Dokuz Eylül Üniversitesi Ders Katoloğu / Bilgi Paketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Ders Türü	D	U	L	AKTS
BİO 6071	Hücre Sinyal İletimi ve Ölüm Yolakları	SEÇMELİ	3	0	0	5

Dersi Veren Birim

Biyokimya Doktora

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

PROF. DR. AYŞE SEMRA KOÇTÜRK

Dersi Alan Birimler

Biyokimya Doktora

Dersin Amacı

Dersin temel amacı; biyokimya bilim dalında lisansüstü eğitim yapan öğrencilerin hücrenin kaderini belirleyen hücre içi sinyal iletim ve hücre ölüm yolaklarının mekanizmalarını öğrenmeleridir. Bu amaçla dersin içeriği; hücre çoğalmasını ve ölmesini kontrol eden hücre döngüsü dersi ile başlamakta ve hücrenin çeşitli dış ve iç etkenler ile aktive olabilen sinyal ileti yolaklarının anlatılmasından sonra bu yolakların hücreyi ölüme götüren farklı hücre ölüm mekanizmaları ile ilişkilendirilecek bir akış içinde hazırlanmıştır. Bu mekanizmaların öğrenilmesi sonucunda özellikle dejeneratif hastalıklara yönelik teröpatik yaklaşımlara ilişkin sorgulama ve araştırma yetisinin artması hedeflenmektedir

Dersin Öğrenme Kazanımları

1	ÖÇ1. Hücre sinyal ileti mekanizmalarını anlayabilecek temel hücre biyolojisi bilgisine sahiptir (PÇ1, PÇ2)
2	ÖÇ2. Hücre içi sinyal ileti ve hücre ölüm mekanizmalarını ilişkilendirebilir ve sunabilir (PÇ5,PÇ6,PÇ7, PÇ8,PÇ9,PÇ10
3	ÖÇ3. Ders konusu ile ilgili bilgi ve veri tabanlarına ulaşabilir ve kullanabilir (PÇ8, PÇ9).
4	ÖÇ4. Ders alanında edindiği bilgiler ile hastalıkların temelindeki hücresel mekanizmaları anlayabilir (PÇ6, PÇ7, PÇ9
5	ÖÇ5. Dejeneratif hastalıklara yönelik moleküler düzeyde araştırma planlama yetisine sahiptir (PÇ9, PÇ10)

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta	Konular	Açıklama
1	Hücre döngüsü, kontrolü ve hücre ölümü ile ilişkisi.
2	G- protein eşleşmiş reseptör aracılı sinyal iletimi.
3	Serin Kinaz reseptörler sinyal iletim yolakları: TGF-b/SMAD3/SMAD4
4	Sitokin reseptörleri: JAK/STAT sinyal iletimi
5	Tirozin kinaz reseptörleri ve Ras/MAP Kinaz sinyal yolağı
6	PI3-Kinaz ve PTEN aracılı sinyal iletimi.
7	Ubikitinler ve protein yıkımını kontrol eden sinyal yolakları-I: WNT/HEDGEHOG/NF-KB
8	Protein yıkımını kontrol eden sinyal yolakları-II: NOTCH/DELTA/SREBP
9	ARA SINAV
10	Hücre Ölümü ve sinyal yolakları-I: Apoptoz,Nekroptoz
11	Hücre Ölümü ve sinyal yolakları-II: Otofaji, Ferroptoz
12	Hücre Ölümü ve sinyal yolakları-III: Entoz, Paraptoz, Partanatoz, Mitoptoz,Pyroptoz
13	Kanser hücresinde değişen sinyal ileti yolakları ve hücre ölüm yolakları ile ilişkisi-I: EGFR, MAPK/Erk, PI3Kinase/Akt/mTOR, cMyc, HIF-1, P53, NF-Kb
14	Kanser hücresinde değişen sinyal ileti yolakları ve hücre ölüm yolakları ile ilişkisi -II: JAK/STAT, TGF-b, WNT, NOTCH
15	Yaşlanma ve nörodejenerasyonda ER stres, Yanlış katlanmış protein stresi ve mitokondri aracılı sinyal ileti yolakları
16	Ödev Sunumları ve Değerlendirme

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

1. Molecular Cell Biology 8th Edition, Editors: Harvey Lodish, Arnold Berk, Chris A. Kaiser, ISBN-13: 978-1-4641-8339-3, 2016, Printed in the United States of America by W. H. Freeman and Company. One New York Plaza, Suite 4500, New York, NY 10004-1562
2. Cell Death Mechanism and Disease, Editor: Hao Wu, ISBN 978-1-4614-9301-3, 2014, Springer New York Heidelberg Dordrecht London.
3. Cell Death Signaling in Cancer Biology and Treatment, Editor, Daniel E. Johnson, ISBN 978-1-4614-5846-3, Springer New York Heidelberg Dordrecht London.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Teorik ders ve ödev verilerek sunum hazırlatılması öğrenme sağlanması. Sunum hazırlığı sırasında edindiği bilgiler doğrultusunda ileriye dönük araştırma planlama yetilerinin geliştirilmesi.

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO	KISA KOD	UZUN ADI	FORMUL
1	VZ	Ara Sınav
2	ODV	Ödev
3	FN	Final
4	BNS	Başarı	VZ * 0.30 + ODV * 0.20 +FN* 0.50
5	BUT	Bütünleme Notu
6	BBN	Bütünleme Sonu Başarı Notu	VZ * 0.30 + ODV * 0.20 + BUT* 0.50

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

1. Hücresel sinyal ileti yolakları ve hücre ölüm mekanizmaları ile ilgili teorik bilgisi ara sınav, yarı yıl sonu sınavı ve sözlü sunum ile değerlendirilecektir (PÇ1, PÇ2;PÇ5,PÇ6,PÇ7,PÇ9,PÇ10).
2. Öğrendiği bilgileri uygulama becerisi, gerekli veri tabanlarına ulaşabilme ve yorumlayabilme yetisi Ödev/sunum ile değerlendirilecektir (PÇ8, PÇ9)

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

e-posta: semra.kocturk@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Çarşamba, 13:30-14:30

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler	Sayısı	Süresi (saat)	Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı	15	3	45
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar	15	3	45
Vize Sınavına Hazırlık	1	12	12
Final Sınavına Hazırlık	1	12	12
Sunum Hazırlama	1	12	12
Final Sınavı	1	2	2
Vize Sınavı	1	2	2
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat)			130

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK	PK.1	PK.2	PK.5	PK.6	PK.7	PK.8	PK.9	PK.10
ÖK.1	5	5
ÖK.2			5	5	5	5	5	5
ÖK.3						5	5
ÖK.4				5	5
ÖK.5							5	5

DERS ADI

DERECE PROGRAMLARI