DERS ADI

: Biyoteknolojide Moleküler Araçların Kullanımı

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
BYL 5080 Biyoteknolojide Moleküler Araçların Kullanımı SEÇMELİ 2 2 0 5

Dersi Veren Birim

Fen Bilimleri Enstitüsü

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

DOÇ. DR. ERGİN ŞAHİN

Dersi Alan Birimler

Biyoloji Doktora
Biyoloji Yüksek Lisans

Dersin Amacı

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   1. Biyoteknolojinin önemini, tanımını ve kullanım alanlarını öğrenir.
2   2. Biyoteknolojide kullanılan rekombinant DNA teknolojilerini ve genetik yöntemleri bilir.
3   3. Gen klonlamasında kullanılan vektör sistemlerini, konakları ve klonlama stratejilerini öğrenir.
4   4. Biyoteknolojiyi genomik ve proteomik ile ilişkilendirir.
5   5. Gen mühendisliğinin biyoteknolojiye kazandırdığı yeni boyutlar hakkında bilgi edinir.
6   6. Biyoteknojinin uygulama alanları ve ahlaki yönu (etiği) hakkında bilgi sahibi olur.

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Biyoteknoloji, Genetik Mühendisliği, Moleküler Biyoloji ve Rekombinant DNA teknolojisi terimlerinin tanımı, Rekombinant DNA teknolojisinde kullanılan model organizmalar, Genetik mühendisliği ile gen manipulasyonlarının temelini oluşturan yöntemlere giriş, Restriksiyon modifikasyon sistemleri, çeşitleri ve kullanım alanları Klonlama konakları ve klonlamada kullanılan vektör sistemleri
2 1. nesil Plazmid vektörler (PBR322), Yeni nesil Plazmid vektörler (Puc18), Ti plazmid vektörü, Yer değiştirme vektörleri olan Lamda bakteriyofaj vektörleri (Charon 4A ve 16), Faj M13 vektörü (M13mp18), Kozmidler (pJB8)
3 Bakteriyel Yapay Kromozomlar (pBAC 108L), Maya Yapay Kromozomlar (pYAC3), Mekik vektörler, Füzyon vektörler, Ekspresyon (ifade) vektörleri (pse420, pet
4 Retroviral vektörler (MLV ve SAX), Adenoviral vektörler ve Baculovirus ekspresyon vektör sistemi (BEVS), Vektör sistemlerinin karşılaştırılması, Memeli ve bitkisel konak hücrelerine gen aktarımı
5 Raportör genler, DNA diizilemesi, hibridizasyon, gen çipleri, PCR ve Southern Blotting tekniklerini kullanarak doğru gen klonunu bulma, Prokaryotlarda gen aktarım mekanizmaları (Konjugasyon, transdüksiyon, transformasyon, transpozisyon ve elektroporasyon yöntemleri), Transformasyondan önce kompetent E.coli yapımı
6 Poliakrilamid ve agaroz jel elektroforezi ile DNA ve proteinlerin ayrıştırılması, Restriksiyon kesimi ile bir genin restriksiyon haritasının çıkarılması
7 Primer ve prob yapımında katı faz yöntemiyle DNA nın kimyasal sentezi, Klonlamada Southern blotting yönteminin kullanılması, Polimeraz zincir reaksiyonu ve kullanım alanları
8 Sanger dideoksi nükleotid yöntemiyle metodu ile DNA dizi analizi, Gen klonlama, lambda fajı veya plazmid bir vektörle klonlama stratejileri ve kullanım amaçları, Nükleik asit probu ile klon seçimi
9 Reverse transkripsiyon ile cDNA sentezi, Genomik kütüphaneler veBir genomu taşıyabilmek için gereken klonların sayısı, Kromozom ve cDNA kütüphaneleri, Transkriptom ve cDNA ile gen çipleri ile kullanım alanları, DNA dizilemesi ve biyoinformatik
10 Filogenetik analizlerle genlerin evrimsel uzaklıklarının belirlenmesi, Tüm Genom dizilemesi yaklaşımları (klon-klon yöntemi, rastgele atış-shotgun yöntemi), Genom, Proteom, Transkriptom, Biyoinformatik, Genomik (Yapısal, işlevsel ve karşılaştımalı genomik) ve Proteomik (2-D jel elektroforezi ve Maldi-Toff analizleri)
11 Gen terapisi çalışmaları ve gelecekte gen terapide kullanım potansiyeli olan yeni viral vektörler, Hastalıkların teşhisinde ve mutant genotiplerin saptanmasında biyoteknolojik yaklaşımlar, Rekombinant İlaçlar ve İnsülin sentezi, Rekombinant aşılar, DNA aşıları, Yenilebilir aşılar
12 CRISPR genom düzenleme araçları ve biyomühendislik, tıp, veterinerlik ve ziraatteki kullanım alanları
13 Memelilerde zigota gen klonlama ve ilk klon koyun Dolly, GDO lu (Genetiği Değiştirilmiş Organizmalar) canlılar, Transgenik hayvanlar, pharming (eczacılık hayvanları)
14 Bitkilerde ve kurbağa embriyosunda gen klonlama, Transgenik bitkiler, Tİ-plazmidi İle gen aktarımı, GDO lu zirai bitkiler, Bitki biyoteknolojisinin sonuçları, Biyoteknojinin uygulamaları ve ahlaki yönu (Etiği)

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

İlan Edilecektir.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Sunum, konu anlatımı, makale tartışma, soru ve cevap tekniği

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL
1 ARS ARASINAV
2 YSS YIL SONU SINAVI
3 YSBN YIL SONU BAŞARI NOTU ARS * 0.40 + YSS * 0.60
4 BUT BÜTÜNLEME
5 BUTBN BÜTÜNLEME SONU BAŞARI NOTU ARS * 0.40 + BUT * 0.60


Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

İlan Edilecektir.

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 14 2 28
Uygulama 14 2 28
Final Sınavına Hazırlık 1 10 10
Vize Sınavına Hazırlık 1 6 6
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 13 4 52
Final Sınavı 1 3 3
Vize Sınavı 1 2 2
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 129

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6PK.7PK.8PK.9PK.10PK.11PK.12
ÖK.1544
ÖK.2445
ÖK.3544
ÖK.4455
ÖK.5455
ÖK.6445