Dokuz Eylül Üniversitesi Ders Katoloğu / Bilgi Paketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Ders Türü	D	U	L	AKTS
BYT 6011	Deniz Toksinleri	SEÇMELİ	3	0	0	8

Dersi Veren Birim

Fen Bilimleri Enstitüsü

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

PROF. DR. LEVENT ÇAVAŞ

Dersi Alan Birimler

Biyoteknoloji Doktora
Biyoteknoloji Bütünleşik Doktora
Biyoteknoloji Yüksek Lisans

Dersin Amacı

Deniz toksinleri, varyasyonları ve yüksek derecede yapısal farklılıklarından dolayı deniz ekosisteminde önem taşımaktadırlar. Deniz toksinleri üzerine yapılan kapsamlı araştırmalardan sonra, bu toksinlerin eczacılık, tıp ve kozmetik gibi pekçok endüstriyel alanda kullanılabileceği ya da taklit edilebileceği açıktır.
Ders, deniz toksinlerinin kısa bir tanıtımı ile başlayacak ve konotoksinler, sodyum kanal inhibitörleri, deniz anemon toksinleri, iyonotropik glutamat reseptörleri, nörotransmitter salınım inhibitörleri, aktin-mikrotübül etkileyen inhibitörleri, protein fosfataz 1 ve 2 inhibitörlerinin kanserojen yönleri, Caulerpales sekonder metabolitleri ve deniz toksin analizleri ile ilgili detaylar verilecektir. Bununla birlikte, dersin ilk haftasında öğrenciler deniz toksinleri ile ilgili yayınlanmış bir makale seçip dersin bitiminde sunacaklardır.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1	Dersin, öğrencilere; canlılardan elde edilen toksinlerin yapılarının anlaşılması,
2	Canlılardan elde edilen toksinlerin metabolic etkilerinin anlaşılması,
3	Bu toksinlerin ekosistemde nasıl önemli rol oynadıklarının örneklerle verilmesi,
4	Öğrencilerin, deniz toksinleri ile ilgili analitik yetenekleri ve düşüncelerinin gelişmesi,
5	Öğrencilerin, deniz toksinleri ile ilgili sunum ve eleştiri yeteneklerinin gelişmesi konularında yardımcı olması hedeflenmektedir.

