DERS ADI

: Hesaplamalı Biyolojiye Giriş

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
BST 5007 Hesaplamalı Biyolojiye Giriş SEÇMELİ 3 0 0 9

Dersi Veren Birim

Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Yüksek Lisans

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

DR.ÖĞR.ÜYESİ ATHANASIA PAVLOPOULOU

Dersi Alan Birimler

Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Yüksek Lisans

Dersin Amacı

Öğrencilere biyoinformatik ve hesaplamalı biyoloji kavramlarını anlamalarını sağlamak.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   1. Biyoinformatik ve hesaplamalı biyoloji kavramlarını tanımlamak
2   2. Başlıca moleküler biyoloji veri depolarına aşina olmak
3   3. Biyolojik verilere kamuya açık veritabanlarından nasıl erişileceğini ve alınabileceğini anlamak
4   4. Biyolojik dizi veri analizinin prensiplerini anlamak
5   5. Moleküler biyolojide sistem düzeyinde biyoinformatik yaklaşımlarını anlamak

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Giriş
2 Biyolojik Veritabanları I
3 Biyolojik Veritabanları II
4 İkili sıra hizalaması
5 Çoklu sıra hizalaması
6 Sekans Motiflerinin Bulunması
7 Sekans Veritabanlarında Benzerlik Araması I
8 ARASINAV
9 Sekans Veritabanlarında Benzerlik Araması II
10 Protein Yapı Analizi
11 Protein Yapısı Tahmini
12 Filogenetik Analızı I
13 Filogenetik Analızı II
14 Gen Regülasyonunun Biyoenformatik Analizi I
15 Gen Regülasyonunun Biyoenformatik Analizi II
16 FINAL

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Ana kaynak: Bioinformatics and Functional Genomics, by Jonathan Pevsner October. Wiley-Blackwell, 2015.
ISBN: 978-1-118-58178-0

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Sözlü sunum, literatür tarama, tartışma ve uygulamalı alıştırmalar.

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL
1 ODV Ödev/Dkat.
2 VZ Vize
3 FN Final
4 BNS FinalSonuBaşarıNotu ODV * 0.30 + VZ * 0.30 + FN * 0.40
5 BUT Bütünleme
6 BBN BütSonuBasarıNotu ODV * 0.30 + VZ * 0.30 + BUT * 0.40


*** Bütünleme Sınavı Yapılmayan Birimlerde Bütünleme Kriteri Dikkate Alınmaz.

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

athanasia.pavlopoulou@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 14 3 42
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 14 5 70
Vize Sınavına Hazırlık 1 15 15
Final Sınavına Hazırlık 1 20 20
Ödev Hazırlama 1 50 50
Sunum Hazırlama 1 15 15
Final Sınavı 1 10 10
Vize Sınavı 1 5 5
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 227

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6PK.7PK.8
ÖK.15
ÖK.2555
ÖK.35555
ÖK.45555
ÖK.55