Dokuz Eylül Üniversitesi Ders Katoloğu / Bilgi Paketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Ders Türü	D	U	L	AKTS
CDK 5040	Denizel Mikrobiyoloji	SEÇMELİ	2	0	0	9

Dersi Veren Birim

Fen Bilimleri Enstitüsü

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

PROF. DR. ASLI KAÇAR

Dersi Alan Birimler

Canlı Deniz Kaynakları Doktora
Canlı Deniz Kaynakları Yüksek Lisans

Dersin Amacı

Denizlerdeki mikroorganizmalar biyosferin devamlılığı açısından gereklidir ve bizler halen okyanuslardaki mikroorganizmaların çeşililiği ve fonksiyonları hakkında kısıtlı bilgiye sahibizdir. Deniz mikrobiyolojisi çalışmaları, canlıların evrimi, denizdeki gıda ağının fonksiyonu, küresel iklim değişimi, okyanuslardaki biyoçeşitlilik ve kirleticilerin durumu gibi temel sorunları araştırmayı kapsamaktadır.

Amaç: Bu ders tüm denizel mikroorganizmaların yapısal, fizyolojik ve denizel çevrelerdeki davranışsal adaptasyonları gibi önemli yönleri ile ilgili değerlendirmeleri verecektir. Denizel mikroorganizmaların diğer mikroorganizmalar ve yüksek canlılar ile olan ilişkileri, denizel mikrobiyal ekoloji, denizlerdeki üretkenlikte mikroorganizmaların rolü ve denizel biyokütle ile biyoteknolojideki katkıları gibi önemli yönleri değerlendirilecektir

Dersin Öğrenme Kazanımları

1	Denizel mikroorganizmaların genel özelliklerini öğrenecek
2	Mikroorganizmaların birbirleriyle ve diğer organizmalarla arasındaki ilişkileri anlayacak
3	Anaerobik metabolizmayı anlayacak
4	Kirlilik indikatörü mikroorganizmalar ile ilgili standart ve düzenlemeleri öğrenecek

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta	Konular	Açıklama
1	Denizel çevrelerdeki mikroorganizmların çeşitliliği: Bakteriler ve siyanobakteriler, filamentli mantarlar, mayalar ve virüsler
2	Okyanus ekosistemlerinde başlıca biyotoplar. Pelajik ve bentik ekosistemler
3	Mikroorganizmaların fizyolojisi ve gelişimi üzerine çevresel faktörlerin etkisi: ışık, sıcaklık, basınç, bulanıklık, potansiyel redoks, tuzluluk, organik madde ve mineral maddeler
4	Denizel ekosistemdeki miroorganizmaların çalışılması için örnekleme stratejileri
5	Mikroorganizmalar ve diğer organizmalar arasındaki etkileşimler. Yararlı, zararlı ilişkiler
6	Makale Anlatımı
7	Organik madde üretimi. Ototrofik organizmaların primer üretimi.
8	Elementlerin çevrimlerindeki mikroorganizmalar. Karbon, azot, kükürt ve fosfor temel döngüleri. Döngüler arasındaki etkileşimler
9	Jeomikrobiyolojik süreçler: sedimentlerin formasyonu ve modifikasyonu; mineral depozitlerdeki mikroorganizmaların rolü
10	Kıyısal sularda ve kirletilmiş sularda mikrobiyal populasyon modifikasyonları. Atık suların deşarjı: etkisi ve düzenlemeler. Oksijen tüketimi, Hidrojen sülfür ve toksik bileşiklerin üretimi. Antimikrobiyaller ile kontrol. Ötrofikasyon
11	Anaerobik metabolizma: yolizleri ve fermentasyon
12	Derin deniz bakterileri: derin deniz çevreleri ve derin deniz bakterilerinin örneklenmesi
13	Kıyısal suların hijyenik kalitesinin araştırılması: Araştırma alanlarının belirlenmesi, plajların araştırılması.
14	Deniz ortamındaki indikatör ve patojen mikroorganizmalar ile ilgili yönetmelikler

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

-Kirchman, L. D. 2008. Microbial Ecology of the Oceans. Second Edition. Wiley-blackwell. A John Wiley and Sons, Inc., Publication. New Jersey, USA, 593 s.
- Madigan, T, M., Martinko, J. M., Parker, J. 2010. Brock Mikroorganizmaların Biyolojisi. Çeviri Editörü Cumhur Çökmüş. Palme Yayıncılık, Ankara, Turkey, 992s.
- The Handbook of Water and Wastewater Microbiology, 2003. Edited by Duncan Mara and Nigel Horan, Academic Press, London, Great Britain 819s.
- Bacteria in nature volume 1:1985. Edited by E R Leadbetter and J S Poindexter. Plenum Press, New York. pp263.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Bu ders; sınıfta sunum ve tartışma biçiminde öğretilir. Tüm sınıf öğrencileri hem derse
devam etmek hem de tartışma oturumlarına katılmak zorundadır. Dersin öğretilmesi
yanında grup sunumları belirlenir ve öğrenciler grup içinde tartışmalara katılır

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO	KISA KOD	UZUN ADI	FORMUL
1	ARS	ARASINAV
2	ODV	ÖDEV
3	YSS	YIL SONU SINAVI
4	YSBN	YIL SONU BAŞARI NOTU	ARS * 0.20 + ODV * 0.40 + YSS * 0.40
5	BUT	BÜTÜNLEME
6	BUTBN	BÜTÜNLEME SONU BAŞARI NOTU	ARS * 0.20 + ODV * 0.40 + BUT * 0.40

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Dersler, tartışma, takım/grup çalışması, laboratuvar çalışması

Değerlendirme Kriteri

Arasınav (%20), Ev ödevi( %40), Final sınavı (%40)

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

Öğrenciler genel mikrobiyoloji dersi görmüş olmalıdır. Derslere 75% devam zorunluluğu vardır

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

Prof. Dr. Aslı KAÇAR
Deniz Bilimleri ve Teknolojisi Enstitüsü
Tel: 00 90 232 278 55 65/127
e-mail : asli.kacar@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Pazartesi: 13:30- 16:00

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler	Sayısı	Süresi (saat)	Toplam İş Yükü (saat)
Ders anlatımı	14	2	28
Pratik yapma	2	4	8
Ara sınava hazırlanma	1	8	8
Final sınavına hazırlanma	1	2	2
Ödev hazırlama	2	10	20
Ders öncesi/sonrası derse hazırlanma	13	8	104
Yayın tarama	10	4	40
Arasınav	1	2	2
Finalsınavı	1	2	2
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat)			214

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK	PK.1	PK.2	PK.3	PK.4	PK.5	PK.6
ÖK.1	4	3	4	5	4	4
ÖK.2	5	4	4	4	4	4
ÖK.3	4	4	4	4	4	4
ÖK.4	4	4	4	4	4	4

DERS ADI

DERECE PROGRAMLARI