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta	Konular	Açıklama
1	Deniz toksinlerine genel bakış 1.1.Giriş 1.2.Deniz siyanobakteri ve dinoflagellata den toksinler 1.3.Makroalg ve süngerlerden toksinler 1.4.Solucan ve sölenteralardan toksinler
2	Konotoksinler: Moleküler ve terapötik hedefler 2.1. Kalsiyum kanalı inhibitörleri ve sodium kanal modulatörleri 2.2. Potasyum kanalı inhibitörleri 2.3. Nikotinik Asetilkolin Reseptör Antagonistleri 2.4. NMDA Reseptör Antagonistleri
3	Sodyum Kanalını İnhibe Eden Deniz Toksinleri-1 3.1. Giriş 3.2. Sodyum kanalları ve evrimsel başlangıçları 3.3. Sodyum Kanal İnhibitörleri Saksitoksin ve Tetrodotoksin
4	Sodyum Kanalını İnhibe Eden Deniz Toksinleri-1 4.1. Sodyum kanalı ve toksinler arasındaki etkileşim 4.2. Sodyum kanal fonksiyonlarını inhibe eden diğer deniz toksinleri 4.3. Toksinlerin biyomedikal potansiyelleri
5	Potasyum kanallarını etkileyen deniz anemone toksinleri 5.1. Giriş 5.2. K+ kanal yapıları 5.3. Deniz anemone K kanalı toksinlerinin saflaştırılması ve sentezi 5.4. Deniz anemone K+ kanalı toksinlerinin yapıları
6	İyonotropik glutamate reseptörleri için ligandlar 6.1. Giriş 6.2. İyonotropik glutamate reseptörleri 6.3. AMPA/Kainat reseptör ligandları: Kainoids 6.4. NMDA reseptör ligandları: Aminoasitler 6.5. NMDA reseptör ligandları: Conantoksinler
7	Nörotransmitter salınımını etkileyen potansiyel deniz toksinleri 7.1. Giriş 7.2. Gözenek Oluşturan Aktiviteye Sahip Nörotoksinler 7.3. Na+ kanallarını etkileyen nörotoksinler 7.4. Lipid metabolizması üzerine eki eden nörotoksinler
8	Vize Öncesi Genel Tekrar
9	Aktin filamentlerini ve mikrotubuleri etkileyen toksinler 9.1. Giriş 9.2. Aktin filamentlerini etkileyen toksinler 9.3. Mikrotubuleri etkileyen toksinler
10	Protein fosfataz 1 ve 2A inhibitörlerinin karsinojenik yönleri 10.1. Giriş 10.2. Tarihsel bakış açıları 10.3. PP1 ve PP2A inhibitörleri 10.4. Tumor Oluşum ve Kanserojen Aktiviteleri
11	İnvazif Caulerpa spp. Den sekonder metabolit eldesi 11.1. Kaulerpen 11.2. Kaulerpin 11.3. Kaulersin 11.4. Ekolojik etkileri
12	Deniz toksin analizleri 12.1. Deniz toksin analizlerinde kullanılan araç-gereçler 12.2. Deniz toksin analizlerinde kullanılan yöntemler 12.3. Hedef ve hedef olmayan organizmalar üzerinde deniz toksinlerinin toksisiteleri
13	Öğrenciler tarafından deniz toksinleri üzerine yeni araştırmaların sunumu
14	Ödev ve Sunumlar

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Ana kaynak: Fusetani, N., Kem W., Marine Toxins as Research Tools, Springer, USA, 2009.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

1. Sunum
2. Soru cevap tekniği
3. Ödev verme

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO	KISA KOD	UZUN ADI	FORMUL
1	ARS	ARASINAV
2	ODV	ÖDEV
3	SUN	SUNUM
4	YSS	YIL SONU SINAVI
5	YSBN	YIL SONU BAŞARI NOTU	ARS* 0.30 + ODV * 0.20 + SUN * 0.10 + YSS * 0.40
6	BUT	BÜTÜNLEME
7	BUTBN	BÜTÜNLEME SONU BAŞARI NOTU	ARS* 0.30 + ODV * 0.20 + SUN * 0.10 + BUT * 0.40

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Sunumlarda verilen temel kavramları anlamlı öğrenmesi, kavramların birbirleri ile ilişkilendirmesi, sebep-sonuç ilişkilerini kurulabilmesi ve soru veya problemlere yönelik mevcut bilgilerini kullanarak yorum yapabilmesi ve fikir üretiminin değerlendirilmesi ara sınav, final sınavı, ödev ve sunumlarla gerçekleştirilecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

Dokuz Eylül Üniversitesi, Fen Fakültesi, Kimya Bölümü
lcavas@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Çarşamba 13.30 - 15.30

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler	Sayısı	Süresi (saat)	Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı	14	3	42
Haftalık ders öncesi/sonrası hazırlıklar (ders materyallerinin, makalelerin okunması vb.)	12	3	36
Vize sınavına hazırlık	1	35	35
Final sınavına hazırlık	1	40	40
Ödev ve sunum hazırlama	1	35	35
Vize Sınavı	1	2	2
Final Sınavı	1	2	2
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat)			192

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK	PK.1	PK.2	PK.3	PK.4	PK.5	PK.6
ÖK.1	5	5	4	4	5	4
ÖK.2	5	3	5	4	4	5
ÖK.3	5	4	3	4	4	4
ÖK.4	5	5	4	4	5	3
ÖK.5	5	4	5	4	5	3

DERS ADI

DERECE PROGRAMLARI