En

DOÇ.DR. GÖKHAN KARAKÜLAH İZMİR ULUSLARARASI BİYOTIP VE GENOM ENSTİTÜSÜ GENOM BİLİMLERİ VE MOLEKÜLER BİYOTEKNOLOJİ ANABİLİM DALI

  • Eğitim / Akademik Bilgisi
    Lisans  Ege Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümü  2005
    Yüksek Lisans  Dokuz Eylül Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Medikal İnformatik (Tıbbi Bilişim) Anabilim Dalı  2009
    Doktora  Dokuz Eylül Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Biyomühendislik Doktora Programı  2014
    Yardımcı Doçent  Dokuz Eylül Üniversitesi İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü  2016
    Doçent  Üniversiletlerarası Kurul Başkanlığı Biyoloji  2018
  • NO AD YIL
    1  TAp73? is Upregulated in the Most Common Human Cancers...  2022
    2  Evaluation of ATAD2 as a Potential Target in Hepatocellular Carcinoma...  2021
    3  In Silico Methods for the Identification of Diagnostic and Favorable Prognostic Markers in Acute Mye...  2021
    4  Mining Natural Products with Anticancer Biological Activity through a Systems Biology Approach...  2021
    5  Different selection dynamics of S and RdRp between SARS-CoV-2 genomes with and without the dominant ...  2021
    6  Investigating Molecular Determinants of Cancer Cell Resistance to Ionizing Radiation Through an Inte...  2021
    7  Current mutatome of SARS-CoV-2 in Turkey reveals mutations of interest....  2021
    8  TAp73ß Can Promote Hepatocellular Carcinoma Dedifferentiation...  2021
    9  Signature changes in the expressions of protein-coding genes, lncRNAs, and repeat elements in early ...  2020
    10  Analysis of open chromatin regions in bladder cancer links ß-catenin mutations and Wnt signaling wit...  2020
    11  Differential expression of full length and N-terminally truncated FAM134B isoforms in normal physiol...  2020
    12  Mutations of SARS-CoV-2 nsp14 exhibit strong association with increased genome-wide mutation load...  2020
    13  Mutation density changes in SARS-CoV-2 are related to the pandemic stage but to a lesser extent in t...  2020
    14  RdRp mutations are associated with SARS-CoV-2 genome evolution...  2020
    15  TEffectR: an R package for studying the potential effects of transposable elements on gene expressio...  2019
    16  Dysregulated expression of repetitive DNA in ER+/HER2- breast cancer...  2019
    17  Expression dynamics of repetitive DNA in early human embryonic development...  2019
    18  C-Reactive Protein and Platelet-Lymphocyte Ratio as Potential Tumor Markers in Low-Alpha-Fetoprotein...  2018
    19  RTFAdb: A database of computationally predicted associations between retrotransposons and transcript...  2018
    20  In silico Phylogenetic Analysis of hAT Transposable Elements in Plants...  2018
    21  PlanTEnrichment: A tool for enrichment analysis of transposable elements in plants...  2017
    22  Regulation of noncoding transcriptome in developing photoreceptors by rod differentiation factor NRL...  2017
    23  Discovery and Annotation of Plant Endogenous Target Mimicry Sequences from Public Transcriptome Libr...  2017
    24  İnsanda Uzun Kodlanmayan RNA?ların Doku İfade Örüntüleri ve Varsayımsal İşlevlerinin Benzeşme Yayılm...  2017
    25  MicroRNA exocytosis by large dense-core vesicle fusion...  2017
    26  Differential expression of hyperhydricity responsive peach microRNAs...  2016
    27  NRL-regulated transcriptome dynamics of developing rod photoreceptors...  2016
    28  Next generation sequencing technology and genomewide data analysis: Perspectives for retinal researc...  2016
    29  sandflyDST: a dynamic web?based decision support tool for the morphological identification of sandfl...  2016
    30  PeTMbase: A Database of Plant Endogenous Target Mimics (eTMs)...  2016
    31  StatXFinder: a web-based self-directed tool that provides appropriate statistical test selection for...  2015
    32  CorRECTreatment: a web-based decision support tool for rectal cancer treatment that uses the analyti...  2015
    33  Early Biventricular Molecular Responses to an Acute Myocardial Infarction...  2012
    34  Genome-Wide Gene Expression Analysis of NIH 3T3 Cell Line Under Mechanical Stimulation...  2011
    35  mESAdb: microRNA Expression and Sequence Analysis Database...  2011
  • NO AD TARİH
