DERS ADI

: Moleküler Makineler

DERECE PROGRAMLARI

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
BST 6006 Moleküler Makineler SEÇMELİ 3 0 0 12

Dersi Veren Birim

Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Doktora

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

DR. ÖĞR. ÜYESİ EZGİ KARACA EREK

Dersi Alan Birimler

Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Doktora

Dersin Amacı

Çeşitli biyolojik yaklaşımların gözünden yaşamın mekaniğinin kapsamlı bir şekilde anlaşılmasını sağlamak.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Moleküler makineler ve bileşenleri hakkında derinlemesine bilgi sahibi olmak
2   Moleküler makinelerin üç boyutlu yapılarına aşinalık kazanmak
3   Çeşitli moleküler makinelerin çalışmasını anlayabilmek ve tartışabilmek
4   Onkojenik mutasyonların moleküler makinelerin işleyişine etkisini kavrayabilme ve tartışabilme
5   Ektremofil enzimlerin yapı ve işlevlerine aşinalık
6   Hesaplamalı tasarım algoritmalarını anlayabilmek ve kullanabilme
7   İşaretleme makinelerini atomistik ölçekte yorumlayabilme
8   Atomistik ölçekte metabolizma makinelerinin yorumlanması
9   Mevcut tasarım stratejilerinin yeteneklerini ve sınırlarını tartışabilmek
10   Araştırma bulgularının sunumu

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Moleküler Dünya
2 Protein merkezli Moleküler Makinalar
3 Nükleik Asit Merkezli Moleküler Makinaları
4 Glikanlar ve Yağlar
5 Yaşam Süreci: Enerji ve Entropi
6 Önemli Moleküler Makinelere Örnekler - I
7 Önemli Moleküler Makinelere Örnekler - II
8 Ara SINAV
9 Sinyal Makinalarının İşleyişi
10 Metabolik Makinaların İşleyişi
11 Onkojenik Mutasyonların Moleküler Makinelerde Etkisi
12 Ekstremofilik dünya
13 Biyomoleküler Komplekslerin Tahmini, Mühendisliği ve Tasarımı - I
14 Biyomoleküler Komplekslerin Tahmini, Mühendisliği ve Tasarımı - II
15 Ödev Sunumları
16 Final Sınavı

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Ders İçin Önerilen Kaynaklar:
Machinery of Life, David Goodsell
Hardcover: 167 pages
Publisher: Copernicus; 2nd ed. 2009 edition (April 16, 2010)
Language: English
ISBN-10: 0387849246
ISBN-13: 978-0387849249

Introduction to Protein Structure, Carl Branden and John Tooze
Paperback: 424 pages
Publisher: Garland Science; 2 edition (January 3, 1999)
Language: English
ISBN-10: 9780815323051
ISBN-13: 978-0815323051

Lehninger Principles of Biochemistry
Hardcover: 1328 pages
Publisher: W.H. Freeman; Sixth edition (November 21, 2012)
Language: English
ISBN-10: 9781429234146
ISBN-13: 978-1429234146

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Powerpoint eşliğinde teorik sunumlar ve literatür gözden geçirme ve tartışma

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL
1 ODV Ödev/Dkat.
2 VZ Vize
3 FN Final
4 BNS FinalSonuBaşarıNotu ODV * 0.30 + VZ * 0.30 + FN * 0.40
5 BUT Bütünleme
6 BBN BütSonuBasarıNotu ODV * 0.30 + VZ * 0.30 + BUT * 0.40


Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

ezgi.karaca@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 14 3 42
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 14 8 112
Vize Sınavına Hazırlık 1 20 20
Final Sınavına Hazırlık 1 25 25
Ödev Hazırlama 2 35 70
Sunum Hazırlama 1 30 30
Vize Sınavı 1 5 5
Final Sınavı 1 5 5
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 309

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6PK.7PK.8
ÖK.1555
ÖK.25555
ÖK.35555
ÖK.45555555
ÖK.55555555
ÖK.655555555
ÖK.755555555
ÖK.855555555
ÖK.955555555
ÖK.1055555555

İLETİŞİM BİLGİLERİMİZ
Dokuz Eylül Üniversitesi Cumhuriyet Bulvarı No: 144 35210 Alsancak / İZMİR
Telefon: +90(232) 412 12 12 - Faks: +90 (232) 464 81 35

Copyright 2015 DEÜ. BİD

ANASAYFA / ÜNİVERSİTE HAKKINDA / DERECE PROGRAMLARI / ÖĞRENCİ İÇİN GENEL BİLGİLER / ULUSLARARASI İLİŞKİLER