DERS ADI

: Proteomiks:Genel Bakış

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
MOT 6035 Proteomiks:Genel Bakış SEÇMELİ 1 0 0 3

Dersi Veren Birim

Moleküler Tıp Doktora

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

PROF. DR. GÜL HÜRAY İŞLEKEL

Dersi Alan Birimler

Moleküler Tıp Doktora
Moleküler Tıp Bütünleşik Doktora

Dersin Amacı

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Proteinlerin Genel Özellikleri: Proteinlerin yapısı ve işlevlerini anlamak
2   Proteom analizlerinde kullanılan ayırım tekniklerini kavramak
3   Proteom analizlerinde kullanılan teknikleri kavramak
4   Kütle spektrometresinin proteomikte kullanımını öğrenmek
5   Klinik proteomiksi anlamak
6   Biyoinformatik kavramını anlamak

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Genomikten Proteomiğe Geçiş: DNA ve RNA seviyesinde işlevsel genomik
2 Proteinlerin Genel Özellikleri: Proteinlerin yapısı ve işlevi
3 Proteom analizlerinde kullanılan ayırım teknikleri İki boyutlu jel elektroforezinin prensipleri Sıvı kromatografisinin proteomikteki prensipleri
4 Proteinlerin tanımlanmasında kullanılan teknikler Antikorlarla protein tanımlanması Kimyasal degradasyon ile protein sekansının belirlenmesi
5 Kütle spektrometresinin proteomikte kullanımı
6 Proteomikte kantitasyon teknikleri Standart iki boyutlu jel elektroforezi ile kantitatif proteomik analizleri
7 Kütle spektrometresi ile kantitatif proteomik analizler: stabil izotop dilüsyon yöntemi ile sıvı kromatografi-tandem kütle spektrometresi (LC-MS/MS) multiple reaction monitoring (MRM) modunda kantitatif analizlerin gerçekleştirilmesi
8 Kütle spektrometresi ile kantitatif proteomik analizler: stabil izotop dilüsyon yöntemi ile sıvı kromatografi-tandem kütle spektrometresi (LC-MS/MS) multiple reaction monitoring (MRM) modunda kantitatif analizlerin gerçekleştirilmesi
9 Klinik proteomiks
10 Klinik proteomiks
11 Yapısal proteomik: Protein yapılarının proteomikteki önemi, protein yapılarının anlaşılmasını sağlayan teknikler
12 Protein-protein etkileşimleri ve proteomik: Protein etkileşim analizlerinin prensipleri, protein etkileşim haritaları
13 Biyoinformatik
14 Genel değerlendirme
15 FİNAL

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

İlan Edilecektir.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Ders, interaktif sunumlar, makale tartışmaları şeklinde gerçekleştirilecektir.

Değerlendirme Yöntemleri

İLAN EDİLECEKTİR


Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

İlan Edilecektir.

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 5 3 15
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 5 5 25
Final Sınavına Hazırlık 1 15 15
Ödev Hazırlama 1 5 5
Vize Sınavına Hazırlık 1 10 10
Final Sınavı 1 3 3
Vize Sınavı 1 2 2
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 75

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6PK.7PK.8PK.9PK.10PK.11PK.12PK.13PK.14
ÖK.13455
ÖK.24554
ÖK.35544
ÖK.4335
ÖK.5445
ÖK.645