DERS ADI

: Biyolojik Verilerin Entegrasyonu

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
BST 6002 Biyolojik Verilerin Entegrasyonu SEÇMELİ 3 0 0 12

Dersi Veren Birim

Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Doktora

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

DR.ÖĞR.ÜYESİ ATHANASIA PAVLOPOULOU

Dersi Alan Birimler

Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Doktora

Dersin Amacı

Biyolojik verileri bütünleştirmek ve işlemek için hesaplamalı yöntemler uygulamak.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   1. Biyolojik veri entegrasyon yöntemlerine giriş sağlamak
2   2. Biyolojik veritabanlarına aşina olmak
3   3. Biyolojik verilerin analizinde ağ tabanlı yöntemleri uygulamak
4   4. Genomik, transkriptomik ve proteomik verilerin işlenmesi ve yorumlanması
5   5. Türler arasında korunmuş genleri tanımlamak
6   6. Biyolojik dizilerin yapı ve işlevlerini tahmin etmek
7   7. İnsan hastalıkları için potansiyel ilaçları tanımlamak
8   8. Biyolojik verilerin ve meta verilerin analizinde istatistiksel yöntemleri uygulamak
9   9. Araştırma bulgularını sunmak

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Giriş
2 Biyolojik veritabanları
3 Biyolojik Ağlar I
4 Biyolojik Ağlar II
5 Gen Ontolojisi çıkarımı
6 Gen fonksiyon tahmini
7 Gen önceliği
8 ARASINAV
9 Gen ekspresyonu veri analizi
10 Karşılaştırmalı genomik
11 Proteomik veri analizi
12 Protein fonksiyon tahmini
13 İlaç geri dönüşümü
14 İstatistiksel analiz I
15 İstatistiksel analiz II
16 FİNAL SINAVI

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

İlan Edilecektir.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Sözlü sunum, literatür tarama, tartışma ve uygulamalı alıştırmalar.

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL
1 ODV Ödev/Dkat.
2 VZ Vize
3 FN Final
4 BNS FinalSonuBaşarıNotu ODV * 0.30 + VZ * 0.30 + FN * 0.40
5 BUT Bütünleme
6 BBN BütSonuBasarıNotu ODV * 0.30 + VZ * 0.30 + BUT * 0.40


*** Bütünleme Sınavı Yapılmayan Birimlerde Bütünleme Kriteri Dikkate Alınmaz.

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

athanasia.pavlopoulou@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 14 3 42
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 14 8 112
Vize Sınavına Hazırlık 1 20 20
Final Sınavına Hazırlık 1 25 25
Ödev Hazırlama 2 30 60
Sunum Hazırlama 1 35 35
Vize Sınavı 1 5 5
Final Sınavı 1 5 5
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 304

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6PK.7PK.8
ÖK.15555
ÖK.2555
ÖK.3555
ÖK.4555
ÖK.5555
ÖK.6555
ÖK.7555
ÖK.8555
ÖK.955