DERS ADI

: Evrimsel Hesaplama Yöntemleri

DERECE PROGRAMLARI

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
CSE 5002 Evrimsel Hesaplama Yöntemleri SEÇMELİ 3 0 0 9

Dersi Veren Birim

Fen Bilimleri Enstitüsü

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

DOÇ. DR. ZERRİN IŞIK

Dersi Alan Birimler

İleri Biyomedikal Teknolojiler Sanayi Ortak Doktora
İleri Biyomedikal Teknolojiler Sanayi Ortak Bütünleşik Doktora
Bilgisayar Mühendisliği Tezsiz Yüksek Lisans (İ.Ö) (İngilizce)
Bilgisayar Mühendisliği Tezsiz Yüksek Lisans (İngilizce)
Biyomedikal Teknolojiler Yüksek Lisans (İngilizce)
Bilgisayar Mühendisliği Bütünleşik Doktora (İngilizce)
Bilgisayar Mühendisliği Doktora (İngilizce)
Bilgisayar Mühendisliği Yüksek Lisans (İngilizce)

Dersin Amacı

Bu kurs biyolojik sistemlerin nasıl veri sakladıkları ve işledikleri konusunda öğrencilerin bilgi ve beceri kazanmalarını hedefler. Bu beceriler arasında Evrim ve onun ürünlerinin hesaplama biliminin temel kavramları ile ilişkilendirilmesi, biyolojik bazı süreçlerin tanımlananarak bu süreçlerden mühendislik ürünlerinin çıkarılması bulunmaktadır.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Hesaplama biliminin temeli olarak Evrim
2   Biyolojik sistemlerde bilgi akışı ve transferi
3   Biyolojik birim ve süreçler ile hesaplama kavramlarının karşılaştırılması
4   Biyolojik hesaplama modelleri
5   Biyolojik hesaplama kavramlarından algoritma ve sistemlerin tanımlanması

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Biyolojik kavramlar; Evrim, Hücre, DNA, RNA, Protein, Nöron
2 Biyoelektriğe giriş
3 Biyoelektrik potansiyel ve akım
4 Hücre ağları ve biyolojik bilgi akışı
5 Nöral ağlar ve Biyolojik bilgi işleme modelleri
6 Cochlear impalntosyonu, sesin biyolojik olarak işlenmesi
7 DNA ve Genetik
8 DNA temelli hesaplama
9 Hesaplama teorisi
10 Moleküler (kimyasal) bilgisayarlar
11 Makina öğrenmesi ve biyolojik öğrenme
12 Beyin : Biyolojik hesaplamanın temeli
13 Beyin : Fonksiyonel alanlar, Biyolojik Bilgisayarlar (ex-vivo)
14 Proje Sunumları
15 Proje Sunumları

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Yardımcı Kitaplar:
Lamm Ehud, Unger Ron., Biological Computation, Chapman and Hall, 2011.
Plonsey, Robert., Barr Roger C. Bioelectricity A Quantitative Approach, Kluwer
Publications, 2000.
Pevsner, Jonathan. Bioinformatics and Functional Genetics, Wiley-Liss, 2003.
Amos, Martyn. Theoretical and Experimental DNA Computation, Springer-Verlag, 2005.
Koza, John R. Genetic Programming: On the Programming of Computers by Means of Natural
Selection, The MIT Press, 1992.
Goldberg, David. Genetic Algorithms in Search, Optimization and Machine Learning,
Addison-Wesley, 1989.
Diğer: Lecture Notes,problem sets.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Teorik dersler, problem kümeleri, evde bağımsız çalışmalar ve projeler

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL
1 PRJ PROJE
2 YSBN YIL SONU BAŞARI NOTU PRJ * 1


Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

İlan Edilecektir.

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlk derste duyurulacaktır.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 15 3 45
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 15 6 90
Proje Hazırlama 1 30 30
Ödev Hazırlama 4 4 16
Kitap Okuma 3 7 21
Final Sınavı 1 2 2
Vize Sınavı 2 2 4
Diğer Kısa Sınav 3 3 9
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 217

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6PK.7PK.8PK.9PK.10PK.11
ÖK.134555
ÖK.233555
ÖK.345555
ÖK.445555
ÖK.545555

İLETİŞİM BİLGİLERİMİZ
Dokuz Eylül Üniversitesi Cumhuriyet Bulvarı No: 144 35210 Alsancak / İZMİR
Telefon: +90(232) 412 12 12 - Faks: +90 (232) 464 81 35

Copyright 2015 DEÜ. BİD

ANASAYFA / ÜNİVERSİTE HAKKINDA / DERECE PROGRAMLARI / ÖĞRENCİ İÇİN GENEL BİLGİLER / ULUSLARARASI İLİŞKİLER