• ANASAYFA
• ÜNİVERSİTE HAKKINDA
  • İsim - Adres
  • Genel Bilgi
  • Üniversite Yönetimi
  • Akademik Takvim
  • Derece Programları
  • Yabancı Dilde Eğitim Veren Birimler
  • Genel Kabul ve Kayıt Koşulları
  • Kredi Hareketliliği ve Önceki Öğrenmenin Tanınması
  • AKTS Kredilerinin Belirlenmesi
  • Akademik Danışmanlık
  • İletişim
• DERECE PROGRAMLARI
  • Doktora Programları
  • Yüksek Lisans Programları
  • Lisans Programları
  • Önlisans Programları
• ÖĞRENCİ İÇİN GENEL BİLGİLER
  • Yaşam Standardı
  • Barınma
  • Beslenme
  • Sağlık
  • Engelli İçin Olanaklar
  • Sigorta
  • Finansal Destekler
  • Öğrenci İşleri Daire Başkanlığı
  • Uluslararası Öğrenciler için Pratik Bilgiler
  • Dil Kursları
  • Staj Olanakları
  • Sportif, Sosyal ve Kültürel Faaliyetler
  • Öğrenci Toplulukları ve Kulüpler
  • İzmir-Türkiye Hakkında
• ULUSLARARASI İLİŞKİLER
  • Dış İlişkiler Koordinatörlüğü
  • Kayıt İşlemleri
  • Anlaşmalar
  • Koordinatörler
  • Belgeler
  • Yabancı Dilde Eğitim Veren Birimler
  • AKTS/DE Etiketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS BST 6004 Sistem Biyolojisi SEÇMELİ 3 0 0 12

Dersi Veren Birim

Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Doktora

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

DR. ÖĞR. ÜYESİ ATHANASIA PAVLOPOULOU

Dersi Alan Birimler

Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Doktora

Dersin Amacı

Biyolojik sistemlerin çalışmasına hesaplama yöntemlerini uygulamak.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   1. Sistem biyolojisi araştırmalarına giriş yapmak 2   2. Biyolojik meta veri depolarına aşina olmak 3   3. Silico'daki moleküler yolakları incelemek 4   4. Biyolojik varlıkların işlenmesi için hesaplama yöntemlerini uygulamak 5   5. Biyomoleküler etkileşimler ağları oluşturmak ve analiz etmek 6   6. Gen düzenleyici ağları kurmak ve analiz etmek 7   7. Genotipler ve fenotipler arasındaki ilişkiyi araştırmak 8   8. Hastalık-hastalık ilişkilerini araştırmak 9   9. Karmaşık hastalıklar için biyobelirteçleri ve ilaç hedeflerini belirlemek 10   10. Türler arasındaki evrimsel ilişkileri anlamak 11   11. Araştırma bulgularını sunmak

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama 1 Giriş 2 Biyolojik meta veritabanları I 3 Biyolojik meta veritabanları II 4 Biyomoleküler yollar 5 Ağ tabanlı yöntemler I 6 Ağ tabanlı yöntemler II 7 Gen düzenleyici ağlar 8 ARASINAV 9 Transkripsiyonel düzenleyici ağlar 10 Protein etkileşim ağları 11 İşlemsel fonksiyonel genomik 12 Ağ tıbbı I 13 Ağ tıbbı II 14 Hesaplamalı filogenetik 15 Karşılaştırmalı genomik 16 FİNAL SINAVI

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Systems Biology: A Textbook, 2nd Edition, by Edda Klipp, Wolfram Liebermeister, Christoph Wierling, Axel Kowald. Wiley-Blackwell, 2016 ISBN: 978-3-527-33636-4

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Sözlü sunum, literatür tarama, tartışma ve uygulamalı alıştırmalar.

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL 1 ODV Ödev/Dkat. 2 VZ Vize 3 FN Final 4 BNS FinalSonuBaşarıNotu ODV * 0.30 + VZ * 0.30 + FN * 0.40 5 BUT Bütünleme 6 BBN BütSonuBasarıNotu ODV * 0.30 + VZ * 0.30 + BUT * 0.40

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

athanasia.pavlopoulou@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat) Ders Anlatımı 14 3 42 Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 14 8 112 Vize Sınavına Hazırlık 1 20 20 Final Sınavına Hazırlık 1 25 25 Ödev Hazırlama 2 30 60 Sunum Hazırlama 1 35 35 Vize Sınavı 1 5 5 Final Sınavı 1 5 5 TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 304

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK PK.1 PK.2 PK.3 PK.4 PK.5 PK.6 PK.7 PK.8 ÖK.1 5 5 5 5 ÖK.2 5 5 5 ÖK.3 5 5 5 ÖK.4 5 5 5 ÖK.5 5 5 5 ÖK.6 5 5 5 ÖK.7 5 5 5 ÖK.8 5 5 5 ÖK.9 5 5 5 ÖK.10 5 5 5 ÖK.11 5 5