Dokuz Eylül Üniversitesi Ders Katoloğu / Bilgi Paketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Ders Türü	D	U	L	AKTS
MBG 5027	Mikrorganizma Genetik ve Genomiği	SEÇMELİ	3	0	0	9

Dersi Veren Birim

Moleküler Biyoloji ve Genetik Yüksek Lisans

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

DR. ÖĞR. ÜYESİ ZEYNEP AHSEN KOÇER

Dersi Alan Birimler

Moleküler Biyoloji ve Genetik Bütünleşik Doktora
Moleküler Biyoloji ve Genetik Yüksek Lisans

Dersin Amacı

Bakteriyel genomun organizasyonu ve dinamiği hakkında kapsamlı bilgi sahibi olmak. Yeni nesil dizileme ve omik yöntemlerini kullanarak mikrobiyal komüniteleri ve çevreleriyle olan ilişkilerini kavramak.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1	Yeni nesil dizileme yöntemlerini tanımlayabilme
2	Dizi analiz yöntemlerini açıklayabilme
3	Omiks yöntemleri ile mikrobiyal genomiks çalışmalarını tartışabilme
4	Mikrobiyal genetikte kullanılan terimleri tanımlayabilme
5	Mikrobiyal komüniteler ve hastalıklar arasındaki ilişkilerin anlaşılmasında yeni nesil dizileme ve omiks yöntemlerinin rolünü tartışabilme

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta	Konular	Açıklama
1	Omik Teknolojileri ve Yeni Nesil Dizileme Yöntemleri
2	Metagenomiks
3	Metagenomiğin Klinik Araştırmalarda Uygulaması
4	Metagenomiğin Endüstriyel Biyoürünlerde Uygulaması
5	Mikrobiyal Transkriptomiks: araçlar, uygulamalar, zorluklar
6	RNA-Seq ile Konak-Patojen İlişkilerinin Anlaşılması
7	Biyofilm Metagenomiği
8	ARA SINAV
9	Mikrobiyom Çalışmalarına Giriş
10	Mikrobiyom ve Bulaşıcı Hastalıklar
11	Mikrobiyom ve Kanser
12	İnsan Virom Çalışmaları
13	İnsan Viromu: Zorluklar, Gelecek çalışmalar
14	Mikrobiyom ve Epigenetik
15	Mikrobiyoma Dayalı Tedaviler
16	Final Sınavı

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Textbook(s)/References/Materials:
Textbook(s):
Molecular Genetics of Bacteria, 4th Edition, by Larry Snyder, Joseph E. Peters, Tina M. Henkin, and Wendy Champness, ASM Press, 2013
ISBN-13: 978-1555816278

Supplementary Book(s): Brock Biology of Microorganisms, 13th Edition, by Michael T. Madigan, John M. Martinko, David Stahl, and David P. Clark, Benjamin-Cummings, 2010
ISBN: 978-0321649638

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

PowerPoint ile teorik anlatım ve araştırma makalaleri üzerinden tartışma

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO	KISA KOD	UZUN ADI	FORMUL
1	ODV	Ödev/Dkat.
2	VZ	Vize
3	FN	Final
4	BNS	FinalSonuBaşarıNotu	ODV * 0.30 + VZ * 0.30 + FN * 0.40
5	BUT	Bütünleme
6	BBN	BütSonuBasarıNotu	ODV * 0.30 + VZ * 0.30 + BUT * 0.40

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Teorik bilgiler sınav ile değerlendirilecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

zeynep.kocer@deu.edu.tr
Phone: 412 6628

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri