DERS ADI

: Translasyonel Laboratuvar Yöntemlerine Giriş

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
TRO 5017 Translasyonel Laboratuvar Yöntemlerine Giriş SEÇMELİ 2 2 0 10

Dersi Veren Birim

Translasyonel Onkoloji Yüksek Lisans

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

DOÇ. DR. GİZEM ÇALIBAŞI KOÇAL

Dersi Alan Birimler

Translasyonel Onkoloji Yüksek Lisans
Dental Biyomalzemeler Yüksek Lisans
Translasyonel Onkoloji Bütünleşik Doktora

Dersin Amacı

Ders kapsamında Kanser Araştırma Laboratuvarları ve ARGE Laboratuarları Alt Yapısı, Kanser Araştırmalarında Örneklem, Faz çalışmalarında laboratuvarın yeri, Tanıya yönelik laboratuvar teknikleri, sağaltım yanıtlarını öngören laboratuvar teknikleri, Tümör modelleri (in vivo in vitro ex vivo, in silico, in toto) Kanser araştırmalarında biyobankalama; kanser araştırmalarında sağaltım teknolojileri anlatılacaktır.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Genel Laboratuvar kurallarını, çalışma yönergelerini bilir (bilgi) Temel laboratuvar analiz yöntemlerini uygular (kavrama)
2   Translasyonel Onkoloji alanındaki çalışmalarda gerekli örnek hazırlığını dökümante ederek uygular (sentez)
3   Analiz yöntemlerinin temel prensiplerini bilir (bilgi)
4   Temel PCR, Elektreoforez, Kanser hücre kültürü tekniklerini uygular (sentez)
5   Uyguladığı yöntemlerin sonuçlarını yorumlar (değerlendirme)
6   Translasyonel onkoloji araştırmalarının literatürde yer alan yöntemlerini anlar ve kendi uygulamalarına uyarlar(analiz)

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Kanser Araştırmalarında Örnek Hazırlığı
2 Tanıya yönelik laboratuvar teknikleri
3 PCR ve Yeni Nesil Sekanslama teknolojileri ile tümör genotipleme
4 Likit biyopsi, dolaşımdaki tümör belirteçleri ve tek hücre-düzeyinde analizler (Single cell analysis)
5 Transkript düzeyinde ekspresyon analizleri
6 Protein düzeyinde ekspresyon analizleri
7 Boyama ve görüntüleme teknikleri (immünophistokimya, immünfloresans)
8 İn vitro tümör modelleri
9 İlaç keşfi ve ilaç tarama çalışmaları
10 Ex vivo tümör modelleri- Organoidler
11 Mikroakışkan çip teknolojileri ve kanser modellerine entegrasyonu
12 In vivo tümör modelleri
13 In silico tümör modelleri
14 Faz çalışmalarında laboratuvarın yeri
15 Kanser araştırmalarında biyobankalama

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Russell W. Jenkins. Introduction to Ex Vivo Cancer Models. Pages 1-12. In Ex Vivo Engineering of the Tumor Microenvironment. Editor Amir R. Aref David Barbie.
Translational Oncology: An Introduction to Clinical Cancer Research. 2020 by Robert C Bast (Author), Dr Maurie Markman MD (Author), Ernest Hawk (Author).
Lee, M.W., Miljanic, M., Triplett, T. et al. Current methods in translational cancer research.Cancer Metastasis Rev (2020). https://doi.org/10.1007/s10555-020-09931-5
Targeted Therapy in Translational Cancer Research (Translational Oncology) 1st Edition
by Apostolia-Maria Tsimberidou, Razelle Kurzrock (Editor), Kenneth C. Anderson, Robert C. Bast Jr., Maurie Markman, Ernest Hawk
Molecular Biology of the Cell, 6th Edition. Ed. Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter. Garland Publishers
Essential Cell Biology - 4th Edition Bruce Alberts, Dennis Bray, Karen Hopkin, Alexander D Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter Garland Publishers
The Biology of Cancer, 2nd Edition, Robert A. Weinberg, Garland Publishers
Molecular Biology of the Gene, 7th edition, James Watson, Alexander Gann, Tania Baker, Michael Levine, Stephan Bell, Richard Losick, Stephan Harrison Pearson Cold Spring harbor Laboratory Press.
Principles of Molecular Diagnostics and Personalized Cancer Medicine, Dongfeng Tan, henry Lynch, Wolters Kluwer, Lippincott Williams&Wilkins.
The Handbook of Biomarkers, Kewal Jain, Humana Press
Translational and Experimental Clinical Research, Daniel Schuster, William Powers, Lippincott Williams&Wilkins.
Klinik Araştırmalar Kitabı 2014, Hamdi Akan, Hilal İlbars, Nurşah Çetinkaya, Bilimsel Tıp Yayınevi
Designing Clinical Research 4th Edition, Steven R Cummings , Warren S Browner , Deborah G Grady , Thomas B Newman , Dr Stephen B Hulley, Lippincott Williams&Wilkins.
Journals
Clinical & translational oncology (1699-048X) in Springer
Translational oncology (1944-7124) in PubMed

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Teorik ders anlatımı, konuların ders içi etkinliklerle (sunum ve ödevlerle) pekiştirilmesi ve tartışılması, laboratuvar uygulamaları ve uygulama ödevleri

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL
1 PO Performans/Ödev
2 FN Final
3 BNS Başarı PO * 0.40 +FN*0.60
4 BUT Bütünleme Notu
5 BBN Bütünleme Sonu Başarı Notu PO * 0.40 + BUT*0.60


Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Sınav değerlendirmesi ile öğrenme kazanımlarından ÖK1, ÖK2, ÖK3 ve ÖK4'ü açıkça tanımlayabilir.
Ödev, sunum hazırlayarak ve sınavla ÖK5 ve ÖK6'yı tanıyıp yorumlayabilir.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

gizem.calibasi@deu.edu.tr ; 0 232 412 58 35

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Pazartesi 13:00-14:00

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 15 4 60
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 15 13 195
Final Sınavı 1 1 1
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 256

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6PK.7PK.8PK.9
ÖK.155
ÖK.255
ÖK.355
ÖK.455
ÖK.555
ÖK.655