DERS ADI

: Translasyonel Araştırma Yöntemleri II

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
TRO 6010 Translasyonel Araştırma Yöntemleri II SEÇMELİ 1 2 0 10

Dersi Veren Birim

Translasyonel Onkoloji Doktora

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

PROF. DR. YASEMİN BAŞBINAR

Dersi Alan Birimler

Translasyonel Onkoloji Doktora
Translasyonel Onkoloji Bütünleşik Doktora

Dersin Amacı

Kanserde uygulamalı ve temel araştırmalar konusunda translasyonel bir bakış açısıyla (yataktan laboratuara, laboratuardan yatağa) , multidisipliner ileri araştırma yöntemlerini, öğrencilerin eğitim süresince aldıkları temel onkoloji bilgileriyle ilişkilendirilerek yorumlanmasını sağlamaktır. Prevantif Onkolojide kullanılan araştırma yöntemleri (Kanser açısından risk altındaki bireylerin tanımlanması, tarama programları ve testleri; çevresel karsinogenez, nutrigenomik, poplasyon genetiği gibi kavramlar), Klinik Onkolojide kullanılan araştırma yöntemleri (Tanıya yönelik laboratuvar teknikleri; tümör markerlar), Klinik Onkolojide kullanılan araştırma yöntemleri (sağaltım yanıtlarını öngören laboratuvar teknikleri, Tümör modelleri (invivo ( deney hayvanı) invitro (doku kültürü), exvivo modeller dışarıda işlemlerek yapılan uygulamalar) Kanser araştırmalarında biyobankalamaTemel onkolojide kullanılan araştırma yöntemleri (temel laboratuvar ilkeleri)Temel onkolojide kullanılan araştırma yöntemleri (temel teknikler)Kanser araştırmalarında hücre kültürü ve ilişkili yöntemler, Kanser araştırmalarında ileri moleküler yöntemler (Hibridizasyon, FISH, flow sitometri vb)Kanser araştırmalarında ileri moleküler yöntemler(genomik, proteomik, metabolamik, sistem biyolojisi)Kanser araştırmalarında ileri moleküler yöntemler (moleküler klonlama, DNA dizileme)Kanser araştırmalarında sağaltım teknolojileri (tedavi tekniklerine yönelik araştırmalar, rekombinant protein teknolojisi)Kanser araştırmalarında sağaltım teknolojileri(nanobiyoteknoloji, ilaç tasarımları,)Kanser araştırmalarında sağaltım teknolojileri(farmakogenomik çalışmalar,Kanser aşıları, hücresel modülasyonlar) Translasyonel Araştırma yöntemleri, anlatılacaktır.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   İleri kanser araştırmalarına yönelik moleküler epidemiyolojik yöntemlerini uygular.
2   Klinik Araştırma yöntemlerini bilir.
3   Kanser araştırmalarında uygulanan yöntemleri literatürden izler
4   Kanserin sağaltım teknolojilerini bilir.
5   Kanserin moleküler düzeyde tanımlanmasını sağlayan ileri yöntemleri bilir.
6   Kanser araştırmaları ile ilgili bir laboratuvar kurabilir.

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Kanser araştırma ve ARGE laboratuarları alt yapısı
2 Kanser araştırmalarına hücre ve makromolekül izolasyonu
3 Kanser araştırmalarında yeni nesil genetik analizler
4 Kanser araştırmalarında transkript ve protein düzeyinde ekspresyon analizleri
5 Kanser araştırmalarında ileri proteomik, metabolomik, sistem biyolojisine dayalı yöntemler
6 Kanser araştırmalarında ileri moleküler yöntemler (Hibridizasyon, FISH, flow sitometri vb)
7 Kanser araştırmalarında hücre kültürü teknikleri
8 Kanser araştırmalarında mikrofluidik teknikler
9 Kanser araştırmalarında deney hayvanı çalışmaları
10 Kanser araştırmalarında in silico teknikler
11 Kanser araştırmalarında biyobankalama
12 İlaç keşfi ve ilaç tarama çalışmaları
13 İlaç üretim teknolojileri
14 Faz 0, I, II, III ,IV ilaç araştırmaları
15 Translasyonel ve klinik araştırmaların tasarlanması

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Turner, J. Rick. New Drug Development. An Introduction to Clinical Trials: Second Edition. 2010. Springer
Poduri, Ramarao. Drug Discovery and Development: From Targets and Molecules to Medicines. 2021. Springer
Benjamin Blass. Basic Principles of Drug Discovery and Development. 1st Edition. 2015. Academic Press
Ahlbrandt J, Lablans M, Glocker K, Stahl-Toyota S, Maier-Hein K, Maier-Hein L, Ückert F. Modern Information Technology for Cancer Research: What's in IT for Me An Overview of Technologies and Approaches. Oncology. 2020;98(6):363-369. doi: 10.1159/000493638. Epub 2018 Nov 15. PMID: 30439700.
Molecular Biology of the Cell, 6th Edition. Ed. Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter. Garland Publishers
Essential Cell Biology - 4th Edition Bruce Alberts, Dennis Bray, Karen Hopkin, Alexander D Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter Garland Publishers
The Biology of Cancer, 2nd Edition, Robert A. Weinberg, Garland Publishers
Molecular Biology of the Gene, 7th edition, James Watson, Alexander Gann, Tania Baker, Michael Levine, Stephan Bell, Richard Losick, Stephan Harrison Pearson Cold Spring harbor Laboratory Press.
Principles of Molecular Diagnostics and Personalized Cancer Medicine, Dongfeng Tan, henry Lynch, Wolters Kluwer, Lippincott Williams&Wilkins.
The Handbook of Biomarkers, Kewal Jain, Humana Press
Translational and Experimental Clinical Research, Daniel Schuster, William Powers, Lippincott Williams&Wilkins.
Klinik Araştırmalar Kitabı 2014, Hamdi Akan, Hilal İlbars, Nurşah Çetinkaya, Bilimsel Tıp Yayınevi
Designing Clinical Research 4th Edition, Steven R Cummings , Warren S Browner , Deborah G Grady , Thomas B Newman , Dr Stephen B Hulley, Lippincott Williams&Wilkins.
Journals
Clinical & translational oncology (1699-048X) in Springer
Translational oncology (1944-7124) in PubMed

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Teorik ders anlatımı, konuların ders içi etkinliklerle (sunum ve ödevlerle) pekiştirilmesi ve tartışılması

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL
1 PO Performans/Ödev
2 FN Final
3 BNS Başarı PO * 0.40 +FN*0.60
4 BUT Bütünleme Notu
5 BBN Bütünleme Sonu Başarı Notu PO * 0.40 + BUT*0.60


Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

1-Sınav değerlendirmesi ile öğrenme kazanımlarından ÖK1, ÖK2, ÖK4ve ÖK5'i açıkça tanımlayabilir.
2-Ödev, sunum hazırlayarak ve sınavla ÖK3 ve ÖK6'yı tanıyıp, yorumlayabilir.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

gizem.calibasi@deu.edu.tr; 0 232 412 58 01

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Perşembe 11:00-12:00

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 15 3 45
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 15 13 195
Final Sınavı 1 1 1
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 241

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6PK.7PK.8PK.9PK.10PK.11PK.12
ÖK.1555
ÖK.2555
ÖK.3555
ÖK.4555
ÖK.5555
ÖK.6555