DERS ADI

: Translasyonel Araştırma Yöntemleri I

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
TRO 6009 Translasyonel Araştırma Yöntemleri I SEÇMELİ 1 2 0 10

Dersi Veren Birim

Translasyonel Onkoloji Doktora

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

DOÇ.DR. GİZEM ÇALIBAŞI KOÇAL

Dersi Alan Birimler

Translasyonel Onkoloji Doktora
Translasyonel Onkoloji Bütünleşik Doktora

Dersin Amacı

Kanserde uygulamalı ve temel araştırmalar konusunda translasyonel bir bakış açısıyla (yataktan laboratuara, laboratuardan yatağa) , multidisipliner araştırma yöntemlerini, öğrencilerin eğitim süresince aldıkları temel ve klinik onkoloji bilgileriyle ilişkilendirilerek yorumlanmasını sağlamaktır. Kanser Araştırma Laboratuvarları ve ARGE Laboratuarları Alt Yapısı, Kanser Araştırmalarında Hazırlık Aşamaları (örnek hazırlığı, saflaştırma, spektral teknikler, immun teknikler,elektroforez, blotlamalar, hibridizasyon, mikroskopi) Kanser Araştırmalarına hücre ve organel izolasyonu Kanser Araştırmalarında Makromolekül izolasyonları (DNA, RNA, Protein)
Kanser Araştırmalarında PCR , Kanser Araştırmalarında epigenetik yöntemler, Kanser araştırmalarında özel boyama ve görüntüleme teknikleri Kanser Araştırmalarında hücre kültürü (temel teknikler, transformasyon, hücresel modülasyonlar, kültürü (hücresel tedaviler, kök hücre vb,sitotoksisite, apoptoz, metastaz, invazyon çalışmaları)

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   İleri kanser araştırmalarına yönelik ileri moleküler yöntemlerini uygular.
2   Bireysel farklılıkları ayırt etmeye yönelik yöntemleri bilir.
3   Kanser araştırmalarında uygulanan yöntemleri literatürden izler
4   Kanserin sağaltım teknolojilerini bilir.
5   Kanserin moleküler düzeyde tanımlanmasını sağlayan yöntemleri bilir.
6   Kanser araştırmaları ile ilgili bir laboratuvar kurabilir.

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Kanser araştırma ve ARGE laboratuarları alt yapısı
2 Kanser araştırmalarında hazırlık aşamaları (örnek hazırlığı, saflaştırma, spektral teknikler, immun teknikler,elektroforez, blotlamalar, hibridizasyon, mikroskopi)
3 Kanser araştırmalarına hücre ve organel izolasyonu
4 Kanser araştırmalarında makromolekül izolasyonları (DNA, RNA, Protein)
5 Kanser araştırmalarında PCR
6 Kanser araştırmalarında yeni nesil genetik analizler
7 Kanser araştırmalarında transkript düzeyinde ekspresyon analizleri
8 Kanser araştırmalarında protein düzeyinde ekspresyon analizleri
9 Kanser araştırmalarında epigenetik yöntemler
10 Kanser araştırmalarında in silico yöntemler
11 Kanser araştırmalarında özel boyama teknikleri
12 Kanser araştırmalarında özel görüntüleme teknikleri
13 Kanser araştırmalarında hücre kültürü
14 Kanser araştırmalarında deney hayvanı çalışmaları
15 Kanser araştırmalarında biyobankalama

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Ruiz-Garcia, Erika, Astudillo-de la Vega, H. Translational Research and Onco-Omics Applications in the Era of Cancer Personal Genomics. 2019 Springer.
Molecular Biology of the Cell, 6th Edition. Ed. Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter. Garland Publishers
Essential Cell Biology - 4th Edition Bruce Alberts, Dennis Bray, Karen Hopkin, Alexander D Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter Garland Publishers
The Biology of Cancer, 2nd Edition, Robert A. Weinberg, Garland Publishers
Molecular Biology of the Gene, 7th edition, James Watson, Alexander Gann, Tania Baker, Michael Levine, Stephan Bell, Richard Losick, Stephan Harrison Pearson Cold Spring harbor Laboratory Press.
Principles of Molecular Diagnostics and Personalized Cancer Medicine, Dongfeng Tan, henry Lynch, Wolters Kluwer, Lippincott Williams&Wilkins.
The Handbook of Biomarkers, Kewal Jain, Humana Press
Translational and Experimental Clinical Research, Daniel Schuster, William Powers, Lippincott Williams&Wilkins.
Klinik Araştırmalar Kitabı 2014, Hamdi Akan, Hilal İlbars, Nurşah Çetinkaya, Bilimsel Tıp Yayınevi
Designing Clinical Research 4th Edition, Steven R Cummings , Warren S Browner , Deborah G Grady , Thomas B Newman , Dr Stephen B Hulley, Lippincott Williams&Wilkins.
Journals
Clinical & translational oncology (1699-048X) in Springer
Translational oncology (1944-7124) in PubMed

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Teorik ders anlatımı, konuların ders içi etkinliklerle (sunum ve ödevlerle) pekiştirilmesi ve tartışılması

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL
1 PO Performans/Ödev
2 FN Final
3 BNS Başarı PO * 0.40 +FN*0.60
4 BUT Bütünleme Notu
5 BBN Bütünleme Sonu Başarı Notu PO * 0.40 + BUT*0.60


*** Bütünleme Sınavı Yapılmayan Birimlerde Bütünleme Kriteri Dikkate Alınmaz.

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Sınav değerlendirmesi ile öğrenme kazanımlarından ÖK1, ÖK2, ÖK4 ve ÖK5'i açıkça tanımlayabilir.
Ödev, sunum hazırlayarak ve sınavla ÖK3 ve ÖK6'yı tanıyıp yorumlayabilir.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

gizem.calibasi@deu.edu.tr ; 0 232 412 58 01

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Cuma 11:00-12:00

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 15 3 45
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 15 13 195
Final Sınavı 1 1 1
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 241

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6PK.7PK.8PK.9PK.10PK.11PK.12
ÖK.155
ÖK.255
ÖK.355
ÖK.455
ÖK.555
ÖK.655