Dokuz Eylül Üniversitesi Ders Katoloğu / Bilgi Paketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Ders Türü	D	U	L	AKTS
KIM 5114	Programlanmış Hücre Ölümü: Apoptosis	SEÇMELİ	3	0	0	8

Dersi Veren Birim

Fen Bilimleri Enstitüsü

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

PROF. DR. MUSTAFA YAVUZ ERGÜN

Dersi Alan Birimler

Biyokimya Yüksek Lisans
Kimya Doktora
Kimya Bütünleşik Doktora
Biyokimya Doktora

Dersin Amacı

Programlanmış Hücre Ölümü: Apoptosis dersi kapsamında; hücre proliferasyonu ve ölümünün anlaşılması, programlanmış hücre ölümü apoptosisin; indüksiyon faktörleri, kontrol yolakları, morfolojik ve biyokimyasal değişiklikler ve hastalıklarla ilişkisi açısından detaylı bir şekilde irdelenmesi, otofaji ve nekrozun yanı sıra diğer alternatif hücre ölümlerinin de tartışılması amaçlanmıştır.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1	Hücre proliferasyonu ve hücre ölümü konusunda bilgilidir.
2	Programlanmış hücre ölümü hakkında fikir üretebilir.
3	Apoptozis ve indüksiyon faktörleri, kontrol mekanizmaları ile apoptotik hücre ölümü sırasında gözlenen morfolojik-biyokimyasal değişiklikleri kavrayabilir.
4	Programlanmış hücre ölümlerinin farklarıyla ilgili fikir üretebilir.
5	Apoptotik hücre ölümünün karakterize edilmesinde kullanılan tekniklerle ilgili bilgi toplayabilir.

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta	Konular	Açıklama
1	Hücre Proliferasyonu ve Hücre Ölümüne Giriş 1.1. Ökaryotik hücre ve çekirdeğinin yapısı ve fonksiyonu 1.2. Hücre proliferasyonu ve ölümünde etkin mekanizmalar
2	Programlanmış Hücre Ölümü Apoptosis ve Regülasyonu 2.1. Apoptotik hücre ölümünü indükleyen çevresel faktörler 2.2. Apoptotik hücre ölümünde görülen karakteristik morfolojik değişimler 2.3. Apoptotik hücre ölümünde görülen karakteristik biyokimyasal değişimler 2.4. Apoptotik hücre ölümünde ekstrinsik yolak ve regülasyonu 2.5. Apoptotik hücre ölümünde intrinsik yolak ve regülasyonu
3	Apoptotik Hücre Ölümünde Kaspaz Ailesi 3.1. Kaspazların apoptosise katılımları 3.2. Kaspazların sınıflandırılması ve yapıları 3.3. Kaspazların aktivasyonları 3.4. Kaspazların inhibisyonları 3.5. Kaspazların substratları
4	Apoptosisin Bcl-2 familyası proteinleri tarafından regülasyonu 4.1. Bcl-2 geninin bulunması ve anti-apoptotik fonksiyonu 4.2. Bcl-2 familyası proteinleri ve biyokimyasal fonksiyonları 4.3. Bcl-2 familyası üyelerinin regülasyonu
5	Apoptotik Hücre Ölümünde Mitokondri 5.1.Hücre ölümüne mitokondriyal katkı 5.2. Sitokrom c 5.3. Mitokondriyal kaspazlar 5.4. Sıcaklık şoku proteinleri 5.5. Apoptosis indükleyici faktör 5.6. Endonükleaz G 5.7. SMAC/DIABLO 5.8. Mitokondriyal membran geçirgenliğinin artmasıyla meydana gelen bazı metabolik değişimler
6	Ölüm Reseptörleri Aracılı Apoptotik Hücre Ölümü 6.1.Ölüm reseptörleri süperfamilyası 6.2. TNF reseptör süperfamilyasının ligandları 6.3. Adaptör proteinler 6.4. Ölüm reseptörleri indüklü hücre ölümünün regülasyonu 6.5. Ölüm reseptörleri sinyal yolakları ilişkili hastalıklar
7	Apoptotik Hücre Ölümünde Sinyal İletimi 7.1. Apoptosiste Jnk, kalsiyum, wnt, NF-KB, Ras ve p53 sinyal iletim yolakları
8	Ara Sınav
9	Apoptotik Hücre Ölümünde MAPK lar
10	Apoptotik Hücre Ölümünde STAT lar
11	Otofajik ve Nekrotik Hücre Ölümü
12	Alternatif Programlanmış Hücre Ölümleri
13	Apoptotik Hücre Ölümünün Karakterize Edilmesinde Kullanılan Teknikler
14	Sunumlar

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Ana kaynak: Micheal D. Jacobson, Apoptosis: The Molecular Biology of Programmed Cell Death, Oxford University Press, 2002.
Yardımcı kaynaklar: Lawrance M. Schwartz, Apoptosis, Academic Press, 2001.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

1. Sunum
2. İnteraktif anlatım
3. Soru cevap tekniği
4. Ödev verme

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO	KISA KOD	UZUN ADI	FORMUL
1	ARS	ARASINAV (%30)
2	ODV	ÖDEV (%15)
3	DKT	DERSE KATILIM (%10)
4	YSS	YIL SONU SINAVI (%45)
5	YSBN	YIL SONU BAŞARI NOTU
6	BUT	BÜTÜNLEME
7	BUTBN	BÜTÜNLEME SONU BAŞARI NOTU

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Sunumlarda verilen temel kavramları anlamlı öğrenmesi, kavramların birbirleri ile ilişkilendirmesi, sebep-sonuç ilişkilerini kurulabilmesi ve soru veya problemlere yönelik mevcut bilgilerini kullanarak yorum yapabilmesi ve fikir üretiminin değerlendirilmesi ara sınav, final sınavı, bütünleme sınavı, ödevlerle gerçekleştirilecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

leman.tarhan@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Çarşamba 13.30 15.30

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler	Sayısı	Süresi (saat)	Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı	13	3	39
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar	13	3	39
Vize Sınavına Hazırlık	1	20	20
Final Sınavına Hazırlık	1	30	30
Ödev Hazırlama	2	15	30
Sunum Hazırlama	2	20	40
Final Sınavı	1	2	2
Vize Sınavı	1	2	2
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat)			202

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK	PK.1	PK.2	PK.3	PK.4	PK.5	PK.6	PK.7	PK.8	PK.9	PK.10	PK.11
ÖK.1	5	5	5	4	5	5	5	5	4	4	3
ÖK.2	5	5	5	4	5	5	4	5	4	4	3
ÖK.3	5	4	4	4	5	5	4	5	4	4	3
ÖK.4	5	5	5	4	5	5	4	5	4	4	3
ÖK.5	5	5	5	4	5	5	4	5	4	3	3

DERS ADI

DERECE PROGRAMLARI