• ANASAYFA
• ÜNİVERSİTE HAKKINDA
  • İsim - Adres
  • Genel Bilgi
  • Üniversite Yönetimi
  • Akademik Takvim
  • Derece Programları
  • Yabancı Dilde Eğitim Veren Birimler
  • Genel Kabul ve Kayıt Koşulları
  • Kredi Hareketliliği ve Önceki Öğrenmenin Tanınması
  • AKTS Kredilerinin Belirlenmesi
  • Akademik Danışmanlık
  • İletişim
• DERECE PROGRAMLARI
  • Doktora Programları
  • Yüksek Lisans Programları
  • Lisans Programları
  • Önlisans Programları
• ÖĞRENCİ İÇİN GENEL BİLGİLER
  • Yaşam Standardı
  • Barınma
  • Beslenme
  • Sağlık
  • Engelli İçin Olanaklar
  • Sigorta
  • Finansal Destekler
  • Öğrenci İşleri Daire Başkanlığı
  • Uluslararası Öğrenciler için Pratik Bilgiler
  • Dil Kursları
  • Staj Olanakları
  • Sportif, Sosyal ve Kültürel Faaliyetler
  • Öğrenci Toplulukları ve Kulüpler
  • İzmir-Türkiye Hakkında
• ULUSLARARASI İLİŞKİLER
  • Dış İlişkiler Koordinatörlüğü
  • Kayıt İşlemleri
  • Anlaşmalar
  • Koordinatörler
  • Belgeler
  • Yabancı Dilde Eğitim Veren Birimler
  • AKTS/DE Etiketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS CHE 4232 Biyoinformatiğe Giriş SEÇMELİ 2 0 0 4

Dersi Veren Birim

Kimya

Dersin Düzeyi

Lisans

Ders Koordinatörü

PROF. DR. LEVENT ÇAVAŞ

Dersi Alan Birimler

Kimya (İ.Ö) Kimya

Dersin Amacı

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Öğrenciler ilgili veribankalarından protein ve DNA FASTA sekanslarını bulabilirler. 2   Öğrenciler, çoklu dizinim analizi, katlanmamış bölge ve protein parametrelerini bulmak için uygun biyoinformatik analizleri gerçekleştirebilirler. 3   Öğrenciler membran helikslerini tahmin edebilir ve enzim aktif bölge ve reseptör-ligand etkileşimlerini görüntüleyebilirler. 4   Öğrenciler proteinlerdeki motifleri tahmin edebilir ve filogenetik ağaç çizebilirler.

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama 1 Biyoinformatiğe Giriş 2 Protein Veri Bankaları-1 (Uniprot, expasy) 3 Protein Veri Bankaları-2 (RSCB-Protein Data Bank) 4 DNA Veri Bankaları-1 5 DNA Veri Bankaları-2 6 In silico protein parametre analizi 7 Proteinlerde Doğal Katlanmamış Bölgeler 8 Genel Tekrar 9 Membran proteinlerinde membran helikslerinin tahmini 10 3boyutlu enzim aktif merkez görüntülenmesi (YASARA) 11 Reseptör-Ligand etkileşimleri (Auto-Dock Vina) 12 Filogenetik agaçların oluşturulması, motif ekstraksiyon araçları 13 Öğrenci ödev-proje sunumları 14 Öğrenci ödev-proje sunumları

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

İlan Edilecektir.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Sunum, İnteraktif sunum, sorular ve cevaplar, ödev, uygulama

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL 1 VZ Vize 2 OD Ödev 3 FN Final 4 BNS BNS VZ * 0.25 + OD * 0.35 + FN * 0.40 5 BUT BÜTÜNLEME 6 BUTBN BÜTÜNLEME SONU BAŞARI NOTU VZ * 0.25 + OD * 0.35 + BUT * 0.40

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Öğrencilere sınavlarda kozmetik ürünlerin içeriği ve üretim proseslerine yönelik .sorular sorulacaktır.

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

İlan Edilecektir.

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat) Ders Anlatımı 14 2 26 Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 11 1 13 Vize Sınavına Hazırlık 1 15 15 Final Sınavına Hazırlık 1 15 15 Ödev Hazırlama 1 30 30 Vize Sınavı 1 2 2 Final Sınavı 1 2 2 TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 103

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK PK.1 PK.2 PK.3 PK.4 PK.5 PK.6 PK.7 PK.8 PK.9 PK.10 PK.11 PK.12 PK.13 PK.14 PK.15 PK.16 PK.17 ÖK.1 5 3 4 1 5 5 3 3 5 5 5 5 5 ÖK.2 5 4 4 1 5 5 3 3 5 5 5 5 5 ÖK.3 5 3 4 1 5 5 3 3 5 5 5 5 5 ÖK.4 5 3 4 4 5 5 3 3 5 5 5 5 5