Dokuz Eylül Üniversitesi Ders Katoloğu / Bilgi Paketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Ders Türü	D	U	L	AKTS
MİK 5020	Klinik Mikrobiyoloji Laboratuvar Uygulamaları II	ZORUNLU	2	2	0	5

Dersi Veren Birim

Mikrobiyoloji Yüksek Lisans

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

Dersi Alan Birimler

Mikrobiyoloji Yüksek Lisans
Laboratuvar Tıbbı Yüksek Lisans

Dersin Amacı

Yüksek lisans öğrencilerinin Klinik Mikrobiyoloji Laboratuvar Uygulamaları I dersini takiben etken mikroorganizmaların mikolojik, virolojik, serolojik ve immunolojik tanımlanmaları için kullanılan temel laboratuar testlerini ve bu testlerin çalışma prensiplerini öğrenmeleri; kullanım alanlarını kavramaları ve bu testleri her etken mikroorganizma türünün tanımlanmasında kullanabilmeleri amaçlanmaktadır.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1	Mikolojik tanımlama için kullanılan temel laboratuar testlerinin çalışma prensiplerini kavrama
2	Virolojik ve serolojik tanımlama için kullanılan temel laboratuar testlerinin çalışma prensiplerini kavrama
3	İmmunolojik tanımlama için kullanılan temel laboratuar testlerinin çalışma prensiplerini kavrama
4	Laboratuvar testlerinin kullanım alanlarını kavrama
5	Laboratuar testlerini mikroorganizmalarla ilişkilendirebilme
6	Laboratuvar testlerinin benzer mantarların, virusların ve bazı bakterilerin birbirinden ayırtedilmesinde kullanılmasını kavrama
7	Laboratuvar testlerinin otoimmun hastalıkların ayırtedilmesinde kullanılmasını kavrama
8	Mantarların, virusların tanımlanmasında kullanılan testleri uygulayabilme
9	Testleri kullanarak bilinmeyen örnek mantar ve virusları tanımlayabilme

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta	Konular	Açıklama
1	Mikolojik örneklerde direkt bakı amacıyla kullanılan malzemelerin/boyaların hazırlanması, prensipleriyle uygulanması; Örneklerden primer izolasyon için kullanılan mikolojik besiyerlerinin hazırlanması
2	Örneklerden direkt bakı hazırlanması ve besiyerlerine ekilmesi; Kültür plaklarının değerlendirilmesi; Üreyen fungusların ileri identifikasyon işlemlerinin yapılması I (Laktafonel pamuk mavisi boyasının ve preparatının hazırlanması, maya ve küfler için lam kültürü yapılması)
3	Üreyen fungusların ileri identifikasyon işlemlerinin yapılması II (Lam kültürü sonuçlarının değerlendirilmesi), Mayaların kromojenik besiyerlerindeki görünümlerinin değerlendirilmesi
4	Zygomycetes (Absidia app, Mucor spp, Rhizopus spp) grubu küf mantarlarının lam kültürü sonuçlarına göre tanımlanması; Aspergillus türlerinin lam kültürü sonuçlarına göre tanımlanması; Dermatofitlerin (Trichophyton spp, Microsporum spp, Epidermophyton floccosum) lam kültürü sonuçlarına göre tanımlanması Üreaz testi , ısı testi, kıl delme deneyi
5	Örneklerde polimeraz zincir tepkimesi ile etken mantar nükleik asidinin aranması; Üretilen küf ve maya mantarlarının stoklanması ve stoktan üretilmesi uygulaması; Antifungal duyarlılık testi uygulaması ve sonuçlarının değerlendirilmesi
6	Serolojik test yöntemlerinin prensipleri, uygulanması ve sonuçların değerlendirilmesi:
7	Viral enfeksiyonların tanısında kullanılan yöntemler *Hücre kültürü
8	Mikroorganizma saplanmasında kullanılan immuno kimyasal yöntemlerin prensipleri:
9	Mikroorganizma saplanmasında kullanılan immuno kimyasal yöntemlerin prensipleri: *Doğrulama testleri; HIV ve HCV viruslarının tanısında doğrulama amaçlı kullanılan Western blot yöntemlerin prensipleri ve değerlendirilmesi.
10	Mikroorganizma saplanmasında kullanılan immuno kimyasal yöntemlerin prensipleri: *Moleküler tanı testleri; Hanta viruslarının tanısında kullanılan nükleik asit tabanlı testlerin prensipleri
11	SLE, RA, otoimmun karaciğer hastalıkları, Çölyak gibi otoimmun hastalıkların tanısında otoantikorların rolü ve önemi
12	Romatik hastalıkların tanısında otoantikorların rolü ve önemi

