DERS ADI

: Kanseromiklere Giriş

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
TRO 5002 Kanseromiklere Giriş SEÇMELİ 3 0 0 6

Dersi Veren Birim

Translasyonel Onkoloji Yüksek Lisans

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

DOÇ. DR. GİZEM ÇALIBAŞI KOÇAL

Dersi Alan Birimler

Translasyonel Onkoloji Yüksek Lisans
Translasyonel Onkoloji Bütünleşik Doktora

Dersin Amacı

Kanseri tanımaya yönelik omik teknolojilerini kavramak ve modern kanser kliniğindeki uygulamalarını öğrenmektir. Bu ders kapsamında; Omik teknolojileri,kanser alanında kullanımları, sistem biyolojisi kavramı, kanseromiklerin klinik kullanımları anlatılacaktır.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Omik teknolojilerini genel hatları ile kavrar
2   Kanserde omik biyomarker kullanımını bilir.
3   Genomik, proteomik, farmakogenomik yöntemleri bilir.
4   Epigenomik, lipidomik yöntemler hakkında fikir sahibidir.
5   Sistem biyolojisi kavramını ifade eder.
6   Kanseromiklerin klinik kullanımı hakkında fikir sahibidir.

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Kanser araştırmalarında omiks yaklaşımı
2 Kanserde genomiks (Yeni nesil sekanslama teknolojileri, Kanser Genom Atlas, Single-cell genomics)
3 Kanserde onkogenomiks: Genlerden Yolak analizine
4 Farmakogenomiks: Genlerden İlaç Yanıtlarına
5 Kanserde Epigenomiks
6 Kanserde Transkriptomiks
7 Kanserde İnteraktom profilleme
8 Kanserde Metabolomiks and Lipidomiks
9 Kanserde Proteomiks
10 Kanserde Fenomiks
11 Kanserde Sistem Biyolojisi
12 Kanserde Mikrobiyomiks
13 Kanseromiks ve Bireye özgü tedaviler
14 Omiks verileri, Makine öğrenmesi ve Yapay Zeka ile Birleşimi
15 Kanseromiksler ve Biyobankalar

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

An Omics Perspective on Cancer Research. Springer. 2010 Editors: Cho, William Chi-Sing (Ed.)
Molecular Biology of the Cell, 6th Edition. Ed. Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter. Garland Publishers
Essential Cell Biology - 4th Edition Bruce Alberts, Dennis Bray, Karen Hopkin, Alexander D Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter Garland Publishers
The Biology of Cancer, 2nd Edition, Robert A. Weinberg, Garland Publishers
Molecular Biology of the Gene, 7th edition, James Watson, Alexander Gann, Tania Baker, Michael Levine, Stephan Bell, Richard Losick, Stephan Harrison Pearson Cold Spring harbor Laboratory Press.
Principles of Molecular Diagnostics and Personalized Cancer Medicine, Dongfeng Tan, henry Lynch, Wolters Kluwer, Lippincott Williams&Wilkins.
The Handbook of Biomarkers, Kewal Jain, Humana Press
Translational and Experimental Clinical Research, Daniel Schuster, William Powers, Lippincott Williams&Wilkins.
Klinik Araştırmalar Kitabı 2014, Hamdi Akan, Hilal İlbars, Nurşah Çetinkaya, Bilimsel Tıp Yayınevi
Designing Clinical Research 4th Edition, Steven R Cummings , Warren S Browner , Deborah G Grady , Thomas B Newman , Dr Stephen B Hulley, Lippincott Williams&Wilkins.
Cammarota, G., Ianiro, G., Ahern, A. et al. Gut microbiome, big data and machine learning to promote precision medicine for cancer. Nat Rev Gastroenterol Hepatol 17, 635 648 (2020). https://doi.org/10.1038/s41575-020-0327-3
Epstein RJ, Lin FP. Cancer and the omics revolution. Aust Fam Physician. 2017;46(4):189-193. PMID: 28376570.
Gemma L D Adamo1, James T Widdop, Edward M Giles. The future is now Clinical and translational aspects of Omics technologies. Immunology and Cell Biology. 2020, 1 9.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Teorik ders anlatımı, konuların ders içi etkinliklerle (sunum ve ödevlerle) pekiştirilmesi ve tartışılması

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL
1 VZ Ara Sınav
2 PO Performans/Ödev
3 FN Final
4 BNS Başarı VZ * 0.20 +PO * 0.20 + FN* 0.60
5 BUT Bütünleme Notu
6 BBN Bütünleme Sonu Başarı Notu VZ * 0.20 + PO * 0.20 + BUT* 0.60


Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

1-Sınav değerlendirmesi ile öğrenme kazanımlarından ÖK1, ÖK2 ve ÖK3'ü açıkça tanımlayabilir.
2-Ödev, sunum hazırlayarak ve sınavla ÖK4, ÖK5 ve ÖK6'yı tanıyıp, yorumlayabilir.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

gizem.calibasi@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Randevu ile, Perşembe 11:00-12:00

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 15 3 45
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 15 3 45
Vize Sınavına Hazırlık 1 8 8
Final Sınavına Hazırlık 1 10 10
Ödev Hazırlama 5 4 20
Sunum Hazırlama 2 10 20
Final Sınavı 1 1 1
Vize Sınavı 1 1 1
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 150

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6PK.7PK.8PK.9PK.10PK.11PK.12
ÖK.1555555
ÖK.2555555
ÖK.35555555
ÖK.455555555
ÖK.555555555
ÖK.655555555