• ANASAYFA
• ÜNİVERSİTE HAKKINDA
  • İsim - Adres
  • Genel Bilgi
  • Üniversite Yönetimi
  • Akademik Takvim
  • Derece Programları
  • Yabancı Dilde Eğitim Veren Birimler
  • Genel Kabul ve Kayıt Koşulları
  • Kredi Hareketliliği ve Önceki Öğrenmenin Tanınması
  • AKTS Kredilerinin Belirlenmesi
  • Akademik Danışmanlık
  • İletişim
• DERECE PROGRAMLARI
  • Doktora Programları
  • Yüksek Lisans Programları
  • Lisans Programları
  • Önlisans Programları
• ÖĞRENCİ İÇİN GENEL BİLGİLER
  • Yaşam Standardı
  • Barınma
  • Beslenme
  • Sağlık
  • Engelli İçin Olanaklar
  • Sigorta
  • Finansal Destekler
  • Öğrenci İşleri Daire Başkanlığı
  • Uluslararası Öğrenciler için Pratik Bilgiler
  • Dil Kursları
  • Staj Olanakları
  • Sportif, Sosyal ve Kültürel Faaliyetler
  • Öğrenci Toplulukları ve Kulüpler
  • İzmir-Türkiye Hakkında
• ULUSLARARASI İLİŞKİLER
  • Dış İlişkiler Koordinatörlüğü
  • Kayıt İşlemleri
  • Anlaşmalar
  • Koordinatörler
  • Belgeler
  • Yabancı Dilde Eğitim Veren Birimler
  • AKTS/DE Etiketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS TBG 6100 Moleküler Biyoloji ve Hücre Biyolojisi Yöntemleri I SEÇMELİ 2 2 0 9

Dersi Veren Birim

Tıbbi Biyoloji ve Genetik Doktora

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

PROF. DR. HAKKI OGÜN SERCAN

Dersi Alan Birimler

Odyoloji Doktora Laboratuvar Hayvanları Bilimi Doktora Anatomi Doktora Moleküler Patoloji Doktora Egzersiz Fizyolojisi Doktora Toksikoloji Doktora Biyokimya Doktora Biyomekanik Doktora Histoloji - Embriyoloji Doktora Tıbbi Biyoloji ve Genetik Doktora Biyofizik Doktora Fizyoloji Doktora Translasyonel Onkoloji Doktora Tıbbi Parazitoloji Doktora Mikrobiyoloji Doktora Farmakoloji Doktora Temel Sinirbilimler Doktora Moleküler Tıp Doktora Translasyonel Onkoloji Bütünleşik Doktora Moleküler Tıp Bütünleşik Doktora

Dersin Amacı

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   PCR dinamiklerini ve kantitasyona yönelik uygulamaları karşılaştırarak tartışır. 2   DNA yapısını, metile-DNA yapısını ve metilasyon mekanizmalarını detaylarıyla anlatır. 3   Metile-DNA'nın tanımlanmasına yönelik yöntemleri sıralayarak açıklar. 4   Metilasyon spesifik PCR, bisülfit PCR ile ilgili teorik bilgiyi primer dizaynında kullanır. 5   Total RNA izolasyonu, cDNA eldesi, genomik DNA eldesi , agaroz jel elektroforezi yapabilme becerilerine sahiptir 6   Kantitatif PCR'a yönelik hedef gen ve referans gen PCR larının optimizasyonunu yapar ve eksponansiyel PCR noktasını belirler. 7   Klasik PCR ile göreceli kantitasyon yapar ve sonuçları agaroz jel elektroforezinde ve dansitometrik olarak analiz eder. 8   Real-time PCR ile göreceli kantitasyon yapar ve sonuçlarını değerlendirir. 9   Gerek kit kullanarak gerekse manuel olarak genomik DNA nın bisulfit modifikasyon işlemini yapar, örnekleri saflaştırır, metilasyon spesifik PCR ve bilsülfit PCR yöntemlerini uygular. Sonuçları agaroz jel elektroforezinde analiz eder. 10   COBRA (combined bisulfite restriction analysis ) yöntemi ile metilasyon düzeyini değerlendirir. 11   Gen ekspresyonu protein düzeyinde western blotlama ve immunoboyama yöntemleri ile belirleyebilir

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama 1 Genomik DNA: organizasyon, izolasyon ve kantifikasyon 2 Genomik DNA: analiz yöntemleri (agaroz jel elektroforezi, Southern Blot, mutasyon analizleri: SSCP, PCR, sekanslama). 3 RNA regülasyonu 4 RNA isolasyonu 5 RNA analiz yöntemleri (agaroz jel elektroforezi, Northern Blot, RACE). 6 Gen Ekspresyonu 7 cDNA (sentez, yari-kantitatif PCR, qPCR) 8 Gen ekspresyon regülasyonu analizleri (EMSA, ChIP). 9 Recombinant DNA technology 10 vector cesitleri, klonlama plasmidleri (restriction enzim analizleri) 11 ekspresyon plasmidleri (bacterial, yeast, mammalian) 12 rekombinant plasmid oluşturma yöntemleri (RE kesimi, ligasyon, plasmid transformasyonu, plasmid izolasyonu, karakterizasyonu) 13 Rekombinant pretien uretimi (bakteri, maya, insect) 14 rekombinant protein purifikasyonu (HIs-tag, GST-tag, purifikasyon yontemleri) 15 Western blot

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

İlan Edilecektir.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Sunum: Temel teorik bilgiler sunum olarak verilecektir.

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL 1 PO Performans/Ödev 2 FN Final 3 BNS Başarı PO * 0.40 +FN*0.60 4 BUT Bütünleme Notu 5 BBN Bütünleme Sonu Başarı Notu PO * 0.40 + BUT*0.60

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

İlan Edilecektir.

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat) Ders Anlatımı 15 2 30 Vize Sınavına Hazırlık 1 10 10 Final Sınavına Hazırlık 1 10 10 Ödev Hazırlama 5 10 50 Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 15 3 45 Makale Hazırlama 5 10 50 Kavram Haritası Hazırlama 3 8 24 Final Sınavı 1 3 3 Vize Sınavı 1 3 3 TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 225

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK PK.1 PK.2 PK.3 PK.4 PK.5 PK.6 PK.7 PK.8 PK.9 PK.10 PK.11 PK.12 PK.13 PK.14 PK.15 PK.16 PK.17 PK.18 PK.19 PK.20 ÖK.1 5 4 3 ÖK.2 5 4 3 ÖK.3 4 4 3 ÖK.4 4 4 3 ÖK.5 4 4 3 ÖK.6 5 3 3 ÖK.7 4 3 3 ÖK.8 4 4 3 ÖK.9 5 4 3 ÖK.10 5 4 3 ÖK.11 4 4 3