Dokuz Eylül Üniversitesi Ders Katoloğu / Bilgi Paketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Ders Türü	D	U	L	AKTS
ERS 6023	Temel Laboratuvar İlkeleri ve Yöntemleri I	SEÇMELİ	1	4	0	9

Dersi Veren Birim

Biyokimya Doktora

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

PROF.DR. GÜLGÜN OKTAY

Dersi Alan Birimler

Biyokimya Doktora

Dersin Amacı

Bu dersin amacı temel laboratuvar ilkelerini ve genel laboratuvar prosedürlerini öğretmektir. Ayrıca ayırma tekniklerine giriş yapmaktır. Ders, teorik ve uygulama bölümlerinden oluşmaktadır. Ders, bir mini proje kapsamında verilmektedir. Teorik bölümde ilgili dersin temel prensipleri ve ilgili yöntemle ilgili prosedürler verilmektedir. Dersin uygulama bölümünde ise sıçan dokularından (beyin, karaciğer, kalp, böbrek, akciğer) tartım, homojenizasyon ve santrifügasyon ile süpernatant elde edilmektedir. Elde edilen süpernatant, tüm yarıyıl boyunca öğrenilecek yöntemlerde kullanılmaktadır. Bu süpernatanlarda öncelikle protein tayin yöntemleri-Biüret, Modifiye Lowry ve Bradford kullanılarak protein miktarları belirlenir. Daha sonra spektrofotometre kullanılarak Glutatyon-S-Transferaz ölçümü , Spektroflorometre ile MDA ölçümü, Sıvı Kromatografi ( HPLC) yöntemi ile MDA ölçümü yapılır. SDS-PAGE (sodyum dodesil sülfat- poliakrilamid jel elektroforezi) ile bilinmeyen protein bantlarının MW molekül ağırlıkları hesaplanır. Öğrenciler, yarıyıl bitiminde elde ettikleri sonuçları içeren sunum yaparlar.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1	Biyokimyanın temel alanlarından olan temel kimya ve temel biyokimya konusunda bilgi edinmiş olmalıdır.
2	Biyokimyanın temel alanlarından biri olan temel kimya ve temel biyokimya uygulamaları ile ilgili kuramsal bilgiyi kavramış olmalıdır.
3	Temel laboratuar cihaz ve yöntemlerinin ilkelerini kavramış olmalıdır.
4	Temel laboratuar yöntemlerinin temel kavramlarını eleştirel şekilde analiz edebilmelidir (Örn: protein tayin yöntemlerinin farklılıkları gibi )
5	Sentez: Öğrenilen yöntemleri değişik yönlerden ele alarak sentezleyebilmeli ve yeni durumlara uyarlayabilmelidir (Örnek: SDS-PAGE de bulunan proteinlerin farklı dokularda neden farklı olduğunu tartışabilmek)
6	Uygulanan bir yöntemim sonuçlarını irdeleyerek sunabilmelidir.
7	Temel laboratuar becerilerini edinmiş olmalıdır(örnek: tartım yapma, tampon hazırlama, pH ölçümü, homojenize etme, santrifüj yapma)
8	Genel laboratuar prosedürlerini uygulama becerisini edinmiş olmalıdır (örnek: spektrofotometre, spektroflorometre, HPLC, SDS-PAGE)

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta	Konular	Açıklama
1	Giriş * Ders Tanıtımı * Laboratuarda Güvenlik * Laboratuarda Çalışma İlkeleri * Genel Laboratuar Ekipmanları
2	Laboratuar Hazırlığı Tartım İlkeleri * SI Birimleri
3	* Çözelti Hazırlığı (Konsantrasyon Hesaplamaları)
4	* pH Ölçümü ve Tampon hazırlama
5	* Proje Hazırlık Çalışması
6	* Homojenizasyon teknikleri * Santrifügasyon ; temel ilkeleri ve türleri * Video gösterimi
7	* Spektrofotometri ; Temel İlkeleri ve Uygulamaları * Spektrofotometre ile Glutatyon-S-Transferaz ölçümü
8	Spektrofotometre ile Protein miktarı ölçümü * Biüret Yöntemi ile protein tayini * Lowry Yöntemi ile protein tayini
9	* Bradford Yöntemi ile protein tayini * BCA Yöntemi ile protein tayini
10	Spektroflorometre ile Glutatyon-S-Transferaz ölçümü
11	* Kromatografinin Temel İlkeleri * Kromatografi Türleri ve Uygulamaları * Sıvı Kromatografi ( HPLC) yöntemi ile MDA ölçümü
12	* Elektroforezin temel İlkeleri * Elektroforez Türleri ve Uygulamaları
13	Elektroforez Tamponu Hazırlama Jel dökme * Protein Bantlarının Kantitasyonu * Tartışma Oturumu * Jel Yürütme * Jel Boyama
14	* Zimografi yöntemininin temel ilkeleri Zimografi yönteminin çeşitleri Gelatin zimografi yöntemi uygulaması Kollajen zimografi yöntemi uygulaması Kazein Zimografi yöntemi uygulaması

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Tietz: Klinik Kimyada Temel İlkeler Beşinci Baskı. (Editörler: Burtis & Ashwood) (Çeviri Editörü: Diler Aslan).PALMY yayıncılık, pp.352-387.
http://www.ruf.rice.edu/~bioslabs/methods/protein/protein.html
http://www.ruf.rice.edu/~bioslabs/tools/graphs/dataplot.html

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Ders, teorik ve uygulama bölümlerinden oluşmaktadır. Ders, bir mini proje kapsamında verilmektedir. Teorik bölümde ilgili dersin temel prensipleri ve ilgili yöntemle ilgili prosedürler verilmektedir.

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO	KISA KOD	UZUN ADI	FORMUL
1	VZ	Ara Sınav
2	FN	Final
3	BNS	Başarı	VZ * 0.50 +FN* 0.50
4	BUT	Bütünleme
5	BBN	Başarı	VZ * 0.50 +BUT* 0.50

*** Bütünleme Sınavı Yapılmayan Birimlerde Bütünleme Kriteri Dikkate Alınmaz.

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Kavrama, öğrenme, analiz etme, karşılaştırma, uygulama, interaktif katılım

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

Derse öğrencilerin konuyu okumuş olarak gelmeleri beklenmektedir. Mazeret durumlarında ders öğretim üyesini önceden bilgilendirmesi beklenmektedir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

e-posta. gulgun.oktay@deu.edu.tr Telefon: 412 44 02 GSM: + 5363548774

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Cuma günleri 12.30-13:30

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler	Sayısı	Süresi (saat)	Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı	15	3	45
Uygulama	30	2	60
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar	14	2	28
Vize Sınavına Hazırlık	1	20	20
Final Sınavına Hazırlık	1	40	40
Sunum Hazırlama	1	18	18
Diğer (Tartışma)	1	10	10
Final Sınavı	1	3	3
Vize Sınavı	1	3	3
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat)			227

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK	PK.1	PK.2	PK.3	PK.4	PK.5	PK.6	PK.8	PK.10	PK.11	PK.12
ÖK.1	5
ÖK.2	5
ÖK.3		5
ÖK.4			5		5
ÖK.5			5	5	5
ÖK.6		5	5	5	5	5	5	5	5	5
ÖK.7								5	5	5
ÖK.8								5	5	5

DERS ADI

DERECE PROGRAMLARI