DERS ADI

: Moleküler Biyofizik

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
BST 6008 Moleküler Biyofizik SEÇMELİ 3 0 0 12

Dersi Veren Birim

Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Doktora

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

DR.ÖĞR.ÜYESİ EZGİ KARACA EREK

Dersi Alan Birimler

Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Doktora

Dersin Amacı

Biyomoleküler maddelerin davranışlarının, fizik yoluyla nasıl anlaşılabileceği konusunda kapsamlı bir bilgiye sahip olmak.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Biyolojik süreçleri anlamak için gerekli olan temel fizik ve matematik metotlarını öğrenme
2   Kompleks biyolojik olguları incelemek için fizik ve matematiğin nasıl birleştirileceğini öğrenme
3   Biyofizik deney tekniklerini öğrenme
4   Biyofiziksel simülasyonlarda kodlamayı öğrenme
5   Kompleks biyolojik problemleri çözmek için deneysel ve hesaplamalı tekniklerin nasıl birleştirileceğini öğrenme

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Yapısal Metotlar - NMR
2 Yapısal Metotlar - X-ray
3 Yapısal Metotlar - EM
4 Moleküler ve mekanik kuvvetler
5 Makromoleküllerin konformasyonları
6 Spektroskopik Teknikler
7 Moleküler tanıma ve ligand bağlanması
8 Difüzyon ve Brownian hareketler
9 Bağlanma afinitesi deneyleri
10 Fizik temelli moleküler dinamik simülasyonları
11 Biyolojik membranlar
12 Moleküllerin elektriksel özellikleri ve iyon kanalları
13 Dinamik saçılma ve SAXS
14 Hidrodinamik bazlı deney metotları
15 Mikroskopi bazlı deney metotları
16 FINAL SINAVI

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

P. Nelson, "Biological Physics" WH Freeman, 2004
K.A. Dill et al, "Molecular Driving Forces" Garland Science, 2003
M. B. Jackson: "Molecular and Cellular Biophysics" Cambridge U. Press, 2006
A.E. Leach, Molecular Modelling: Principles and Applications, 2nd edition
C. Brandon & J. Tooze, Introduction to Protein Structure, 2nd edition

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Powerpoint sunumları, literatür taraması / tartışılması, bilgisayar uygulamaları.

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL
1 ODV Ödev/Dkat.
2 VZ Vize
3 FN Final
4 BNS FinalSonuBaşarıNotu ODV * 0.30 + VZ * 0.30 + FN * 0.40
5 BUT Bütünleme
6 BBN BütSonuBasarıNotu ODV * 0.30 + VZ * 0.30 + BUT * 0.40


*** Bütünleme Sınavı Yapılmayan Birimlerde Bütünleme Kriteri Dikkate Alınmaz.

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

ezgi.karaca@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 14 3 42
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 14 8 112
Vize Sınavına Hazırlık 1 20 20
Final Sınavına Hazırlık 1 25 25
Ödev Hazırlama 2 35 70
Sunum Hazırlama 1 30 30
Vize Sınavı 1 5 5
Final Sınavı 1 5 5
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 309

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6PK.7PK.8
ÖK.1555
ÖK.255555
ÖK.355555
ÖK.45555
ÖK.55555