• ANASAYFA
• ÜNİVERSİTE HAKKINDA
  • İsim - Adres
  • Genel Bilgi
  • Üniversite Yönetimi
  • Akademik Takvim
  • Derece Programları
  • Yabancı Dilde Eğitim Veren Birimler
  • Genel Kabul ve Kayıt Koşulları
  • Kredi Hareketliliği ve Önceki Öğrenmenin Tanınması
  • AKTS Kredilerinin Belirlenmesi
  • Akademik Danışmanlık
  • İletişim
• DERECE PROGRAMLARI
  • Doktora Programları
  • Yüksek Lisans Programları
  • Lisans Programları
  • Önlisans Programları
• ÖĞRENCİ İÇİN GENEL BİLGİLER
  • Yaşam Standardı
  • Barınma
  • Beslenme
  • Sağlık
  • Engelli İçin Olanaklar
  • Sigorta
  • Finansal Destekler
  • Öğrenci İşleri Daire Başkanlığı
  • Uluslararası Öğrenciler için Pratik Bilgiler
  • Dil Kursları
  • Staj Olanakları
  • Sportif, Sosyal ve Kültürel Faaliyetler
  • Öğrenci Toplulukları ve Kulüpler
  • İzmir-Türkiye Hakkında
• ULUSLARARASI İLİŞKİLER
  • Dış İlişkiler Koordinatörlüğü
  • Kayıt İşlemleri
  • Anlaşmalar
  • Koordinatörler
  • Belgeler
  • Yabancı Dilde Eğitim Veren Birimler
  • AKTS/DE Etiketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS CSE 5005 Biyo-enformatik Algoritmaları SEÇMELİ 3 0 0 9

Dersi Veren Birim

Fen Bilimleri Enstitüsü

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

DOÇ. DR. ZERRİN IŞIK

Dersi Alan Birimler

Bilgisayar Mühendisliği Tezsiz Yüksek Lisans (İngilizce) Bilgisayar Mühendisliği Bütünleşik Doktora (İngilizce) Bilgisayar Mühendisliği Yüksek Lisans (İngilizce) Bilgisayar Mühendisliği Doktora (İngilizce) Bilgisayar Mühendisliği Tezsiz Yüksek Lisans (İ.Ö) (İngilizce) Biyomedikal Teknolojiler Yüksek Lisans (İngilizce) İleri Biyomedikal Teknolojiler Sanayi Ortak Doktora İleri Biyomedikal Teknolojiler Sanayi Ortak Bütünleşik Doktora

Dersin Amacı

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Farklı biyolojik veriler için, veri tiplerini ve veri yapılarını tanımlayabilme 2   Biyolojik veri işleme için olasılıksal ve istatiksel yöntemleri tanımlayabilme 3   Biyolojik veri analizi için gözetimli ve gözetimsiz öğrenme yöntemlerini tanımlayabilme 4   Biyoenformatik analizlerin klinik ihtiyaçlarına göre veri işleme problemlerini çözebilme 5   Farklı veri analizi yöntemlerini Biyoenformatik alanındaki gerçek problemlere uygulayabilme

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama 1 Biyoenformatiğe Giriş, Biyoloji Tekrarı (DNA, RNA, Protein, Hücre Bileşenleri 2 Sekans Hizalama Problemine Giriş 3 Dinamik Proglamlama ile Global ve Lokal Sekans Hizalama 4 Çoklu Sekans HizalamaÇoklu Sekans Hizalama 5 Filogenetik Ağaç Rekonstrüksiyonu 6 Protein Biyoenformatiği 7 ARASINAV 8 Ham Mikrodizi Veri Analizi 9 Gen İfadelerinin Fonksiyonel Etiketlemesi 10 Biyolojik Ağ ve Yolak Analizi 11 Kümeleme Algoritmalarının Uygulamaları 12 Alt-Tür Tespiti için Gözetimli Öğrenme 13 Yaşam Süresi Tahmini için Gözetimli Öğrenme 14 Biyoişaretçi Tahmini için Gözetimli Öğrenme 15 Öğrenci Sunumları

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

İlan Edilecektir.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Dersler Literatür Araştırması Ödevler Dönem Projesi Sunumu

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL 1 ARS ARASINAV 2 ODV ÖDEV 3 AOD ARAŞTIRMA ÖDEVİ 4 DKT DERSE KATILIM 5 YSBN YIL SONU BAŞARI NOTU ARS* 0.20 +ODV * 0.20 + AOD * 0.50 + DKT * 0.10

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

İlan Edilecektir.

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat) Ders Anlatımı 14 3 42 Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 14 2 28 Vize Sınavına Hazırlık 1 20 20 Ödev Hazırlama 3 20 60 Sunum Hazırlama 1 50 50 Diğer (Atölye, Laboratuvar vb. kapsamındaki çalışmalar) 4 6 24 Vize Sınavı 1 3 3 TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 227

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK PK.1 PK.2 PK.3 PK.4 PK.5 PK.6 PK.7 PK.8 PK.9 PK.10 PK.11 ÖK.1 4 4 ÖK.2 4 4 3 ÖK.3 4 4 3 ÖK.4 4 5 5 4 4 3 3 3 3 3 ÖK.5 4 5 5 4 5 3 3 4