Dokuz Eylül Üniversitesi Ders Katoloğu / Bilgi Paketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Ders Türü	D	U	L	AKTS
KIM 6112	Afinite Kromatografisi	SEÇMELİ	3	0	0	8

Dersi Veren Birim

Fen Bilimleri Enstitüsü

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

PROF.DR. MÜNİRE NALAN DEMİR

Dersi Alan Birimler

Biyokimya Yüksek Lisans
Kimya Doktora
Kimya Bütünleşik Doktora
Biyokimya Doktora

Dersin Amacı

Bu dersin amacı, biyomolekullerin saflaştırma ve izolasyonunda kullanılan ileri teknikleri tanıtmaktır.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1	Bu derste öğrencilerin, biyomolekullerin saflaştırma ve izolasyonunda kullanılan ileri teknikleri anlayabilmesi,
2	Afinite ligandının seçimini, biyospesifik afinite kromatografisini, hücre afinite kromatografisini, boya-ligand afinite kromatografisini, metal-şelat afinite kromatografisini ve hidrofobik etkileşim kromatografisini tartışabilmeli ve teknikler arasındaki farkları açıklayabilmesi,
3	Matriksin kimyasal modifikasyonunu ve afinite ligandının immobilizasyonunu açıklayabilmesi,
4	Afinite ligandının seçimini yapabilmesi ve adsorpsiyon ve elusyon koşullarını belirleyebilmesi
5	Analitik yeterlikler ile sunum ve değerlendirme yeterliklerini geliştirebilmesi beklenir.

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta	Konular	Açıklama
1	Afinite kromatografisine giriş, afinite kromatografisinin tarihçesi
2	Katı destek maddesinin özellikleri, biyopolimerler, sentetik polimerler, inorganik destekler,
3	Desteğin kimyasal modifikasyonu ve afinite ligandının immobilizasyonu, polisakkaritler, poliakrilamidler, poroz cam, ligand bağlama tepkimeleri, uzatıcı kollar, reaktif olmayan grupların blokasyonu
4	Afinite ligandının secimi: Koenzimler, Lektinler, Polinukleik asitler, özel varyantlar, Adsorpsiyon ve elusyon adımlarının genel prensipleri: Sterik koşullar, Ligand derişimi, Nonspesifik etkileşimler,
5	Biyospesifik afinite kromatografisi: Enzimler ve efektorler, Immunoafinite kromatografisi ve immuno ölçümler,
6	Nukleik asitler: Poli(A)-afinite kromatografisi, afinite matriksi olarak poli(A)-agaroz, Nukleik asit boya kromatografisi.
7	Glikoproteinlerin afinite kromatografisi, İntegral membran proteinleri, Amfipatik yapısı, çözünürlük ve afinite kromatografisi ile saflaştırılma özellikleri
8	Ara Sınav
9	Cibacron blue F3GAnin yapı, özellik ve immobilizasyonu, boya-protein etkileşim mekanizmaları, enzim ve kan proteinlerinin saflaştırılması, diğer boyalar
10	Yük-transfer adsorpsiyon kromatografisi
11	Hidrofobik etkileşim kromatografisi: Nötral tuzların etkisi, adsorbent materyalinin elektrostatik yüklerinin etkisi
12	Afinite dağılma, afinite elektroforezi
13	Yüksek performans sıvı afinite kromatografisi
14	Genel değerlendirme ve ödev sunumu

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

1. Mohr P., Pommerening K., Affinity Chromatography, Practical and Theoretical Aspects, Marcel Dekker, Inc. New York and Basel, 1986.
2. Bailon P., Ehrlich G.K., Fung W.J., Berthold W., Affinity Chromatography: Methods and Protocols, ISBN: 978-0-89603-694-9.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

1. Sunum
2. Soru cevap tekniği
3. Ödev

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO	KISA KOD	UZUN ADI	FORMUL
1	ARS	ARASINAV
2	ODV	ÖDEV
3	YSS	YIL SONU SINAVI
4	YSBN	YIL SONU BAŞARI NOTU	ARS * 0.20 + ODV * 0.40 + YSS * 0.40
5	BUT	BÜTÜNLEME
6	BUTBN	BÜTÜNLEME SONU BAŞARI NOTU	ARS * 0.20 + ODV * 0.40 + BUT * 0.40

*** Bütünleme Sınavı Yapılmayan Birimlerde Bütünleme Kriteri Dikkate Alınmaz.

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

8. ve 15. haftalarda ders konularıyla ilgili iki sınav yapılacaktır. Ara sınav notunun
% 20si, ödevin %40ı, yarıyıl sonu sınav notunun % 40ı başarı notunu belirleyecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

Dönem boyunca derslerin % 70ine devam etme sorumluluğu öğrenciye aittir. Derslerde ve sınavlarda meydana gelebilecek etik dışı davranışlar konusunda ilgili yönetmelik çerçevesinde hareket edilecektir. D.E.Ü. Fen Fakültesi öğretim ve sınav uygulama esasları yönetmeliğini http://web.deu.edu.tr/fen adresinden temin edebilirsiniz.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

nalan.tuzmen@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler	Sayısı	Süresi (saat)	Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı	13	3	39
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar	13	3	39
Vize Sınavına Hazırlık	1	20	20
Final Sınavına Hazırlık	1	30	30
Ödev Hazırlama	2	35	70
Final Sınavı	1	2	2
Vize Sınavı	1	2	2
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat)			202

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK	PK.1	PK.2	PK.3	PK.4	PK.5	PK.6	PK.7	PK.8	PK.9	PK.10	PK.11
ÖK.1	5	5	5	5	4	5	5	5	5	5	4
ÖK.2	5	5	5	5	4	5	5	5	5	5	4
ÖK.3	5	5	5	5	4	5	5	5	5	5	4
ÖK.4	5	5	5	5	4	5	5	5	5	5	4
ÖK.5	5	5	5	5	5	5	5	5	5	5	5

DERS ADI

DERECE PROGRAMLARI