri kullanarak, araştırarak enzimoloji konusunda bir sunum yapabilme

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta	Konular	Açıklama
1	Enzimolojiye Giriş-Temel Kavramlar, Enzimlerin adlandırılmaları ve enzimatik reaksiyonların sınıflandırılması, Kimyasal Kinetik-Enzim Kinetiği, Enzim İnhibisyonu ve Türleri, Enzimlerin Klinik laboratuarda Kullanımları, Enzimlerin Lokalizasyonları- Enzimlerde Alternatif Kullanım Alanları; Enzimlerin Tedavide ve Analitik Reaktif olarak kullanımları
2	(Biyo)moleküler yapıların 3D görüntülenmesinde bilgisayar tabanlı uygulamalar Bir enzim molekül modelinin veritabanlarından elde edilişi Jmol kullanarak enzim yapısını görüntüleme uygulamalarının yapılması Program kurulumu ve ara yüzü kullanılması (Temel seviye, Orta seviye-devam ) Komut dili (scriptting language) kullanılması (Orta seviye, İleri seviye)	Jmol kullanarak enzim yapısını görüntüleme uygulamalarının yapılması (devam), Simulasyon aracılı enzim kinetiği uygulamalarının yapılması Michelis Menten Kinetiği Enzim inhibisyonu kinetiği, Enzim kooperativitesi kinetiği, ÖDEV SUNUMLARI- GENEL TARTIŞMA

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

1. Harper s Illustrated Biochemistry 28th Edition, 2009 , Murray, Bender, Rotham, Kennelly
Rodwell and Weil.McGraw Hill International Edition.pp51-83.
Yardımcı kaynaklar:
2. Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations. Seventh Edition 2011, Thomas M. Devlin. John-Wiley& Sons Inc. Publication, USA , pp. 377-418.
3. Textbook of Clinical Chemistry and Molecular Diagnostics. Eds: Burtis CA, Ashwood ER, Bruns DE, 4th edition, 2006, Elsevier Saunders, St Louis.
4. Newsholme, EA and Leech, TR. Functional Biochemistry in Health and Disease 2010, WILEY-BLACKWELL, Oxford, pp 35-68.
5. Bisswanger, H. Practical Enzymology 2011, WILEY-BLACKWELL.
6. Tietz: Klinik Kimyada Temel İlkeler Beşinci Baskı. (Editörler: Burtis & Ashwood) (Çeviri Editörü: Diler Aslan).PALMY yayıncılık, pp.352-387.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Sunum, küçük grup oturumu, problem çözümü, panel tartışması, proje ödevi

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO	KISA KOD	UZUN ADI	FORMUL
1	VZ	Arasınav
2	ODV	Ödev/Sunum
3	DKL	DerseKatılım
4	FN	Final
5	BNS	Başarı	VZ * 0.30 + ODV* 0.20 + DKL* 0.10 + FN*0.40
6	BUT	Bütünleme
7	BBN	BütSonuBaşarıNotu	VZ * 0.30 + ODV* 0.20 + DKL* 0.10 + BUT*0.40

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Kavrama, öğrenme, analiz etme, sentez etme, karşılaştırma, değerlendirme, uygulama

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

Derse devam şarttır. Derse aktif katılım beklenmektedir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

Emel Altekin .Telefon 4124412

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Pazartesi 12.30-13:30

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler	Sayısı	Süresi (saat)	Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı	10	2	20
Uygulama	10	1	10
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar	10	4	40
Final Sınavına Hazırlık	1	40	40
Vize Sınavına Hazırlık	1	20	20
Sunum Hazırlama	1	15	15
Final Sınavı	1	3	3
Vize Sınavı	1	2	2
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat)			150

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK	PK.1	PK.2	PK.3	PK.4	PK.5	PK.6	PK.7	PK.8	PK.10	PK.11	PK.13
ÖK.1	5	4
ÖK.2				5	4	4
ÖK.3				5	4	4
ÖK.4				5	4	4
ÖK.5							5
ÖK.6	5	5	5
ÖK.7								4	5	5	5

DERS ADI

DERECE PROGRAMLARI