Dokuz Eylül Üniversitesi Ders Katoloğu / Bilgi Paketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Ders Türü	D	U	L	AKTS
BYL 6009	Kodlamayan RNA'lar	SEÇMELİ	3	0	0	5

Dersi Veren Birim

Fen Bilimleri Enstitüsü

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

DOÇ. DR. ERGİN ŞAHİN

Dersi Alan Birimler

Biyoloji Doktora
Biyoloji Yüksek Lisans

Dersin Amacı

Kodlama yapmayan RNA ların transkripsiyonel ve translasyonel seviyelerde gen düzenleme, katalitik aktivite ve kendini eşlenme gibi biyolojik işlevlerinin öğrenilmesi. Kodlama yapmayan RNA ların farklı hastalıklarla ilişkilerinin öğrenilmesi.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1	1. RNA Dünyası Hipotezini Kavramak
2	2. RNA ların farklı katalitik aktiviteleri hakkında bilgi sahibi olmak
3	3. RNA lardan kendi kendini kesip çıkaran katalitik intronlar hakkında bilgi sahibi olmak
4	4. Farklı küçük kodlamayan RNA ların özellikleri ve işlevleri hakkında bilgi sahibi olmak
5	5. Uzun kodlamayan RNA ların özellikleri ve işlevleri hakkında bilgi sahibi olmak
6	6. Riboşalter lerin özellikleri ve gen regülasyonundaki işlevlerinin öğrenilmesi
7	7. Viroid ve virüs benzeri uydu RNA lar hakkında bilgi sahibi olmak

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta	Konular	Açıklama
1	RNA Dünyası Hipotezi
2	RNA ların Katalitik Özellikleri
3	Grup I İntronlar
4	Grup II İntronlar
5	Küçük Engelleyici RNA ların (siRNA) Biyolojik İşlevleri
6	Mikro RNA ların (miRNA) Biyolojik İşlevleri
7	Piwi ile etkileşen RNA ların (piRNA) Biyolojik İşlevleri
8	Küçük Çekirdekçik RNA ların (snoRNA) Biyolojik İşlevleri
9	Küçük Çekirdek RNA ların (snRNA) Biyolojik İşlevleri
10	CRISPR RNA (crRNA), Trans etkinleştirici RNA (tracrRNA) ve rehber RNA ların (gRNA) Biyolojik İşlevleri
11	Uzun Kodlamayan RNA ların (LncRNA) Biyolojik İşlevleri
12	Riboşalterler
13	Viroidler ve Virüs Benzeri Uydu RNA lar
14	GlikoRNA ların Biyolojik İşlevleri

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

- Walter, N., Woodson, S. A., & Batey, R. T. (Eds.). (2008). Non-protein coding RNAs (Vol. 13). Springer Science & Business Media.
- Khalil, A. M., & Coller, J. (Eds.). (2013). Molecular biology of long non-coding RNAs. New York: Springer.
- Yarus, M. (2010). Life from an RNA world: the ancestor within. Harvard University Press.
- Soukup, G. A. (2013). Catalytic RNA. Academic Press.
- Breaker, R. R. (2012). Riboswitches and the RNA world. Cold Spring Harbor perspectives in biology, 4(2), a003566.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Sunum, konu anlatımı, makale tartışma, soru ve cevap tekniği

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO	KISA KOD	UZUN ADI	FORMUL
1	ARS	ARASINAV
2	YSS	YIL SONU SINAVI
3	YSBN	YIL SONU BAŞARI NOTU	ARS * 0.40 + YSS * 0.60
4	BUT	BÜTÜNLEME
5	BUTBN	BÜTÜNLEME SONU BAŞARI NOTU	ARS * 0.40 + BUT * 0.60

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Öğrenci ara sınav ve yarıyıl sonu sınavında sorulacak sorular ile değerlendirilecektir.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

Dönem boyunca derslerin %70'ine devam etme sorumluluğu öğrenciye aittir. Ders saati ile ilgili belirtilen zamana uyulmalıdır. Derslerde ve sınavlarda meydana gelebilecek etik-dışı davranışlar konusunda ilgili yönetmelik çerçevesinde hareket edilecektir. D.E.Ü. Fen Fakültesi öğretim ve sınav uygulama esasları yönetmeliğini http://web.deu.edu.tr/fen adresinden temin edebilirsiniz.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

e-posta: ergin.sahin@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Daha sonra ilan edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler	Sayısı	Süresi (saat)	Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı	14	3	42
Final Sınavına Hazırlık	1	10	10
Vize Sınavına Hazırlık	1	6	6
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar	14	4	56
Final Sınavı	1	3	3
Vize Sınavı	1	2	2
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat)			119

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK	PK.1	PK.2	PK.3	PK.5	PK.6	PK.7	PK.11
ÖK.1	5	4				3	5
ÖK.2	4	4	5	4	4	3	5
ÖK.3	5	4	5	4	4	3	5
ÖK.4	4	5	5	4	4	3	5
ÖK.5	4	5	5	4	4	3	5
ÖK.6	4	5	5	4	4	3	5
ÖK.7	5	4	5	4	4	3	5

DERS ADI

DERECE PROGRAMLARI