DERS ADI

: Biyoinformatik

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
BİY 2508 Biyoinformatik ZORUNLU 2 0 0 3

Dersi Veren Birim

Biyoloji (UOLP-Gence Devlet Üniversitesi)

Dersin Düzeyi

Lisans

Ders Koordinatörü

DOÇ. DR. KAMİL CANDAN

Dersi Alan Birimler

Biyoloji (UOLP-Gence Devlet Üniversitesi)

Dersin Amacı

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Biyoinformatik dizi analizi ve moleküler biyolojinin birçok konusu hakkında bir anlayışa sahip olmak
2   Ortak dizi analizi araçları ve veri tabanlarını kullanarak iyi bir beceri seti ve kapsamlı deneyime sahip olmak
3   Çeşitli dizi analizi problemlerine iyi bir şekilde maruz kalmak ve bunların nasıl çözüleceğini anlamak
4   Kendi sekans analiz problemlerini veya tasarım sekans analiz yazılımlarını çözebilir
5   Öğrendiklerini açık bir şekilde hazırlanmış belgeler veya kısa gösterilerde nasıl aktaracaklarını bilmek

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Giriş
2 Genomik diziler
3 Dizi analizi
4 Veri tabanı araması; BLAST
5 İleri seviye BLAST: PSI-BLAST, Genomik DNA. Bir gen projesi bulma
6 Çoklu dizi hizalama
7 genel tekrar
8 mRNA ve gen ekspresyonu
9 Farklılaşma analizleri ve çoklu testler
10 Dizi varyasyonları ve karşılaştırmalı genomik
11 Moleküler filogeni ve evrim
12 Makale tartışması
13 Makale tartışması
14 Makale tartışması

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

İlan Edilecektir.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Ders, anlatım, sunum ve tartışma formatında öğretilir. Tüm öğrencilerin derslere katılarak, hem anlatım hem de tartışma oturumlarında yer alması gereklidir. Ders programının yanı sıra, grup sunumları o hafta için atanan gruplar tarafından hazırlanacak ve bir tartışma ortamı oluşturulacak şekilde sunulacaktır.

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL
1 VZ Vize
2 FN Final
3 BNS BNS VZ * 0.40 + FN * 0.60
4 BUT BÜTÜNLEME
5 BUTBN BÜTÜNLEME SONU BAŞARI NOTU VZ * 0.40 + BUT * 0.60


Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

İlan Edilecektir.

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 14 2 28
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 14 1 14
Vize Sınavına Hazırlık 1 14 14
Final Sınavına Hazırlık 1 15 15
Final Sınavı 1 2 2
Vize Sınavı 1 2 2
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 75

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6PK.7PK.8PK.9PK.10PK.11PK.12PK.13PK.14
ÖK.145555555
ÖK.25555555
ÖK.355555
ÖK.45555555
ÖK.545555