Dokuz Eylül Üniversitesi Ders Katoloğu / Bilgi Paketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Ders Türü	D	U	L	AKTS
BYL 5050	Moleküler Sistematik	SEÇMELİ	2	2	0	6

Dersi Veren Birim

Fen Bilimleri Enstitüsü

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

DOÇ. DR. KAMİL CANDAN

Dersi Alan Birimler

Biyoloji Doktora
Biyoloji Yüksek Lisans

Dersin Amacı

Genetiksel soy hatlarının tespitini yaparak türler arası akrabalık ilişkilerinin ve türleşme örüntülerinin ortaya çıkarılmasını öğretmeyi amaçlamaktadır.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1	Moleküler belirteçlere dayalı sistematik yapılandırmayı kavramak
2	Filogenetik çıkarımın mantığını öğrenmek
3	Moleküler belirteçleri tanımak
4	DNA veri setlerini biyoinformatik yöntemlerle işleyebilmek
5	Filogenetik analiz yöntemlerini uygulayabilmek
6	Türlerin evrimsel örüntülerini takip edebilmek

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta	Konular	Açıklama
1	Moleküler sistematiğin temel prensipleri
2	Genomun yapısı ve düzenlenişi
3	Moleküler belirteçler
4	DNA dizilime teknikleri
5	DNA veri dosyalarının oluşturulması ve düzenlenmesi
6	Nükleotid değişim modellerinin tespiti
7	Genetik uzaklığın hesaplanması
8	Ara Sınav
9	Filogenetik analizler: Neighbor-Joining, Maximum Likelihood
10	Filogenetik analizler: Maximum Parsimony, Bayesian Inference
11	Tür ağacı analizleri
12	Haplotip dağılımlarının network analizi ile oluşturulması
13	Türlerin ayrılma zamanlarının hesaplanması
14	Türkiye deki sürüngen türlerinin moleküler sistematiği

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

- Yang Z. 2014, Molecular Evolution: A Statistical Approach, Oxford University Press
- Lemey P., Salemi M., and Vandamme A. 2009, The Phylogenetic Handbook, Cambridge University Press.
- Konuyla ilgili örnek bilimsel makaleler

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Sunum, konu anlatımı, makale tartışma, soru ve cevap tekniği.

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO	KISA KOD	UZUN ADI	FORMUL
1	ARS	ARASINAV
2	YSS	YIL SONU SINAVI
3	YSBN	YIL SONU BAŞARI NOTU	ARS * 0.40 + YSS * 0.60
4	BUT	BÜTÜNLEME
5	BUTBN	BÜTÜNLEME SONU BAŞARI NOTU	ARS * 0.40 + BUT * 0.60

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Öğrenci ara sınav ve yarıyıl sonu sınavında sorulacak sorular ile değerlendirilecektir.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

Daha sonra ilan edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

kamil.candan@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri