DERS ADI

: Biyoinformatiğe Giriş

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
MBG 5025 Biyoinformatiğe Giriş SEÇMELİ 2 2 0 9

Dersi Veren Birim

Moleküler Biyoloji ve Genetik Yüksek Lisans

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

DR. ÖĞR. ÜYESİ ATHANASIA PAVLOPOULOU

Dersi Alan Birimler

Moleküler Biyoloji ve Genetik Bütünleşik Doktora
Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Yüksek Lisans
Moleküler Biyoloji ve Genetik Yüksek Lisans

Dersin Amacı

Bu ders, biyoenformatiğin ilkeleri ve işlemsel biyolojiyle beraber bunların uygulamalarına yönelik kavramları öğrencilere aktarmayı hedeflemektedir.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Biyoenformatiğin ve işlemsel biyolojinin ilkelerini açıklama
2   Belli başlı ana moleküler biyoloji veri bankalarını bilmek
3   Halka açık veri tabanlarından biyolojik bilgiye ulaşmak ve kullanmayı bilmek
4   Biyolojik sekans ve yüksek çıktılı veri analizinin ilkelerini bilmek
5   Moleküler biyolojideki sistem seviyesi biyoenformatik yaklaşımlarını temel düzeyde anlamak

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Biyoenformatik ve işlemsel biyolojinin temelleri
2 Biyolojik bilginin çeşitleri
3 Programlama dilleri ve veri tabanlarına giriş
4 Bibliyografik ve biyolojik sekans veri tabanları
5 Genom veri tabanları ve genom tarayıcıları
6 Protein ve protein yapısı veri tabanları
7 Sekans hizalama ve filogenetik ağaçlar - I
8 Ara sınav
9 Gen ekspresyonu ve regülasyonu
10 Yüksek çıktılı teknikler ve gen ekspresyonu veri tabanları
11 Biyolojik ontolojiler ve çevirim içi veri analiz araçları
12 Sistem biyolojisine giriş
13 Metabolik yolaklar ve etkileşim veri tabanları
14 Biyolojik veri entegrasyonun ilkeleri
15 Ödev sunumlar
16 Final sınavı

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Lesk, Arthur. Introduction to Bioinformatics. Fourth edition. Oxford University Press, 2013. ISBN: 9780199651566

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Power Point sunumla teorik ders anlatma ve öğrenci sunum ödevleri

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL
1 AS Arasinav
2 FN Final
3 BNS FinalSonuBaşarıNotu AS * 0.50 + FN * 0.50
4 BUT Bütünleme
5 BBN BütSonuBasarıNotu AS * 0.50 + BUT * 0.50


Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Daha sonra ilan edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

Daha sonra ilan edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

athanasia.pavlopoulou@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Daha sonra ilan edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 14 3 42
Uygulama 16 1 16
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 15 3 45
Vize Sınavına Hazırlık 1 20 20
Final Sınavına Hazırlık 1 35 35
Ödev Hazırlama 10 5 50
Sunum Hazırlama 4 5 20
Final Sınavı 1 2 2
Vize Sınavı 1 2 2
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 232

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6PK.7PK.8
ÖK.14
ÖK.232
ÖK.32
ÖK.42
ÖK.54