• ANASAYFA
• ÜNİVERSİTE HAKKINDA
  • İsim - Adres
  • Genel Bilgi
  • Üniversite Yönetimi
  • Akademik Takvim
  • Derece Programları
  • Yabancı Dilde Eğitim Veren Birimler
  • Genel Kabul ve Kayıt Koşulları
  • Kredi Hareketliliği ve Önceki Öğrenmenin Tanınması
  • AKTS Kredilerinin Belirlenmesi
  • Akademik Danışmanlık
  • İletişim
• DERECE PROGRAMLARI
  • Doktora Programları
  • Yüksek Lisans Programları
  • Lisans Programları
  • Önlisans Programları
• ÖĞRENCİ İÇİN GENEL BİLGİLER
  • Yaşam Standardı
  • Barınma
  • Beslenme
  • Sağlık
  • Engelli İçin Olanaklar
  • Sigorta
  • Finansal Destekler
  • Öğrenci İşleri Daire Başkanlığı
  • Uluslararası Öğrenciler için Pratik Bilgiler
  • Dil Kursları
  • Staj Olanakları
  • Sportif, Sosyal ve Kültürel Faaliyetler
  • Öğrenci Toplulukları ve Kulüpler
  • İzmir-Türkiye Hakkında
• ULUSLARARASI İLİŞKİLER
  • Dış İlişkiler Koordinatörlüğü
  • Kayıt İşlemleri
  • Anlaşmalar
  • Koordinatörler
  • Belgeler
  • Yabancı Dilde Eğitim Veren Birimler
  • AKTS/DE Etiketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS BST 5007 Hesaplamalı Biyolojiye Giriş SEÇMELİ 3 0 0 9

Dersi Veren Birim

Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Yüksek Lisans

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

DR. ÖĞR. ÜYESİ ATHANASIA PAVLOPOULOU

Dersi Alan Birimler

Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Yüksek Lisans

Dersin Amacı

Öğrencilere biyoinformatik ve hesaplamalı biyoloji kavramlarını anlamalarını sağlamak.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   1. Biyoinformatik ve hesaplamalı biyoloji kavramlarını tanımlamak 2   2. Başlıca moleküler biyoloji veri depolarına aşina olmak 3   3. Biyolojik verilere kamuya açık veritabanlarından nasıl erişileceğini ve alınabileceğini anlamak 4   4. Biyolojik dizi veri analizinin prensiplerini anlamak 5   5. Moleküler biyolojide sistem düzeyinde biyoinformatik yaklaşımlarını anlamak

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama 1 Giriş 2 Biyolojik Veritabanları I 3 Biyolojik Veritabanları II 4 İkili sıra hizalaması 5 Çoklu sıra hizalaması 6 Sekans Motiflerinin Bulunması 7 Sekans Veritabanlarında Benzerlik Araması I 8 ARASINAV 9 Sekans Veritabanlarında Benzerlik Araması II 10 Protein Yapı Analizi 11 Protein Yapısı Tahmini 12 Filogenetik Analızı I 13 Filogenetik Analızı II 14 Gen Regülasyonunun Biyoenformatik Analizi I 15 Gen Regülasyonunun Biyoenformatik Analizi II 16 FINAL

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Ana kaynak: Bioinformatics and Functional Genomics, by Jonathan Pevsner October. Wiley-Blackwell, 2015. ISBN: 978-1-118-58178-0

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Sözlü sunum, literatür tarama, tartışma ve uygulamalı alıştırmalar.

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL 1 ODV Ödev/Dkat. 2 VZ Vize 3 FN Final 4 BNS FinalSonuBaşarıNotu ODV * 0.30 + VZ * 0.30 + FN * 0.40 5 BUT Bütünleme 6 BBN BütSonuBasarıNotu ODV * 0.30 + VZ * 0.30 + BUT * 0.40

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

athanasia.pavlopoulou@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat) Ders Anlatımı 14 3 42 Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 14 5 70 Vize Sınavına Hazırlık 1 15 15 Final Sınavına Hazırlık 1 20 20 Ödev Hazırlama 1 50 50 Sunum Hazırlama 1 15 15 Final Sınavı 1 10 10 Vize Sınavı 1 5 5 TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 227

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK PK.1 PK.2 PK.3 PK.4 PK.5 PK.6 PK.7 PK.8 ÖK.1 5 ÖK.2 5 5 5 ÖK.3 5 5 5 5 ÖK.4 5 5 5 5 ÖK.5 5