    1  Küçük Hücreli Dışı Akciğer Kanserinde Genetik Olmayan Osimertinib Direnç Mekanizmalarının... 28/10/2021 - 31/10/2021
    2  Modulation of macrophage polarization by TNF-related apoptosis-inducing ligand... 01/09/2021 - 04/09/2021
    3  Identification of Essential Genes in Malignant Pleural Mesothelioma Using Genome-Wide CRISPR/Cas9-Ba... 28/01/2021 - 31/01/2021
    4  İnsan makrofaj polarizasyonunda yeni bir modülatör... 20/11/2020 - 22/11/2020
    5  Mezenkimal Epitelyal Dönüşüm Sürecini Düzenleyen Transkripsyon Faktörlerinin Epigenetik Yenid... 15/11/2019 - 16/11/2019
    6  TAP73?ÜN HEPATOSELÜLER KARSINOMADA PROTÜMÖROJENİK ROLÜ ... 14/11/2019 - 17/11/2019
    7  Mezenkimal Epitelyal Dönüşüm Sürecinde Epigenetik Yeniden Programlamayı Etkileyen Transkripsiy... 14/11/2019 - 17/11/2019
    8  Hepatoselüler karsinomda TGF-ß yanıtının hücresel mekanizmalarının araştırılması... 14/11/2019 - 17/11/2019
    9  Mezenkimal Epitelyal Dönüşüm Sürecinin Epigenetik Altyapısını Düzenleyen Transkripsiyon Fak... 08/11/2019 - 10/11/2019
    10  TAp73'ün hepatoselüler karsinomada tümör teşvik edici rolü... 27/10/2019 - 30/10/2019
    11  Robust Gene Co-Expression Network Analysis... 18/10/2019 - 20/10/2019
    12  Hepatoselüler Karsinom'da TGF-beta Direncinin Hücresel Mekanizmalarının Araştırılması... 21/02/2019 - 23/02/2019
    13  Investigation of the Cellular Mechanisms of TGF-beta-induced Senescence-Resistance in Hepatocellular... 05/09/2018 - 08/09/2018
    14  Differential Network Analysis on Mouse Brain Parts Using Plsr... 28/04/2018 - 30/04/2018
    15  Gene Co-Expression Network Analysis with Partial Least Squares Regression... 09/11/2017 - 11/11/2017
    16  DSRCT: Rektum Kanseri Tedavisinde Karar Desteği... 27/10/2013 - 30/10/2013
    17  A Data-driven Living Review for Pharmacogenomic Decision Support in Cancer Treatment... 26/08/2012 - 29/08/2012
    18  Lityum aracılıklı Wnt-bcatenin aktivasyonunun karaciğer kanserinde kök hücre fenotipine etkisi... 27/10/2011 - 30/10/2011
    19  Genome-wide expression analysis of lithium induced cell cycle arrest in hepatocellular carsinoma cel... 20/01/2008 - 22/01/2008
    20  Sağlık Alanındaki Internet Sitelerinin Değerlendirilmesi İçin Bir Rehber Önerisi... 15/11/2007 - 18/11/2007
    21  Tıp Bilişimi Eğitimine Katkı Veren 10 Önde Gelen Internet Sitesinin Kalite Değerlendirmesi... 04/05/2007 - 05/05/2007
    22  Sağlık Alanındaki Internet Sitelerinin Değerlendirilmesi İçin Bir Rehber Önerisi... 04/05/2007 - 05/05/2007
    23  MicroRNA sequence and expression database... 16/04/2007 - 19/04/2007
    24  hasGO: A Gene Ontology Based Web Tool for Functional Analysis and Biological Interpretation of Gene ... 16/04/2007 - 19/04/2007
    25  MicroRNA sequence and expression database... 11/01/2007 - 13/07/2007
  • NO AD TARIH
    1  Gen Düzenleyici Rolleri Olan Transpozonların Tahminlenmesine Yönelik Bir Biyoinformatik Araç Geliştirilmesi Ve Mezenkimal Epitelyal Dönüşüm Sürecinde Yer Alan Transpozonların Belirlenmesi...  9/2021 - 9/2023
    2  Mezenkimal Epitelyal Dönüşümün Epigenetiği...  3/2021 - /
    3  Mezenkimal Epitelyal Dönüşüm Sürecinde Kritik Olan Uzun Kodlamayan RNA'ların İşlevsel Analizleri...  7/2020 - /
    4  Alzheimer Hastalığının Tanısında ve Yayılımında Nöron Kökenli Ekzozomlar...  6/2018 - /
    5  Kan Dolaşımındaki Tümör Dna Ve Rna'sının Yüksek Hassasiyetli Analizi Yöntemini Kullanarak, Akciğer Kanseri Tanı Ve Tedavi Izlemi Için Yeni Biyo Belirteçlerin Karakterizasyonu...  6/2018 - /
    6  TRAIL'in Primer İnsan Makrofajlarının M1, M2a ve M2c Polarizasyonuna Etkisi...  11/2018 - /
    7  Gliom Oluşumunda Rol Oynayan Kalıcı Epigenomik Değişimlerin IDH1-TERT-MYC Ekseninde Karakterizasyonu...  6/2018 - /
    8  "Sendromik Olmayan" Otizm Spektrum Bozukluğu Tanılı İkisi de Etkilenmiş İkiz Çocuk ve Ergenlerin ve Anne Babalarının Genomlarının Tüm Genom Dizileme Yöntemi İle Analizi...  1/2017 - 1/2018
    9  Mezenkimal Epitelyal Dönüşüm (MET) Sürecinde Epigenetik Yeniden Programlamayı Etkileyen Transkripsiyon Faktörlerinin Belirlenmesi...  10/2017 - 6/2021
    10  Mavi Gen...  9/2014 - 9/2017
  • NO Görev
    1 İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Anabilim Dalı Başkanı, Mart 2019-Devam ediyor
    2 İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü Enstitü Kurulu Üyesi, Mart 2019-Devam ediyor