DERS ADI

: Mikrobiyom ve Kanser

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
TRO 6012 Mikrobiyom ve Kanser SEÇMELİ 1 0 0 3

Dersi Veren Birim

Translasyonel Onkoloji Doktora

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

DOÇ. DR. GİZEM ÇALIBAŞI KOÇAL

Dersi Alan Birimler

Translasyonel Onkoloji Doktora
Translasyonel Onkoloji Bütünleşik Doktora

Dersin Amacı

İnsan vücudunda yaşayan mikroplar- insan mikrobiyomu - kanserin başlaması, ilerlemesi ve kanser immünoterapisi dahil olmak üzere tedaviye yanıtı etkileyebilir. Mikrobiyomun kanser üzerindeki etki mekanizmaları yeni teşhisler ve tedavi seçenekleri açıısndan avantaj sağlayabilir, ancak pek çok şey bu açıdan bilinmemektedir. Çünkü mikroplar arasındaki etkileşimler, diyet, konakçı faktörler, ilaçlar ve kanserin kendi içindeki hücre-hücre etkileşimleri arasındaki etkileşimler oldukça karmaşık olduğundan tüm davranışını açıklayamaz.Ancak yeni nesil dizileme teknolojisinin gelişmesi, mikrobiyomların kapsamlı bir şekilde araştırılmasına izin vererek mikrobiyom ve kanser arasındaki taksonomik ve metabolomik ilişkilerin gözlemlenmesini sağlamıştır. Bu çalışmalar tanımlayıcı olmalarının yanı sıra, aynı zamanda hem tümör mikrobiyomunun hem de tümörden ayrılmış diğer konakçı nişlere ait mikrobiyomun etki ettiği biyolojik süreçere ait mekanizmaların ortaya konulmasına yardım etmektedir. Bu ilişkilerin ortaya konulması sonucu yeni terapötik hedef olabilecek biyobelirteç adaylarının ortaya çıkmasıyla, bu amaç için kanser hastalarının mikrobiyom bileşimini değiştiren tedavilere yönelik denemeler araştırılmaya başlanmıştır.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Mikrobiyom, disbiyozis, metagenomiks gibi temel kavramları bilir.
2   Farklı organların mikrobiyotası ve bunların kanser oluşumu ve ilerlemesine olan katkısı hakkında fikir sahibi olur.
3   Diyetin ve diyet ilişkili metabolitlerin mikrobiyotaya etkisini bilir.
4   Mikrobiyomun kanserin temel süreçlerine nasıl ettiğini bilir
5   Mikrobiyomun etki ettiği veya mikrobiyom modülasyonu temelli kanser tedavileri hakkında fikir sahibi olur
6   Mikrobiyom analizleri hakkında fikir sahibi olur.

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Mikrobiyom, mikrobiyota, kanser mikrobiyomu
2 Disbiyozisin kanser gelişmesi ve ilerlemesindeki etkisi
3 Metagenomiks
4 Organ mikrobiyotası: Gastrointestinal kanserler
5 Organ mikrobiyotası: Jinekolojik ve Genitoüriner Sistem Kanserleri
6 Organ mikrobiyotası: Akciğer kanseri
7 Organ mikrobiyotası: Deri kanserler
8 Mikrobiyota kaynaklı metabolitler ve kanser
9 Diyetin mikrobiyoma etkisi ve kanser
10 Mikroçevrenin mikrobiyoma etkisi ve kanser
11 Mikrobiyom ve metastaz
12 Mikrobiyom ve Kanser Tedavisi: Mikrobiyomun modüle edilmesi
13 Mikrobiyom ve Kanser Tedavisi: Mikrobiyom ve kanser immünoterapi
14 Mikrobiyom ve Kanser Tedavisi: Farmakomikrobiyomiks (kemoterapötik-mikrobiyota etkileşimi)
15 Laboratuvarda mikrobiyom analizleri

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Microbiome and Cancer. 2019. Springer. Editors: Robertson, Erle S.
The Molecular Biology and Translational Medicine. The Microbiome in Health and Disease, Volume 171, 1st Edition. ISBN: 9780128200001. Editor: Jun Sun. 2020. Academic Press.
The Human Microbiota and Chronic Disease: Dysbiosis as a Cause of Human Pathology. Editor(s): Luigi Nibali, Brian Henderson. 2016. Wiley. ISBN:9781118982877
Fulbright LE, Ellermann M, Arthur JC. The microbiome and the hallmarks of cancer. PLoS Pathog. 2017 Sep 21;13(9):e1006480. doi: 10.1371/journal.ppat.1006480. PMID: 28934351; PMCID: PMC5608396.
Intestinal Microbiota in Health and Disease Modern Concepts. Edited By Eduardo J. Schiffrin, Philippe Marteau, Dominique Brassart. ISBN 9781482226768. 2014. CRC Press.
Wong, S.H., Yu, J. Gut microbiota in colorectal cancer: mechanisms of action and clinical applications. Nat Rev Gastroenterol Hepatol 16, 690 704 (2019).
Krautkramer, K.A., Fan, J. & Bäckhed, F. Gut microbial metabolites as multi-kingdom intermediates. Nat Rev Microbiol (2020).
Roy, S., Trinchieri, G. Microbiota: a key orchestrator of cancer therapy. Nat Rev Cancer17, 271 285 (2017)
aniewski, P., Ilhan, Z.E. & Herbst-Kralovetz, M.M. The microbiome and gynaecological cancer development, prevention and therapy. Nat Rev Urol 17, 232 250 (2020).
Liu, NN., Ma, Q., Ge, Y. et al. Microbiome dysbiosis in lung cancer: from composition to therapy. npj Precis. Onc. 4, 33 (2020).
Tran, L., Xiao, JF., Agarwal, N. et al. Advances in bladder cancer biology and therapy. Nat Rev Cancer (2020).

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Teorik ders anlatımı, konuların ders içi etkinliklerle (sunum ve ödevlerle) pekiştirilmesi ve tartışılması

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL
1 PO Performans/Ödev
2 FN Final
3 BNS Başarı PO * 0.40 +FN*0.60
4 BUT Bütünleme Notu
5 BBN Bütünleme Sonu Başarı Notu PO * 0.40 + BUT*0.60


Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Öğrenme kazanımlarından ÖK1 ve ÖK2 ara sınav ile değerlendirilecektir.
Öğrenme kazanımlarından ÖK3,ÖK4, ÖK5 ve ÖK6 ödev ve sunum hazırlayarak değerlendirilecektir.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

gizem.calibasi@deu.edu.tr ; 0 232 412 58 35

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Perşembe 14:00-15:00

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 15 1 15
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 15 4 60
Final Sınavı 1 1 1
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 76

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6PK.7PK.8PK.9PK.10PK.11PK.12
ÖK.155
ÖK.255
ÖK.355
ÖK.455
ÖK.555
ÖK.655