Dokuz Eylül Üniversitesi Ders Katoloğu / Bilgi Paketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Ders Türü	D	U	L	AKTS
KIM 6114	Protein Kinaz C	SEÇMELİ	3	0	0	7

Dersi Veren Birim

Fen Bilimleri Enstitüsü

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

PROF. DR. MUSTAFA YAVUZ ERGÜN

Dersi Alan Birimler

Biyokimya Yüksek Lisans
Kimya Doktora
Kimya Bütünleşik Doktora
Biyokimya Doktora

Dersin Amacı

Bu ders kapsamında, protein fosforilasyon reaksiyonları ve protein kinazlar, PKC izotipleri ve tanımlanması, PKC C1 bölgesinn yapısı ve membrana bağlanmaları, PKC C2 bölgesinin yapısı ve membrana bağlanmaları, membran, protein etkileşimleri ve fosforilasyon ile PKC nin regülasyonu, PKC nin downregülasyonu ve mayalarda PKC nin rolünün yanı sıra atipik PKC sinyalinin spesifik rolünün detaylı olarak incelenmesi hedeflenmektedir.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1	Protein fosforilasyon reaksiyonlarını ve protein kinazları değerlendirir,
2	PKC izoenzimlerini bilir ve tanımlar,
3	PKC C1 ve C2 bölgelerinin yapısını ve membrana bağlanmasını, membran, protein etkileşimleri ve fosforilasyon ile PKC nin regülasyonunu ve PKC nin downregülasyonunu anlar,
4	PKC nin mayalardaki rolünü kavrar,
5	Atipik PKC nin spesifik rolü hakkında bilgi sahibidir.

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta	Konular	Açıklama
1	Giriş 1.1. Protein fosforilasyon reaksiyonları 1.2. Protein kinazlar
2	Protein Kinaz C 2.1. PKC izotipleri 2.2. Protein kinaz C lerin tanımlanması
3	C1 Bölgelerinin Yapı, Fonksiyon ve Membranla İlişkisi 1 3.1. C1 bölge yapısı ve stereospesifik ligand tanıma 3.2. Membrana bağlanmaları ve hücre içi lokalizasyonları
4	C1 Bölgelerinin Yapı, Fonksiyon ve Membranla İlişkisi 2 4.1. PKC dışında proteinlerdeki tipik C1 bölgeleri 4.2. Atipik C1 bölgeleri 4.3. Çoklu bölge içeren sinyal proteinlerinde C1 bölgeleri
5	C2 Bölgelerinin Yapısal ve Fonksiyonel Özellikleri 5.1. C2 bölgesinin yapısı 5.2. C2 bölgesinin ligandlarla etkileşimi 5.3. C2 bölgesi ile PKC nin membran hedeflerine bağlanması
6	Membran Etkileşimleri ile PKC nin Regülasyonu 6.1. PKC ve lipid sinyal yolu 6.2. Kofaktörleri: fosfotidilserin, diaçilgliserol ve Ca+2 6.3. PKC nin hücre içi lokalizasyonunu belirleyen fosforilasyon
7	Protein etkileşimleri ile PKC nin Regülasyonu 7.1. PKC bağlayan proteinler
8	Ara Sınav
9	Fosforilasyon ile PKC nin Regülasyonu 1 9.1. Aktivasyon bölgesinde fosoforilasyon 9.2. Turn motifte fosforilasyon 9.3. Hidrofobik bölgede fosforilasyon
10	Fosforilasyon ile PKC nin Regülasyonu 2 10.1. Fosfoinosit 3-kinaz yolunda rolü 10.2. Defosforilasyonun regülasyonu
11	Fosforilasyon ile PKC nin Regülasyonu 3 11.1. Hücresel fonksiyonda rolü 11.2. Tirozin fosforilasyonu ile PKC nin regülasyonu
12	PKC nin Downregülasyonu 12.1. Proteolitik mekanizma 12.2. Downregülasyonun rolü
13	Mayalarda PKC: Hücre Duvarı Geçirgenliği Yolu 13.1- Maya PKC homologları 13.2- Rho GTPazlar ve PKC aktivasyonu 13.3- Hücre geçirgenliği yolu ve hücre siklusu
14	Öğrenci sunumları

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Ana kaynak: Dekker, L.V. (ed.), 2004, Protein Kinase C, Plemum Publisher: 191 p.
Yardımcı kaynaklar: Kazanietz, M.G. (ed.), 2010, Protein Kinase C in Cancer Signalling and Therapy, Springer, 485 p.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

1. Sunum
2. İnteraktif anlatım
3. Soru cevap tekniği
4. Ödev verme

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO	KISA KOD	UZUN ADI	FORMUL
1	ODV	ÖDEV
2	ARS	ARASINAV
3	YSS	YIL SONU SINAVI
4	YSBN	YIL SONU BAŞARI NOTU	ODV * 0.30 + ARS * 0.30 + YSS * 0.40
5	BUT	BÜTÜNLEME
6	BUTBN	BÜTÜNLEME SONU BAŞARI NOTU	ODV * 0.30 + ARS * 0.30 + BUT * 0.40

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Sunumlarda verilen temel kavramları anlamlı öğrenmesi, kavramların birbirleri ile ilişkilendirmesi, sebep-sonuç ilişkilerini kurulabilmesi ve soru veya problemlere yönelik mevcut bilgilerini kullanarak yorum yapabilmesi ve fikir üretiminin değerlendirilmesi ara sınav, final sınavı, ödevlerle gerçekleştirilecektir.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

hulya.kayali@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Çarşamba 13.30 15.30

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler	Sayısı	Süresi (saat)	Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı	13	3	39
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar	13	3	39
Vize Sınavına Hazırlık	1	10	10
Final Sınavına Hazırlık	1	20	20
Ödev Hazırlama	2	15	30
Sunum Hazırlama	2	15	30
Final Sınavı	1	2	2
Vize Sınavı	1	2	2
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat)			172

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK	PK.1	PK.2	PK.3	PK.4	PK.6	PK.8	PK.9	PK.10	PK.11
ÖK.1	5	5	5	5	5	5	5
ÖK.2	5	5	5	5	5	5	5
ÖK.3	5	5	5	5	5	5	5
ÖK.4	5	5	5	5	5	5	5
ÖK.5		5	5	5	5	5	5	5	5

DERS ADI

DERECE PROGRAMLARI