Dokuz Eylül Üniversitesi Ders Katoloğu / Bilgi Paketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Ders Türü	D	U	L	AKTS
BYL 5072	Moleküler Ekoloji	SEÇMELİ	3	0	0	6

Dersi Veren Birim

Fen Bilimleri Enstitüsü

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

PROF. DR. FERHAT MATUR

Dersi Alan Birimler

Biyoloji Doktora
Biyoloji Yüksek Lisans

Dersin Amacı

Günümüzün populer alanı Moleküler Ekoloji hakkında temel bilgileri verip, moleküler verilerin yorumlanmasını sağlamak. Araştırmalarda kullanılan, teknikler ve kullanım alanlarını göstermek. Moleküler verileri ekolojik prensipler uygun yorumlamayı öğrenir.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1	Moleküler filogenetik ve ekolojik verileri birleştirerek birlikte yorumlamayı kavrar (Farklı bilim dallarını kullanarak amaçladığı sonuca ulaşır).
2	Çalıştığı organizmanın moleküler ekolojisi hakkında araştırma planlayabilir.
3	Çalıştığı organizmanın moleküler ekolojisi hakkında yorum yapabilir.
4	Moleküler Ekoloji hakkında temel bilgileri bilir.
5	Araştırmalarda kullanılan, teknikler ve kullanım alanlarını bilir.
6	Moleküler verileri ekolojik prensipler uygun yorumlamayı öğrenir.
7	Birçok, nükleik asit ve protein verisi gibi moleküler verileri kullanabilir.
8	Ekolojide kullanılan moleküler teknikleri bilir.
9	Prokaryotlarda ve ökaryotlarıda kullanılan moleküler çalışmaları bilir.

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta	Konular	Açıklama
1	Giriş; moleküler ekoloji nedir
2	DNA temel bilgiler, Tamir, replikasyon, mtDNA
3	Mutasyon
4	Moleküler evrim, filogenetik: DNA karakter gen ağaçları
5	Ağaç genelleme. Mesafe modelleri, maksimum parsimony, maksimum likelihood
6	Ağaç uygulamaları. Moleküler ekoloji çalışmaları
7	Haplotipten populasyona. Lineage sıralama, birleşme (coalesnecne), genealojik uyum (genealogical concordance)
8	Genetik çeşitlililk kaybı. HW eşitliği, rekombinasyon, mutasyon, sürüklenme, seçilim, yokolma
9	Genetik. Nötral teori, etkili pop. boyutu, pop. polimorfizim kaynakları
10	Genetik yapı. Çeşitliliğin ölçülmesi, pop. Genetik yapısı, f-istatistiği
11	Gen akışı ve gen yapısı. Wrights fst, gen akışı tahmini
12	Genetik geçişimin gösterimi. Fragment analizi, allozim RLP, AFLP, RAPD, SSCP. Minisatelit, microsatelit, snp
13	Genetik geçişimin gösterimi. Fragment analizi, allozim RLP, AFLP, RAPD, SSCP. Minisatelit, microsatelit, snp
14	Genetik geçişimin gösterimi. Fragment analizi, allozim RLP, AFLP, RAPD, SSCP. Minisatelit, microsatelit, snp

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Ders İçin Önerilen Kaynaklar:
Singh RS, Uyenoyama MK (2004). Evolution of population biology. Cambridge University press. Cambridge
Freeland JR (2005). Molecular ecology. John Wiley & Sons Ltd. Vest Suseks.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Ders, anlatım, sunum ve tartışma formatında öğretilir. Tüm öğrencilerin derslere katılarak, hem anlatım hem de tartışma oturumlarında yer alması gereklidir. Ders programının yanı sıra, grup sunumları o hafta için atanan gruplar tarafından hazırlanacak ve bir tartışma ortamı oluşturulacak şekilde sunulacaktır.

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO	KISA KOD	UZUN ADI	FORMUL
1	ARS	ARASINAV
2	ODV	ÖDEV
3	YSS	YIL SONU SINAVI
4	YSBN	YIL SONU BAŞARI NOTU	ARS * 0.30 + ODV * 0.20 +YSS * 0.50
5	BUT	BÜTÜNLEME
6	BUTBN	BÜTÜNLEME SONU BAŞARI NOTU	ARS * 0.30 +ODV * 0.20 + BUT * 0.50

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Öğrenci ara sınav, konu değerlendirme sınavı, ödev sunumu ve yarıyıl sonu sınavında sorulacak sorular ile değerlendirilecektir.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

Dönem boyunca derslerin %70'ine devam etme sorumluluğu öğrenciye aittir. Ders saatine ve ödev teslimi ile ilgili belirtilen zamana uyulmalıdır. Derslerde ve sınavlarda meydana gelebilecek etik-dışı davranışlar konusunda ilgili yönetmelik çerçevesinde hareket edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

ferhat.matur@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler	Sayısı	Süresi (saat)	Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı	14	3	42
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar	14	2	28
Vize Sınavına Hazırlık	1	14	14
Final Sınavına Hazırlık	1	14	14
Diğer Kısa Sınavlara Hazırlık	4	3	12
Ödev Hazırlama	14	2	28
Diğer (Atölye, Laboratuvar vb. kapsamındaki çalışmalar)	6	2	12
Final Sınavı	1	2	2
Vize Sınavı	1	2	2
Diğer Kısa Sınav	4	1	4
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat)			158

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK	PK.1	PK.2	PK.3	PK.4	PK.5	PK.6	PK.7	PK.8	PK.9	PK.10	PK.11	PK.12
ÖK.1	4		5	5	5			5	5		5	5
ÖK.2			5	5	5			5	5		5	5
ÖK.3	5	5	5	5	5	5	5	5	5	4	4
ÖK.4	5			5	5		5	5	5	5	5	5
ÖK.5	5			5	5		5			5	5
ÖK.6		5	5	5	5	5	5		4	5	5	5
ÖK.7	5	5			5	5		5	4		5	5
ÖK.8	5	5	4	4	5	5		5	4		5	5
ÖK.9	5			5	5			4			5	4

DERS ADI

DERECE PROGRAMLARI