DERS ADI

: Denizel Prokaryotların Genetiği

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
CDK 5042 Denizel Prokaryotların Genetiği SEÇMELİ 3 0 0 7

Dersi Veren Birim

Fen Bilimleri Enstitüsü

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

PROF. DR. ASLI KAÇAR

Dersi Alan Birimler

Canlı Deniz Kaynakları Doktora
Canlı Deniz Kaynakları Yüksek Lisans

Dersin Amacı

Dersin amacı, denizel prokaryotların genetik yapılarının ve bu genetik yapıların incelenmesinde kullanılan moleküler metotların araştırılması, ekstrem koşullarda yaşamalarını sağlayan mekanizmaların kavranması ve denizel ortamlardan elde edilen yeni gen kaynakları hakkında bilgi sahibi olunmasını sağlamaktır

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Denizlerdeki prokaryotik çeşitlilik hakkında genel bilgi edinmek
2   Genomu, prokaryotik kromozomu, plazmit ve plazmitlerin biyolojik önemini anlamak
3   Denizel prokaryotların genomunu araştırmada kullanılan moleküler metodları öğrenmek
4   Kompleks mikrobiyal toplulukların metagenomları konusunda bilgi sahibi olmak
5   Denizel ekstremofillerin genetiğini öğrenmek

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Denizel Prokaryotik Çeşitlilik; Kültüre Edilebilen ve Edilemeyen Bakteriler, Proteobakteriler, Siyanobakteriler...
2 Denizel Prokaryotik Çeşitlilik; Denizel Arkeler; Metanogenler, Ekstramofiller
3 Genom; Prokaryot Kromozomu, Operon Kavramı, Plazmit Çeşitleri ve Plazmitlerin Biyolojik Önemi
4 Denizel Mikrobiyal Kommunitelerde Horizontal Gen Transferi; Mutasyon, Transformasyon, Transdüksiyon
5 Denizel Prokaryotların Genomlarının Araştırılmasındaki Moleküler Yöntemler ; PCR, Agaroz Jel Elektroforezi, DGGE, FISH
6 Deniz Sedimentlerindeki Prokaryotik Çeşitliliğin Saptanması için Toplam DNA Analizi
7 Metagenom Kavramı; Kompleks Mikrobiyal Kommunitelerin Metagenomik Taranması, Yeni Genlerin Biyolojik Araştırılması
8 Makale Anlatımı
9 Bakteriyal Biyofilmlerin Genetiği; Denizlerde Bakteriyal Biyofilm Oluşumu, Quorum Sensing Mekanizması
10 Denizlerdeki Ağır Metal Dirençli Bakterilerin Genetiği; Biyoakümülasyon, Biyolojik Tutunma, Biyotransformasyon
11 Denizel Ekstramofillerin Genetiği ; Termofiller, Psikrofiller, Barofiller, Halofiller
12 Bakteriyel Biyolüminesens Genetiği ; Biyolüminesens Oluşumu, GFP ve Diğer Floresan Proteinler
13 Makale Anlatımı
14 Makale Anlatımı

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

1. Kirchman, L. D. 2008. Microbial Ecology of the Oceans. Second Edition. Wiley-blackwell. A John Wiley and Sons, Inc., Publication. New Jersey, USA, 593 s.
2. Madigan, T, M., Martinko, J. M., Parker, J. 2010. Brock Mikroorganizmaların Biyolojisi. Çeviri Editörü Cumhur Çökmüş. Palme Yayıncılık, Ankara, Turkey, 992s.
3. Klug, S. W., Cummings, M. R. 2003. Concepts of Genetics. 6th edition. Çeviri Editörü Cihan Öner. Palme Yayıncılık. Ankara, Turkey, 816s.
4. Marco, D. 2010. Metagenomics, Theory, Methods and Applications, Caister Academic Press, Norfolk, UK, 212s.
5-Sachse, K., Frey, J. Methods in Molecular Biology: PCR Detection of Microbial Pathogens, Vol:216. Humana Press Inc., Totowa, NJ, 321s.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Bu ders sınıfta sunum ve tartışma biçiminde öğretilir. Tüm sınıf öğrencileri hem derse devam etmek hem de tartışma oturumlarına katılmak zorundadır. Dersin öğretilmesi yanında grup sunumları belirlenir ve öğrenciler grup içinde tartışmalara katılırlar

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL
1 ARS ARASINAV
2 ODV ÖDEV
3 YSS YIL SONU SINAVI
4 YSBN YIL SONU BAŞARI NOTU ARS * 0.20 + ODV * 0.40 + YSS * 0.40
5 BUT BÜTÜNLEME
6 BUTBN BÜTÜNLEME SONU BAŞARI NOTU ARS * 0.20 + ODV * 0.40 + BUT * 0.40


Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Dersler, Ev Ödevleri (rapor hazırlama), Yayın Okuma, Ders Öncesi ve Sonrası Hazırlık, Ara Sınav ve Final Sınavı

Değerlendirme Kriteri

Ara sınav (%20), Ev Ödevi (rapor hazırlama) (%40), Final sınavı (%40)

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

Öğrenciler genel mikrobiyoloji dersi görmüş olmalıdır.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

Prof. Dr. Aslı KAÇAR
Deniz Bilimleri ve teknolojisi Enstitüsü
Tel: 0090 232 2785565/127
Email: asli.kacar@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Cuma: 14.30-16.00

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 14 3 42
Arasınava Hazırlanma 1 10 10
Final Sınavına Hazırlanma 1 20 20
Ders Öncesi/Sonrası Derse Hazırlanma 13 4 52
Yayın Tarama 5 3 15
Ödev Hazırlama (Rapor Hazırlama) 1 30 30
Arasınav 1 2 2
Final 1 2 2
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 173

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6
ÖK.12344
ÖK.24324
ÖK.322
ÖK.433
ÖK.53424