DERS ADI

: Glikobiyolojide Temel İlkeler

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
KIM 5108 Glikobiyolojide Temel İlkeler SEÇMELİ 3 0 0 7

Dersi Veren Birim

Fen Bilimleri Enstitüsü

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

PROF.DR. MUSTAFA YAVUZ ERGÜN

Dersi Alan Birimler

Biyokimya Yüksek Lisans
Kimya Doktora
Kimya Bütünleşik Doktora
Biyokimya Doktora

Dersin Amacı

Karbohidratların kimyası ve metabolizması 20. yüzyılın ilk yıllarında ilgi gören önemli konulardandır. Bu derste, büyük moleküllerden biri olan, enerji üretiminin öncülü ayrıca sinyal efektörü, tanıma belirteci ve yapısal bileşen olan karbohidratları açıklayan glikobiyolojiye giriş yapmak amaçlanmaktadır. Karbohidratlar biyolojik olarak, hücreleri ve çevre matriks arasında etkileşimlere ihtiyaç duyan çok hücreli organ ve organizmaların bütünlüğünün sağlanmasında önemlidir. Bütün hücreler ve doğadaki birçok makromolekül, kovalent olarak bağlı şekerler (monosakkarit) veya şeker zincirleri (oligosakkarit) taşırlar. Bunlar genel olarak glikan olarak bilinmektedir. Glikanlar, diğer moleküller ve endojen reseptörlerin spesifik tanımlama bölgelerinde bulunurlar ve patojen reseptörler ve toksinler ile ilgili de rolleri vardır. Glikan biyosentezi ve diğer moleküller ile etkileşiminde rol alan enzimlerden sorumlu genlerdeki doğuştan ya da sonradan gerçekleşen mutasyonlar ve diğer metabolik anormallikler, başta kanser olmak üzere birçok hastalığa yol açmaktadır. Bu derste karbohidratlar ve karbohidrat türevlerinin yapıları, metabolizmaları ve biyolojik rollerinin yanı sıra glikobiyoloji ile ilgili hastalıkların ele alınması hedeflenmektedir.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Karbohidratları, karbohidratların sınıflandırılması ve metabolizması hakkında bilgi sahibi olur,
2   Glikanlar ve protein-glikan etkileşimlerinin yapısal temelini kavrayabilir,
3   Glikozilasyon ve öncüllerinin hücresel organizasyonunu anlayabilir,
4   Glikan metabolizmasında yer alan enzimler ve glikoziltransferazların mekanizmasını anlayabilir,
5   Genetik bozukluklar ve hastalıklarda glikanların rolünü kavrayabilir.

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Glikobiyolojiye Genel Bakış
2 Karbohidratların Yapısı, Terminolojisi ve Glikan Çeşitliliği
3 Karbohidrat Metabolizması
4 Protein-Glikan Etkileşimleri
5 Glikanların Biyolojik Rolleri
6 Glikosfingolipidler ve Bağlanmaları
7 Proteoglikanlar ve Glikozaminglikanlar
8 Ara Sınav
9 Çekirdek ve Sitoplazmada Glikolizasyon
10 Sialik Asit ve Farklı Tip Glikanların Temel Yapıları
11 Glikoziltransferazlar
12 Lektinler, Selektinler ve Galektinler
13 Genetik Rahatsızlıklar ve Hastalıklarda Glikanların Rolü
14 Öğrenci sunumları

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Ana kaynak: Varki, A., Cummings, R. D., Esko, J. D., Freeze, H. H., Stanley, P., Bertozzi, C. R., Hart, G. E., Etzler, M. E., Essentials of Glycobiology, Cold Spring Harbor Laboratory Press, USA, 2009.
Yardımcı kaynaklar: Fukuda, M., Hindsgaul, O., Molecular and Cellular Glycobiology, Oxford University Press, USA, 2000.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

1. Sunum
2. İnteraktif anlatım
3. Soru cevap tekniği
4. Ödev verme

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL
1 ARS ARASINAV (%30)
2 ODV ÖDEV (%15)
3 DKT DERSE KATILIM (%10)
4 YSS YIL SONU SINAVI (%45)
5 YSBN YIL SONU BAŞARI NOTU
6 BUT BÜTÜNLEME
7 BUTBN BÜTÜNLEME SONU BAŞARI NOTU


*** Bütünleme Sınavı Yapılmayan Birimlerde Bütünleme Kriteri Dikkate Alınmaz.

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Sunumlarda verilen temel kavramları anlamlı öğrenmesi, kavramların birbirleri ile ilişkilendirmesi, sebep-sonuç ilişkilerini kurulabilmesi ve soru veya problemlere yönelik mevcut bilgilerini kullanarak yorum yapabilmesi ve fikir üretiminin değerlendirilmesi ara sınav, final sınavı, ödevlerle gerçekleştirilecektir.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

hulya.kayali@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Çarşamba 13.30 15.30

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 13 3 39
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 13 3 39
Vize Sınavına Hazırlık 1 10 10
Final Sınavına Hazırlık 1 20 20
Ödev Hazırlama 2 15 30
Sunum Hazırlama 2 15 30
Final Sınavı 1 2 2
Vize Sınavı 1 2 2
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 172

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6PK.7PK.8PK.9PK.10PK.11
ÖK.15555555
ÖK.255555555
ÖK.35555555
ÖK.45555555
ÖK.555555555