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Ana kaynaklar:-Larone DH. Medically Important Fungi. 5th edition. ASM Press, Washington DC, 2011.
-Manual of Clinical Microbiology(ASM Press) 2010 Versalovic J (editorin chief)
-Murray PR, Rosenthal KS, Pfaller MA. Medical Microbiology. Sixth Edition. Canada, Mosby Elsevier, 2009; 157-169.
-Koneman EW, Allen SD, Janda WM, Schreckenberger PC, Winn WC. Color Atlas and Textbook of Diagnostic Microbiology. Fifth Edition. Philadelphia, Lippincott-Raven, 1997; 1225-1260.
-Forbes BA, Sahm DF, Weissfeld AS. Bailey & Scott's Diagnostic Microbiology. Twelfth Edition. Philadelphia, Mosby Elsevier, 2007;718-776
Yardımcı kaynaklar: Dokuz Eylül Üniversitesi Merkez Mikoloji, Seroloji ve İmmunoloji Laboratuvarları Test Rehberleri

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Teorik ve uygulamalı derslerin yapılması, ara ve yarıyıl sınavı yapılması
Kuramsal dersler ve uygulamalar yanı sıra, öğrenciler Klinik Mikrobiyoloji laboratuarında gözlemci olarak uygulamaları görür.

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO	KISA KOD	UZUN ADI	FORMUL
1	VZ	Arasınav
2	ODV	Ödev
3	LAB	Lab/Uygulama
4	FN	Final
5	BNS	Başarı	VZ * 0.20 + ODV * 0.10 + LAB* 0.20 + FN*0.50
6	BUT	Bütünleme
7	BBN	BütSonuBaşarıNotu	VZ* 0.20 + ODV * 0.10 + LAB* 0.20 + BUT*0.50

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

KAVRAMA düzeyindeki öğrenme hedeflerine yönelik olarak final sınavında bilgi ölçen sorular sorulmaktadır. UYGULAMA ve ANALİZ için laboratuarda verilen mikroorganizmalar üzerinde doğru işlemleri yaparak tanımlamaları beklenmektedir. Ödev/ sunum da öğrenme çıktıları ile ilgili olacaktır.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

mine.doluca@deu.edu.tr, ozlem.yilmaz@deu.edu.tr
Tel: 24505-24506

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Salı-Perşembe 15:00-17:00

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler	Sayısı	Süresi (saat)	Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı	12	4	48
Uygulama	12	2	24
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar	12	2	24
Vize Sınavına Hazırlık	1	10	10
Sunum Hazırlama	1	4	4
Ödev Hazırlama	1	6	6
Final Sınavına Hazırlık	1	14	14
Vize Sınavı	1	3	3
Final Sınavı	1	3	3
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat)			136

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK	PK.1	PK.2	PK.3	PK.4	PK.6	PK.7	PK.8
ÖK.1	5			5		3
ÖK.2	5		3	5		3
ÖK.3	5		3	5		3
ÖK.4	5			5		3
ÖK.5	5	3		3	3	4	3
ÖK.6	5	3		3
ÖK.7	5			4
ÖK.8	5			5		3
ÖK.9	5			2		3

DERS ADI

DERECE PROGRAMLARI