• ANASAYFA
• ÜNİVERSİTE HAKKINDA
  • İsim - Adres
  • Genel Bilgi
  • Üniversite Yönetimi
  • Akademik Takvim
  • Derece Programları
  • Yabancı Dilde Eğitim Veren Birimler
  • Genel Kabul ve Kayıt Koşulları
  • Kredi Hareketliliği ve Önceki Öğrenmenin Tanınması
  • AKTS Kredilerinin Belirlenmesi
  • Akademik Danışmanlık
  • İletişim
• DERECE PROGRAMLARI
  • Doktora Programları
  • Yüksek Lisans Programları
  • Lisans Programları
  • Önlisans Programları
• ÖĞRENCİ İÇİN GENEL BİLGİLER
  • Yaşam Standardı
  • Barınma
  • Beslenme
  • Sağlık
  • Engelli İçin Olanaklar
  • Sigorta
  • Finansal Destekler
  • Öğrenci İşleri Daire Başkanlığı
  • Uluslararası Öğrenciler için Pratik Bilgiler
  • Dil Kursları
  • Staj Olanakları
  • Sportif, Sosyal ve Kültürel Faaliyetler
  • Öğrenci Toplulukları ve Kulüpler
  • İzmir-Türkiye Hakkında
• ULUSLARARASI İLİŞKİLER
  • Dış İlişkiler Koordinatörlüğü
  • Kayıt İşlemleri
  • Anlaşmalar
  • Koordinatörler
  • Belgeler
  • Yabancı Dilde Eğitim Veren Birimler
  • AKTS/DE Etiketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS MPT 6006 Moleküler Patolojide Biyoinformatik SEÇMELİ 2 0 0 6

Dersi Veren Birim

Moleküler Patoloji Doktora

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

PROF. DR. SAFİYE AKTAŞ

Dersi Alan Birimler

Moleküler Patoloji Doktora

Dersin Amacı

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Öğrenciler farklı analiz yöntemleri ile sınıflama, gruplama, analiz ve rapor etmeyi anlayabileceklerdir. 2   Öğrenciler yeni nesil dizileme sistemleri ile elde edilen verideki bilgiyi izleyebileceklerdir. 3   Öğrenciler moleküler patoloji analiz yazılımları ile elde edilen sonuçları yorumlayabileceklerdir. 4   Öğrenciler biyoinformatik analizle elde edilen bilgiyi klinik uygulamalarla bağlantılandırabilecek ve hasta tedavisini iyileştirebileceklerdir. 5   Öğrenciler etik analizi ve veri madenciliği yazılımının değerini kavrayacaklardır.

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama 1 Biyoinformatik nedir Moleküler Patoloji için Biyoinformatik nedir 2 Veri Tabanlarının Genel Tanıtımı 3 DNA dizilerinde hizalama ve haritalama yöntemleri 4 Dizilemede Biyoinformatik Pipeline 5 Primer oluşturma yöntemleri 6 Onkolojik Patolojide Dizileme için Panel Oluşturma Yöntemleri 7 Dizileme için İdeal Biyoinformatik Programının Özellikleri 8 Önemi bilinmeyen varyantların yorumlanması (Patolog neler yapabilir ) 9 DNA-RNA Dizisi-Protein Yapısı ve İşlevsel Öngörü Yöntemleri 10 Dizi Analizi Biyoinformatik Klinikopatolojik Uygulamaları I 11 Dizi Analizi Biyoinformatik Klinikopatolojik Uygulamaları II 12 RNA dizileme için Biyoinformatik 13 In silico analiz yöntemleri DNA 14 In silico analiz yöntemleri RNA 15 Genel Değerlendirme

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

İlan Edilecektir.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Teorik sunumlar ve sık teorik bilgilerin uygulamalarına izin veren sık proje görevleri.

Değerlendirme Yöntemleri

İLAN EDİLECEKTİR

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Dersin öğrenme konuları klasik sınav, ödev/sunum ile değerlendirilecektir.

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

İlan Edilecektir.

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat) Ders Anlatımı 15 2 30 Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 15 3 45 Final Sınavına Hazırlık 1 45 45 Ödev Hazırlama 1 25 25 Final Sınavı 1 5 5 TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 150

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK PK.1 PK.2 PK.3 PK.4 PK.5 PK.6 PK.7 PK.8 PK.9 PK.10 PK.11 ÖK.1 5 5 5 ÖK.2 5 5 5 ÖK.3 5 5 5 ÖK.4 5 5 5 ÖK.5 4 5 5 5 4