DERS ADI

: Genetik Olarak Değiştirilmiş Hayvan Modelleri

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
MBG 6127 Genetik Olarak Değiştirilmiş Hayvan Modelleri SEÇMELİ 3 0 0 12

Dersi Veren Birim

Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

DOÇ. DR. MUHAMMED KASIM DİRİL

Dersi Alan Birimler

Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora
Moleküler Biyoloji ve Genetik Bütünleşik Doktora

Dersin Amacı

Bu dersin amacı, fonksiyonel genomik ve beşeri hastalıkların araştırılmasında kullanılan genetiği değiştirilmiş hayvan modellerinin tasarımı ve oluşturulmasının prensiplerinin öğretilmesidir. Öğrenciler, bilimsel araştırma makalelerini okuyup derinlemesine anlayacaklar ve sınıfta sunum yaparak tartışacaklardır. Seçtikleri konuda araştırma projesi önerisi hazırlamayı, PubMed taraması yapıp sonuçları derleme makalesi şeklinde yazmayı öğreneceklerdir.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Temel hayvan genetiği ve farklı inbred ırklarını anlamalı,
2   Transgenik hayvanların nasıl oluşturulduğunu öğrenmeli,
3   Embriyonik kök hücrelerin biyolojisini ve kültür tekniklerini anlamalı,
4   CRISPR teknolojisini kullanarak gen knockout ve knockin dizaynı yapabilmeli,
5   Modifiye alelleri birleştirerek, birden fazla aleli taşıyan hayvan modellerinin nasıl üretildiğini anlamalı,
6   Genetiği değiştirilmiş hayvan modelleri ve bunların fonksiyonel genomik araştırmalarda ve preklinik araştırmalar için yeni alanların oluşturulmasında nasıl kullanıldığı konusunda bilgi sahibi olmalı,
7   Beşeri hastalık araştırmalarında kullanılan farklı genetiği değiştirilmiş hayvan modelleri ve ile ilgili literatürü anlamalı ve değerlendirebilmeli,
8   Sunum yeteneklerini geliştirmeli,
9   Pubmed gibi online kütüphanelerde internet üzerinden arama yapma yetisini kazanmalıdırlar.

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Giriş
2 Klasik genetik ve laboratuvar hayvanı üretim yöntemleri
3 İnbred ırkların oluşturulması ve kullanımı
4 DNA enjeksiyonu ile transgenik üretiminin prensipleri
5 Embriyonik kök hücre kültürünün biyolojisi- Makale tartışması
6 CRISPR ile gen knockout ve knockin- Makale tartışması
7 CRISPR ile gen knockout ve knockin- Makale tartışması
8 Ara sınav
9 Transgenik gen ifade eden belirteç farelerin tasarımı ve kullanımı- Makale tartışması
10 Bileşik mutant alellerin koşullu ve dokuya özgü gen regülasyonunda kullanımı- Makale tartışması
11 Kanser hayvan modellerinde, transgenik mobil DNA nın in vivo mutasyon taramalarında kullanımı-Makale tartışması
12 CRISPR ile genom değiştirilmesinin çoklu alel ES hücrelerinin eldesinde kullanılması- Makale tartışması
13 İn vivo RNAi ekspresyonu ile genetiği değiştirilmiş hayvanların ilaç taramalarında kullanılması- Makale tartışması
14 Genetiği değiştirilmiş hayvan modelleri kullanan kuramsal bir projenin tartışılması- Literatür taraması
15 Genetiği değiştirilmiş hayvan modelleri kullanan kuramsal bir projenin tartışılması- Literatür taraması
16 Final sınavı

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Yardımcı kaynaklar:
Hofker and Van Deursen eds. `Transgenic mouse methods and protocols Methods in Mol. Biology series Human Press ISBN 978-1-60761-973-4
Referanslar:
Ödevler ve örnek çalışmalar için farklı araştırma makaleleri verilecektir.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Powerpoint ile ders sunumu: Ders konuları, şematize ve basitleştirilmiş slaytlarla görsel algılamayı kolaylaştırması açısından Powerpoint ile sunulacaktır.
Makale sunumu: Öğrencilere güncel moleküler genetik konu ve teknikler konusunda araştırma makaleleri dağıtılacaktır. Öğrenciler önemli noktaları kısa bir sunum ile anlatacaklar ve sınıf ile tartışacaklardır.
Ev ödevi: Öğrenciler, gen hedeflemesi teknikleri ve transgenik fare modelleri hakkında seçili bir konu üzerinde bir araştırma proje önerisi hazırlayacaklar ya da internet üzerinden tarama yaparak bir derleme makale yazacaklardır.

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL
1 ODV Ödev/Dkat.
2 VZ Vize
3 FN Final
4 BNS FinalSonuBaşarıNotu ODV * 0.30 + VZ * 0.30 + FN * 0.40
5 BUT Bütünleme
6 BBN BütSonuBasarıNotu ODV * 0.30 + VZ * 0.30 + BUT * 0.40


Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

kasim.diril@deu.edu.tr
26559

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 14 3 42
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 14 7 98
Vize Sınavına Hazırlık 1 25 25
Final Sınavına Hazırlık 1 30 30
Ödev Hazırlama 5 8 40
Ödev Hazırlama 2 8 16
Sunum Hazırlama 3 15 45
Final Sınavı 1 2 2
Vize Sınavı 1 2 2
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 300

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6PK.7PK.8
ÖK.13
ÖK.23
ÖK.32
ÖK.42
ÖK.52
ÖK.62
ÖK.72
ÖK.82
ÖK.92